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Secuenciación Metagenómica -NGS
Metagenoma se refiere a una colección de material genético total de una comunidad mixta de organismos, como el metagenoma ambiental, el metagenoma humano, etc. Contiene genomas de microorganismos tanto cultivables como no cultivables.La secuenciación metagenómica es una herramienta molecular utilizada para analizar los materiales genómicos mixtos extraídos de muestras ambientales, que proporciona información detallada sobre la diversidad y abundancia de especies, estructura poblacional, relación filogenética, genes funcionales y red de correlación con factores ambientales.
Plataforma:Plataforma Illumina NovaSeq
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Secuenciación metagenómica-Nanopore
La metagenómica es una herramienta molecular utilizada para analizar los materiales genómicos mixtos extraídos de muestras ambientales, que proporciona información detallada sobre la diversidad y abundancia de especies, estructura poblacional, relación filogenética, genes funcionales y red de correlación con factores ambientales, etc. Recientemente se han introducido plataformas de secuenciación de nanoporos. a los estudios metagenómicos.Su excelente rendimiento en longitud de lectura mejoró en gran medida el análisis metagenómico posterior, especialmente el ensamblaje del metagenoma.Aprovechando las ventajas de la longitud de lectura, el estudio metagenómico basado en nanoporos puede lograr un ensamblaje más continuo en comparación con la metagenómica de escopeta.Se ha publicado que la metagenómica basada en nanoporos generó con éxito genomas bacterianos completos y cerrados a partir de microbiomas (Moss, EL, et. al,Biotecnología de la naturaleza, 2020)
Plataforma:Nanoporo PromethION P48
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Secuenciación de amplicones 16S/18S/ITS-PacBio
La subunidad del ARNr 16S y 18S que contiene regiones altamente conservadas e hipervariables es una huella molecular perfecta para la identificación de organismos procarióticos y eucariotas.Aprovechando la secuenciación, estos amplicones pueden dirigirse en función de las partes conservadas y las regiones hipervariables pueden caracterizarse completamente para la identificación microbiana, contribuyendo a estudios que cubren análisis de diversidad microbiana, taxonomía, filogenia, etc. ) la secuenciación de la plataforma PacBio permite la obtención de lecturas largas de alta precisión, que podrían cubrir amplicones de longitud completa (aproximadamente 1,5 Kb).La visión más amplia del campo genético mejoró enormemente la resolución en la anotación de especies en la comunidad de bacterias u hongos.
Plataforma:PacBio Secuela II
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Secuenciación de amplicones 16S/18S/ITS-NGS
La secuenciación de amplicones 16S/18S/ITS tiene como objetivo revelar la filogenia, la taxonomía y la abundancia de especies en una comunidad microbiana mediante la investigación de productos de PCR de marcadores genéticos internos que contienen partes altamente conversadas e hipervariables.La introducción de estas huellas dactilares moleculares perfectas por Woeses et al, (1977) permite la elaboración de perfiles de microbiomas sin aislamiento.La secuenciación de 16S (bacterias), 18S (hongos) y espaciador transcrito interno (ITS, hongos) permite la identificación tanto de especies abundantes como de especies raras y no identificadas.Esta tecnología se ha convertido en una herramienta importante y ampliamente aplicada para identificar la composición microbiana diferencial en diversos entornos, como la boca humana, los intestinos, las heces, etc.
Plataforma:Plataforma Illumina NovaSeq
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Resecuenciación del genoma completo de bacterias y hongos
La resecuenciación del genoma completo de bacterias y hongos es una herramienta fundamental para completar los genomas de bacterias y hongos conocidos, así como para comparar múltiples genomas o mapear genomas de nuevos organismos.Es de gran importancia secuenciar genomas completos de bacterias y hongos para generar genomas de referencia precisos, realizar identificación microbiana y otros estudios genómicos comparativos.
Plataforma:Plataforma Illumina NovaSeq
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Secuenciación del metatranscriptoma
La secuenciación de metatranscriptomas identifica la expresión genética de microbios (tanto eucariotas como procariotas) dentro de entornos naturales (es decir, suelo, agua, mar, heces e intestino). Específicamente, este servicio le permite obtener perfiles completos de expresión genética de comunidades microbianas complejas y análisis taxonómicos. de especies, análisis de enriquecimiento funcional de genes expresados de manera diferente y más.
Plataforma: Plataforma Illumina NovaSeq
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Genoma fúngico
Las tecnologías de biomarcadores proporcionan un estudio del genoma, el genoma fino y el genoma completo del pene de los hongos, según el objetivo de investigación específico.La secuenciación, el ensamblaje y la anotación funcional del genoma se pueden lograr combinando la secuenciación de próxima generación + la secuenciación de tercera generación para lograr un ensamblaje del genoma de alto nivel.La tecnología Hi-C también se puede emplear para facilitar el ensamblaje del genoma a nivel cromosómico.
Plataforma:PacBio Secuela II
Nanoporo PromethION P48
Plataforma Illumina NovaSeq
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Genoma completo de bacterias
Biomarker Technologies brinda servicio de secuenciación para la construcción del genoma completo de bacterias sin brechas.El flujo de trabajo principal de la construcción del genoma completo de bacterias incluye secuenciación de tercera generación, ensamblaje, anotación funcional y análisis bioinformático avanzado que cumplen objetivos de investigación específicos.Un perfil más completo del genoma de las bacterias permite revelar los mecanismos fundamentales que subyacen a sus procesos biológicos, lo que también podría proporcionar una referencia valiosa para las investigaciones genómicas en especies de eucariotas superiores.
Plataforma:Plataforma Nanopore PromethION P48 + Illumina NovaSeq
PacBio Secuela II
