-
PacBio-Full-length Transcriptome (Tsy misy Reference)
Ny sehatra Amplicon (16S/18S/ITS) dia novolavolaina niaraka tamin'ny traikefa an-taonany tamin'ny famakafakana tetikasa isan-karazany mikraoba, izay mirakitra fanadihadiana fototra manara-penitra sy famakafakana manokana: ny famakafakana fototra dia mirakitra ny votoatin'ny fanadihadiana mahazatra amin'ny fikarohana mikraoba ankehitriny, ny votoatin'ny fanadihadiana dia manankarena sy feno, ary ny valin'ny fanadihadiana dia aseho amin'ny endrika tatitry ny tetikasa;Ny votoatin'ny famakafakana manokana dia isan-karazany.Santionany dia azo voafantina sy masontsivana azo apetraka flexibly araka ny fanadihadiana fototra tatitra sy ny fikarohana tanjona, mba hahatakatra ny fepetra manokana.Windows rafitra fandidiana, tsotra sy haingana.
-
PacBio-Full-length Transcriptome (Tsy misy Reference)
Maka ny angon-drakitra fizotry ny Isoform Pacific (PacBio) ho fampidirana, ity App ity dia afaka mamantatra ny filaharan'ny transcript feno (tsy misy fivoriambe).Amin'ny alalan'ny fanaovana sari-tany ny filaharana feno amin'ny fototarazo reference, ny transcript dia azo amboarina amin'ny alalan'ny fototarazo fantatra, transcript, faritra coding, sns. Amin'ity tranga ity, dia azo atao ny mamantatra tsara kokoa ny rafitry ny mRNA, toy ny fifandimbiasana hafa, sns.Ny famakafakana iombonana miaraka amin'ny angon-drakitra fisehon'ny transcriptome NGS dia ahafahan'ny fanamarihana feno kokoa sy ny fanombanana marina kokoa amin'ny fitenenana amin'ny haavon'ny transcript, izay mahasoa indrindra amin'ny fanehoan-kevitra sy ny famakafakana asa.
-
fitaovam
Ny BMKCloud dia sehatra bioinformatic malaza manome vahaolana tokana ho an'ny programa génomika, izay atokisan'ny mpikaroka amin'ny sehatra isan-karazany ao anatin'izany ny fitsaboana, ny fambolena, ny tontolo iainana, sns. , loharanon-karena informatika, angon-drakitra ho an'ny daholobe, fampianarana an-tserasera bioinformtic, sns. Ny BMKCloud dia manana fitaovana bioinformatika isan-karazany ampiasaina matetika ao anatin'izany ny fanoritsoritana ny fototarazo, ny fitaovana génétika evolisiona, ny ncRNA, ny fanaraha-maso ny kalitaon'ny angona, ny fivoriam-be, ny fampifanarahana, ny fitrandrahana data, ny fiovan'ny toetr'andro, ny statistika, ny famoronana tarehimarika, ny filaharana famakafakana, sns.
-
RNA kely
Ny RNA kely dia karazana RNA tsy misy kaody fohy miaraka amin'ny halavan'ny salan'isa 18-30 nt, ao anatin'izany ny miRNA, siRNA ary piRNA.Ireo RNA kely ireo dia voalaza fa mandray anjara amin'ny dingana biolojika isan-karazany toy ny fahasimban'ny mRNA, ny fandikana ny fandikana, ny fananganana heterochromatin, sns. sehatra famakafakana sequencing dia ahitana ny fanadihadiana manara-penitra sy ny fitrandrahana angon-drakitra mandroso.Amin'ny fototry ny angon-drakitra RNA-seq, ny famakafakana mahazatra dia afaka mahatratra ny famantarana sy ny faminaniana miRNA, ny faminavinan'ny fototarazo kendrena miRNA, ny fanamarihana ary ny famakafakana ny fomba fiteny.Ny famakafakana mandroso dia mamela ny fikarohana sy ny fitrandrahana miRNA namboarina, ny famoronana diagrama Venn, ny miRNA ary ny fananganana tambajotran'ny fototarazo kendrena.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
NGS-WGS dia sehatra famakafakana famerimberenan'ny genome manontolo, izay novolavolaina tamin'ny traikefa manankarena amin'ny Biomarker Technologies.Ity sehatra mora ampiasaina ity dia mamela ny fandefasana haingana ny rindranasan'ny famakafakana mitambatra amin'ny alàlan'ny fametrahana mari-pamantarana fototra vitsivitsy, izay mifanaraka amin'ny angon-drakitra momba ny filaharana ADN navoaka avy amin'ny sehatra Illumina sy ny sehatra filaharana BGI.Ity sehatra ity dia apetraka amin'ny mpizara informatika avo lenta, izay manome hery ny famakafakana angon-drakitra tena mahomby ao anatin'ny fotoana voafetra.Ny fitrandrahana angon-drakitra manokana dia azo alaina amin'ny alàlan'ny famakafakana mahazatra, ao anatin'izany ny fangatahana fototarazo mutated, famolavolana PCR primer, sns.
-
mRNA(Reference)
Ny transcriptome dia ny rohy misy ny fampahalalana génétique génomique sy ny proteome amin'ny fiasa biolojika.Ny fandrindrana ny haavon'ny transcriptional no fomba fiasa manan-danja indrindra sy be mpitia indrindra amin'ny zavamananaina.Ny filaharan'ny transcriptome dia afaka mandrindra ny transcriptome amin'ny fotoana rehetra na amin'ny toe-javatra rehetra, miaraka amin'ny vahaolana marina amin'ny nucleotide tokana. santionany fandikana manokana.
Amin'izao fotoana izao, ny teknolojia sequencing transcriptome dia nampiasaina betsaka amin'ny agronomie, fitsaboana ary sehatra fikarohana hafa, ao anatin'izany ny lalàna momba ny fivoaran'ny biby sy ny zavamaniry, ny fampifanarahana ny tontolo iainana, ny fifandraisana amin'ny immune, ny localization ny fototarazo, ny fivoaran'ny fototarazo sy ny fivontosana ary ny fitiliana ny aretina.
-
Metagenomics (NGS)
Ity sehatra famakafakana ity dia natao ho an'ny famakafakana angon-drakitra metagenomika amin'ny fototry ny traikefa an-taonany.Izy io dia ahitana workflow mitambatra ahitana famakafakana metagenomika isan-karazany ilaina indrindra ao anatin'izany ny fanodinana angon-drakitra, fandalinana ambaratonga karazana, fandalinana ambaratongan'ny fototarazo, metagenome binning, sns. , fametrahana paramètre, famoronana tarehimarika manokana, sns.
-
LncRNA
Ny RNA tsy misy kaody lava (lncRNA) dia karazana transcript manana halavany mihoatra ny 200 nt, izay tsy afaka mandika proteinina.Ny porofo miangona dia milaza fa ny ankamaroan'ny lncRNAs dia tena azo ampiasaina.Ny teknôlôjian'ny sequence avo lenta sy ny fitaovana famakafakana bioinformatic dia manome hery antsika hanambara ny filaharan'ny lncRNA sy ny fampahafantarana toerana amin'ny fomba mahomby kokoa ary mitarika antsika hahita lncRNA manana andraikitra manan-danja mifehy.BMKCloud dia mirehareha amin'ny fanomezana ny mpanjifanay lncRNA sequencing sehatra famakafakana mba hanatratrarana haingana, azo ianteherana ary malefaka lncRNA fanadihadiana.
-
GWAS
Ny fandalinana ny fikambanan'ny Genome-wide (GWAS) dia mikendry ny hamantatra ireo karazana fototarazo (genotype) izay mifandray amin'ny toetra manokana (phenotype).Ny fandalinana GWA dia manadihady ireo mari-pamantarana fototarazo mamakivaky fototarazo iray manontolo amin'ny olona marobe ary maminavina ny fikambanan'ny genotype-phenotype amin'ny alàlan'ny famakafakana statistika amin'ny haavon'ny mponina.Ny resequencing génome manontolo dia mety hahita ny variana fototarazo rehetra.Miaraka amin'ny angona phenotypic, ny GWAS dia azo karakaraina mba hamantarana ireo SNP mifandraika amin'ny phenotype, QTL ary fototarazo kandida, izay manohana mafy ny fiompiana biby/zavamaniry maoderina.Ny SLAF dia paikady fandrindrana génome novolavolaina, izay mahita marika miparitaka manerana ny genome, SNP.Ireo SNP ireo, amin'ny maha-marika fototarazo molekiola, dia azo karakaraina ho an'ny fianarana fikambanana miaraka amin'ny toetra kendrena.Paikady lafo vidy amin'ny famantarana ireo toetra sarotra mifandray amin'ny fiovaovan'ny fototarazo.
-
Nanopore transcriptomika feno
Ny isoforme saro-pady sy miovaova amin'ny zavamananaina dia mekanika fototarazo manan-danja amin'ny fifehezana ny fanehoana ny fototarazo sy ny fahasamihafan'ny proteinina.Ny famantarana marina ny firafitry ny transcript no fototry ny fandalinana lalina ny lamina mifehy ny fanehoana ny fototarazo.Ny sehatra sequencing Nanopore dia nahomby tamin'ny fandalinana transcriptomic ho amin'ny isoform-level.Ity sehatra famakafakana ity dia natao hamakafaka ny angon-drakitra RNA-Seq novokarina tamin'ny sehatra Nanopore amin'ny fototry ny génome reference, izay mahatratra ny famakafakana qualitative sy quantitative amin'ny haavon'ny fototarazo sy ny transcripts.
