ARNlnc
Los ARN largos no codificantes (lncRNA) son ARN de más de 200 nucleótidos con bajo potencial codificante, pero con funciones reguladoras críticas. La línea de trabajo de lncRNA de BMKCloud está diseñada para analizar bibliotecas de ARNr depletadas con un genoma de referencia de alta calidad y bien anotado, mediante el análisis conjunto de la expresión de lncRNA y ARNm. Tras el recorte de lecturas y el control de calidad, las lecturas se alinean con el genoma de referencia para ensamblar transcripciones, y el posterior análisis de la estructura génica revela splicing alternativo y genes nuevos. Las transcripciones se identifican como ARNm o lncRNA, y el análisis de expresión diferencial identifica lncRNA expresados diferencialmente, sus dianas y genes expresados diferencialmente (DEGS). Tanto los DEG como las dianas de lncRNA expresados diferencialmente se anotan funcionalmente para encontrar categorías funcionales enriquecidas.
Bioinformática
