Secuenciación larga sin codificación-Illumina
Ventajas del servicio
●Análisis conjunto de ARNm y lncRNA.: al combinar la cuantificación de transcripciones de ARNm con el estudio de lncRNA y sus objetivos, es posible obtener una descripción detallada del mecanismo regulador subyacente a la respuesta celular.
●Amplia experiencia: Nuestro equipo aporta una gran experiencia a cada proyecto, con un historial de procesamiento de más de 23 000 muestras en BMK que abarcan diversos tipos de muestras y proyectos de lncRNA.
●Control de calidad riguroso: Implementamos puntos de control centrales en todas las etapas, desde la preparación de muestras y bibliotecas hasta la secuenciación y la bioinformática. Este seguimiento meticuloso garantiza la entrega de resultados consistentes de alta calidad.
●Soporte postventa: Nuestro compromiso se extiende más allá de la finalización del proyecto con un período de servicio postventa de 3 meses. Durante este tiempo, ofrecemos seguimiento del proyecto, asistencia para la resolución de problemas y sesiones de preguntas y respuestas para abordar cualquier consulta relacionada con los resultados.
Requisitos de muestra y entrega
| Biblioteca | Plataforma | Datos recomendados | Control de calidad de datos |
| biblioteca direccional agotada de ARNr | Iluminación PE150 | 10-16 GB | Q30≥85% |
Nucleótidos:
| Conc.(ng/μl) | Cantidad (μg) | Pureza | Integridad |
| ≥ 80 | ≥ 0,8 | DO260/280=1,7-2,5 DO260/230=0,5-2,5 En el gel se muestra contaminación limitada o nula de proteínas o ADN. | RIN≥6,0; 5,0≥28S/18S≥1,0; elevación basal limitada o nula |
● Plantas:
Raíz, Tallo o Pétalo: 450 mg
Hoja o Semilla: 300 mg
Fruta: 1,2 gramos
● Animales:
Corazón o Intestino: 450 mg
Vísceras o Cerebro: 240 mg
Músculo: 600 mg
Huesos, Cabello o Piel: 1,5g
● Artrópodos:
Insectos: 9g
Crustáceos: 450 mg
● Sangre entera:2 tubos
● Células: 106 células
● Suero y Plasma: 6ml
Entrega de muestra recomendada
Envase: tubo de centrífuga de 2 ml (no se recomienda papel de aluminio)
Etiquetado de muestras: Grupo+réplica, por ejemplo, A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Envío:
1. Hielo seco: las muestras deben empaquetarse en bolsas y enterrarse en hielo seco.
2. Tubos RNAstable: las muestras de ARN se pueden secar en un tubo de estabilización de ARN (por ejemplo, RNAstable®) y enviarse a temperatura ambiente.
Flujo de trabajo del servicio
Diseño de experimentos
Entrega de muestra
extracción de ARN
construcción de biblioteca
Secuenciación
Análisis de datos
Servicios postventa
Bioinformática
Análisis de expresión genética diferencial (DEG)
Cuantificación de la expresión de lncRNA – agrupación
Enriquecimiento de genes diana de lncRNA
Análisis de posición conjunta de ARNm y ARNnc: diagrama de Circos (el círculo central es ARNm y el círculo interno es ARNnc)
Explore los avances facilitados por los servicios de secuenciación de lncRNA de BMKGene a través de una colección seleccionada de publicaciones.
Ji, H. y col. (2020) 'Identificación, predicción funcional y verificación clave de lncRNA de lncRNA relacionados con el estrés por frío en hígado de ratas', Scientific Reports 2020 10:1, 10(1), págs. doi: 10.1038/s41598-020-57451-7.
Jia, Z. y col. (2021) 'El análisis transcriptómico integrativo revela el mecanismo inmunológico de una cepa de carpa común resistente al CyHV-3', Frontiers in Immunology, 12, p. 687151. doi: 10.3389/FIMMU.2021.687151/BIBTEX.
Wang, XJ y cols. (2022) 'Priorización basada en la integración multiómica de redes de regulación de ARN endógeno en competencia en el cáncer de pulmón de células pequeñas: características moleculares y fármacos candidatos', Fronteras en oncología, 12, p. 904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
Xiao, L. y col. (2020) 'Disección genética de la red de coexpresión genética subyacente a la fotosíntesis en Populus', Plant Biotechnology Journal, 18 (4), págs. doi: 10.1111/PBI.13270.
Zheng, H. y col. (2022) 'Una red reguladora global para la expresión genética desregulada y la señalización metabólica anormal en células inmunes en el microambiente de la enfermedad de Graves y la tiroiditis de Hashimoto', Frontiers in Immunology, 13, p. 879824. doi: 10.3389/FIMMU.2022.879824/BIBTEX.
