ARN no codificante largo
Los ARN largos no codificantes (lncRNA) son ARN de más de 200 nucleótidos con bajo potencial codificante, pero con funciones reguladoras cruciales. La plataforma BMKCloud lncRNA está diseñada para analizar bibliotecas con ARN ribosómico reducido, utilizando un genoma de referencia de alta calidad y bien anotado, mediante el análisis conjunto de la expresión de lncRNA y ARNm. Tras el recorte y el control de calidad de las lecturas, estas se alinean con el genoma de referencia para ensamblar los transcritos, y el análisis posterior de la estructura génica revela el empalme alternativo y genes novedosos. Los transcritos se identifican como ARNm o lncRNA, y el análisis de expresión diferencial identifica los lncRNA con expresión diferencial, sus dianas y los genes con expresión diferencial (DEG). Tanto los DEG como las dianas de lncRNA con expresión diferencial se anotan funcionalmente para identificar categorías funcionales enriquecidas.
Bioinformática
