-
Полноразмерный транскриптом PacBio (не эталонный)
Платформа Amplicon (16S/18S/ITS) разработана с учетом многолетнего опыта в области анализа проектов микробного разнообразия, которая содержит стандартизированный базовый анализ и персонализированный анализ: базовый анализ охватывает основное содержание анализа текущих микробных исследований, содержание анализа богато и всесторонне, а результаты анализа представляются в виде отчетов по проекту;Содержание персонализированного анализа разнообразно.Образцы могут быть выбраны, а параметры могут быть гибко установлены в соответствии с отчетом об основном анализе и целью исследования, чтобы реализовать индивидуальные требования.Операционная система Windows, простая и быстрая.
-
Полноразмерный транскриптом PacBio (не эталонный)
Используя данные секвенирования изоформ Pacific Biosciences (PacBio) в качестве входных данных, это приложение способно идентифицировать полноразмерные последовательности транскриптов (без сборки).Путем сопоставления полноразмерных последовательностей с эталонным геномом транскрипты могут быть оптимизированы по известным генам, транскриптам, кодирующим областям и т. д. В этом случае может быть достигнута более точная идентификация структур мРНК, таких как альтернативный сплайсинг и т. д.Совместный анализ с данными секвенирования транскриптома NGS обеспечивает более полную аннотацию и более точную количественную оценку экспрессии на уровне транскрипта, что в значительной степени способствует дифференциальной экспрессии и функциональному анализу ниже по течению.
-
Наборы инструментов
BMKCloud — это ведущая биоинформатическая платформа, предоставляющая комплексное решение для геномных программ, которому широко доверяют исследователи в различных областях, включая медицину, сельское хозяйство, экологию и т. д. BMKCloud стремится предоставлять интегрированные, надежные и эффективные услуги, включая платформы и инструменты биоинформатического анализа. , вычислительные ресурсы, общедоступная база данных, биоинформационные онлайн-курсы и т. д. BMKCloud имеет различные часто используемые биоинформационные инструменты, включая аннотацию генов, эволюционные генетические инструменты, нкРНК, контроль качества данных, сборку, выравнивание, извлечение данных, мутации, статистику, генератор фигур, последовательность анализ и т.д.
-
малая РНК
Малые РНК представляют собой тип коротких некодирующих РНК со средней длиной 18–30 нуклеотидов, включая миРНК, миРНК и пиРНК.Сообщалось, что эти малые РНК участвуют в различных биологических процессах, таких как деградация мРНК, ингибирование трансляции, образование гетерохроматина и т. д. Анализ последовательности малых РНК широко применялся в исследованиях развития животных/растений, болезней, вирусов и т. д. Малые РНК Платформа секвенирующего анализа состоит из стандартного анализа и расширенного интеллектуального анализа данных.На основе данных секвенирования РНК стандартный анализ может обеспечить идентификацию и предсказание миРНК, предсказание целевого гена миРНК, аннотирование и анализ экспрессии.Расширенный анализ позволяет настраивать поиск и извлечение миРНК, генерировать диаграммы Венна, строить миРНК и сеть целевых генов.
-
NGS-WGS (Иллюмина/БГИ)
NGS-WGS — это платформа для анализа ресеквенирования всего генома, разработанная на основе богатого опыта в области биомаркерных технологий.Эта простая в использовании платформа позволяет быстро представить интегрированный рабочий процесс анализа, просто установив несколько основных параметров, которые подходят для данных секвенирования ДНК, полученных как на платформе Illumina, так и на платформе секвенирования BGI.Эта платформа развернута на высокопроизводительном вычислительном сервере, что позволяет проводить высокоэффективный анализ данных за очень ограниченное время.Доступен персонализированный анализ данных на основе стандартного анализа, включая запрос мутировавшего гена, дизайн праймера для ПЦР и т. д.
-
мРНК (ссылка)
Транскриптом является связующим звеном между геномной генетической информацией и протеомом биологической функции.Регуляция уровня транскрипции является наиболее важным и наиболее широко изученным способом регуляции организмов.Секвенирование транскриптома может секвенировать транскриптом в любой момент времени или при любых условиях с точностью до одного нуклеотида. Оно может динамически отражать уровень транскрипции генов, одновременно идентифицировать и количественно определять редкие и нормальные транскрипты и предоставлять структурную информацию образцы конкретных расшифровок.
В настоящее время технология секвенирования транскриптома широко используется в агрономии, медицине и других областях исследований, включая регулирование развития животных и растений, адаптацию к окружающей среде, иммунное взаимодействие, локализацию генов, генетическую эволюцию видов и обнаружение опухолей и генетических заболеваний.
-
Метагеномика (NGS)
Эта аналитическая платформа предназначена для анализа метагеномных данных дробовика на основе многолетнего опыта.Он состоит из интегрированного рабочего процесса, содержащего различные часто необходимые метагеномные анализы, включая обработку данных, исследования на уровне видов, исследования на уровне функций генов, объединение метагеномов и т. д. Кроме того, в стандартном рабочем процессе анализа доступны настраиваемые инструменты интеллектуального анализа данных, включая запросы генов и видов. , настройка параметров, создание персонализированной фигуры и т. д.
-
днРНК
Длинные некодирующие РНК (днРНК) представляют собой тип транскриптов длиной более 200 нуклеотидов, которые не способны кодировать белки.Накопленные данные свидетельствуют о том, что большая часть lncRNAs, скорее всего, функциональна.Технологии высокопроизводительного секвенирования и инструменты биоинформатического анализа позволяют нам более эффективно выявлять последовательности днРНК и информацию о позиционировании и позволяют нам обнаруживать днРНК с важными регуляторными функциями.BMKCloud гордится тем, что предоставляет нашим клиентам платформу для секвенирования днРНК для проведения быстрого, надежного и гибкого анализа днРНК.
-
GWAS
Полногеномное ассоциативное исследование (GWAS) направлено на выявление генетических вариантов (генотипов), связанных с определенными признаками (фенотипами).Исследования GWA исследуют генетические маркеры, пересекающие весь геном большого количества людей, и предсказывают ассоциации генотип-фенотип с помощью статистического анализа на уровне популяции.Полногеномное ресеквенирование потенциально может обнаружить все генетические варианты.В сочетании с фенотипическими данными GWAS может быть обработан для идентификации SNP, QTL и генов-кандидатов, связанных с фенотипом, что сильно поддерживает современную селекцию животных и растений.SLAF — это разработанная нами упрощенная стратегия секвенирования генома, которая обнаруживает распределенные по всему геному маркеры, SNP.Эти SNP, как молекулярно-генетические маркеры, могут быть обработаны для изучения ассоциации с целевыми признаками.Это экономически эффективная стратегия выявления сложных признаков, связанных с генетическими вариациями.
-
Полноразмерная транскриптомика Nanopore
Сложные и изменчивые альтернативные изоформы в организмах являются важными генетическими механизмами регуляции экспрессии генов и разнообразия белков.Точная идентификация структур транскриптов является основой для углубленного изучения паттернов регуляции экспрессии генов.Платформа секвенирования Nanopore успешно перевела транскриптомное исследование на уровень изоформ.Эта аналитическая платформа предназначена для анализа данных RNA-Seq, сгенерированных на платформе Nanopore, на основе эталонного генома, что обеспечивает качественный и количественный анализ как на уровне генов, так и на уровне транскриптов.
