-
Tar-sgrìobhadh Làn-fhaid PacBio (Gun iomradh)
Tha àrd-ùrlar Amplicon (16S / 18S / ITS) air a leasachadh le bliadhnaichean de eòlas ann am mion-sgrùdadh pròiseact iomadachd microbial, anns a bheil mion-sgrùdadh bunaiteach àbhaisteach agus mion-sgrùdadh pearsanaichte: tha mion-sgrùdadh bunaiteach a’ còmhdach susbaint mion-sgrùdadh prìomh-shruthach de sgrùdadh microbial gnàthach, tha susbaint an anailis beairteach agus farsaing, agus tha toraidhean anailis air an taisbeanadh ann an cruth aithisgean pròiseict;Tha susbaint mion-sgrùdadh pearsanaichte eadar-dhealaichte.Faodar sampaill a thaghadh agus faodar paramadairean a shuidheachadh gu sùbailte a rèir an aithisg sgrùdaidh bunaiteach agus adhbhar an sgrùdaidh, gus riatanasan pearsanaichte a thoirt gu buil.Siostam-obrachaidh Windows, sìmplidh agus luath.
-
Tar-sgrìobhadh Làn-fhaid PacBio (Gun iomradh)
A’ gabhail dàta seicheamhan Isoform Pacific Biosciences (PacBio) mar chur-a-steach, is urrainn don App seo sreathan tar-sgrìobhaidh làn-fhad aithneachadh (às aonais co-chruinneachadh).Le bhith a’ mapadh sreathan làn-fhaid an aghaidh genoma iomraidh, faodar tar-sgrìobhaidhean a bharrachadh le ginean aithnichte, tar-sgrìobhaidhean, roinnean còdaidh, msaa. Anns a’ chùis seo, faodar comharrachadh nas cinntiche de structaran mRNA, leithid splicing eile, msaa.Tha co-sgrùdadh le dàta sreathaidh tar-sgrìobhaidh NGS a’ comasachadh comharrachadh nas coileanta agus tomhas nas cruinne ann an faireachdainn aig ìre tar-sgrìobhaidh, a tha gu ìre mhòr na bhuannachd do mhìneachadh eadar-dhealaichte sìos an abhainn agus mion-sgrùdadh gnìomh.
-
Innealan-ciùil
Tha BMKCloud na phrìomh àrd-ùrlar bith-fiosrachaidh a bheir seachad fuasgladh aon-stad airson prògraman genomic, anns a bheil earbsa farsaing aig luchd-rannsachaidh ann an grunn raointean a’ toirt a-steach eòlas-leighis, àiteachais, àrainneachd, msaa. , goireasan coimpiutaireachd, stòr-dàta poblach, cùrsaichean bith-fiosrachaidh air-loidhne, msaa. Tha grunn innealan bith-fiosrachaidh air an cleachdadh gu tric aig BMKCloud a’ toirt a-steach comharrachadh gine, innealan ginteil mean-fhàs, ncRNA, smachd càileachd dàta, co-chruinneachadh, co-thaobhadh, às-tharraing dàta, mùthaidhean, staitistig, gineadair figear, sreath mion-sgrùdadh, msaa.
-
RNA beag
Tha RNAn beaga mar sheòrsa de RNA goirid neo-chòdachadh le fad cuibheasach de 18-30 nt, a’ toirt a-steach miRNA, siRNA agus piRNA.Thathas air aithris gu bheil na RNAn beaga sin an sàs gu mòr ann an grunn phròiseasan bith-eòlasach leithid truailleadh mRNA, casg air eadar-theangachadh, cruthachadh heterochromatin, msaa. Tha àrd-ùrlar anailis sreathachaidh a’ toirt a-steach mion-sgrùdadh àbhaisteach agus mèinneadh dàta adhartach.Air bunait dàta RNA-seq, faodaidh mion-sgrùdadh àbhaisteach comharrachadh agus ro-innse miRNA a choileanadh, ro-innse gine targaid miRNA, mion-sgrùdadh notaichean agus faireachdainn.Tha mion-sgrùdadh adhartach a’ comasachadh sgrùdadh agus às-tharraing miRNA gnàthaichte, gineadh diagram Venn, miRNA agus togail lìonra gine targaid.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
Tha NGS-WGS na àrd-ùrlar anailis ath-sheicheamh genome slàn, a tha air a leasachadh air bunait eòlas beairteach ann am Biomarker Technologies.Tha an àrd-ùrlar seo a tha furasta a chleachdadh a’ ceadachadh sruth-obrach anailis aonaichte a chuir a-steach gu sgiobalta le bhith dìreach a’ suidheachadh beagan paramadair bunaiteach, a tha iomchaidh airson dàta sreath DNA a chaidh a chruthachadh bho gach cuid àrd-ùrlar Illumina agus àrd-ùrlar sreath BGI.Tha an àrd-ùrlar seo air a chleachdadh air frithealaiche coimpiutaireachd àrd-choileanadh, a bheir cumhachd do mhion-sgrùdadh dàta fìor èifeachdach ann an ùine glè bheag.Tha mèinneadh dàta pearsanaichte ri fhaighinn air bunait mion-sgrùdadh àbhaisteach, a’ toirt a-steach ceist gine mutated, dealbhadh primer PCR, msaa.
-
mRNA (iomradh)
Is e Transcriptome an ceangal eadar fiosrachadh ginteil genomic agus proteome gnìomh bith-eòlasach.Is e riaghladh ìre tar-sgrìobhaidh am modh riaghlaidh fàs-bheairtean as cudromaiche agus as fharsainge.Faodaidh seicheamh tar-sgrìobhaidh an tar-sgrìobhadh a leantainn aig àm sam bith no fo chumha sam bith, le rùn neo-mhearachdach gu aon nucleotide. sampall ath-sgrìobhaidhean sònraichte.
Aig an àm seo, tha teicneòlas seicheamh tar-sgrìobhaidh air a chleachdadh gu farsaing ann an agronomy, leigheas agus raointean rannsachaidh eile, a’ toirt a-steach riaghladh leasachadh bheathaichean is phlanntaichean, atharrachadh àrainneachd, eadar-obrachadh dìonachd, sgìreachadh gine, mean-fhàs ginteil gnè agus lorg tumhair is galair ginteil.
-
Metagenomics (NGS)
Tha an àrd-ùrlar anailis seo air a dhealbhadh airson mion-sgrùdadh dàta metagenomic gunna-gunna air bunait bliadhnaichean de eòlas.Tha e a’ toirt a-steach sruth-obrach amalaichte anns a bheil grunn de mhion-sgrùdaidhean metagenomics a dh’ fheumar gu cumanta, a’ gabhail a-steach giullachd dàta, sgrùdaidhean ìre gnè, sgrùdaidhean ìre gnìomh gine, binneachadh metagenome, msaa. , suidheachadh paramadair, gineadh figear pearsanaichte, msaa.
-
LncRNA
Is e seòrsa de ath-sgrìobhaidhean le faid nas fhaide na 200 nt a th’ ann an RNAn neo-chòdachadh fada (lncRNA), nach urrainn pròtainean a chòdachadh.Tha fianais tionalach a’ nochdadh gu bheil a’ mhòr-chuid de lncRNAn glè choltach a bhith obrachail.Tha teicneòlasan seicheamh àrd-threabhadh agus innealan sgrùdaidh bith-fiosrachaidh a’ toirt cumhachd dhuinn sreathan lncRNA agus fiosrachadh suidheachaidh fhoillseachadh nas èifeachdaiche agus ar stiùireadh gu lorg lncRNAn le gnìomhan riaghlaidh deatamach.Tha BMKCloud moiteil àrd-ùrlar mion-sgrùdadh sreath lncRNA a thoirt don luchd-ceannach againn gus mion-sgrùdadh lncRNA luath, earbsach agus sùbailte a choileanadh.
-
GWAS
Tha sgrùdadh comann air feadh genome (GWAS) ag amas air caochlaidhean ginteil (genotype) a chomharrachadh a tha co-cheangailte ri feartan sònraichte (phenotype).Bidh sgrùdaidhean GWA a’ sgrùdadh comharran ginteil a ’dol thairis air genoma iomlan de àireamh mhòr de dhaoine fa-leth agus a’ ro-innse comainn genotype-phenotype le mion-sgrùdadh staitistigeil aig ìre sluaigh.Is dòcha gum faigh ath-leanmhainn làn-genome a h-uile caochladh ginteil a-mach.A’ ceangal ri dàta phenotypic, faodar GWAS a ghiullachd gus SNPn co-cheangailte ri phenotype, QTLs agus ginean tagraiche a chomharrachadh, a tha gu làidir a’ toirt taic do ghintinn bheathaichean/lusan an latha an-diugh.Tha SLAF na ro-innleachd seicheamh genome nas sìmplidhe fèin-leasaichte, a tha a’ lorg comharran sgaoilte air feadh genome, SNP.Faodar na SNPn sin, mar chomharran ginteil moileciuil, a phròiseasadh airson sgrùdaidhean co-cheangail le comharran cuimsichte.Is e ro-innleachd cosg-èifeachdach a th’ ann ann a bhith a’ comharrachadh atharrachaidhean ginteil co-cheangailte ri feartan iom-fhillte.
-
Ath-sgrìobhaidhean làn-ùine Nanopore
Tha isoforman iom-fhillte agus caochlaideach eile ann am fàs-bheairtean nan dòighean ginteil cudromach airson a bhith a’ riaghladh faireachdainn gine agus iomadachd pròtain.Tha comharrachadh ceart de structaran tar-sgrìobhaidh mar bhunait airson sgrùdadh domhainn air pàtrain riaghlaidh faireachdainn gine.Tha àrd-ùrlar sreathachaidh Nanopore air sgrùdadh tar-sgrìobhaidh a thoirt gu ìre isoform gu soirbheachail.Tha an àrd-ùrlar anailis seo air a dhealbhadh gus mion-sgrùdadh a dhèanamh air dàta RNA-Seq a chaidh a chruthachadh air àrd-ùrlar Nanopore air bunait genoma iomraidh, a choileanas mion-sgrùdaidhean càileachdail is cainneachdail an dà chuid aig ìre gine agus ìre tar-sgrìobhaidhean.
