-
Tiransikiripiti Gigun PacBio-kikun (kii ṣe itọkasi)
Amplicon (16S / 18S / ITS) Syeed ti ni idagbasoke pẹlu awọn ọdun ti iriri ni itupalẹ iṣẹ akanṣe oniruuru makirobia, eyiti o ni itupalẹ ipilẹ idiwọn ati itupalẹ ara ẹni: itupalẹ ipilẹ ni wiwa akoonu itupalẹ akọkọ ti iwadii makirobia lọwọlọwọ, akoonu itupalẹ jẹ ọlọrọ ati okeerẹ, ati awọn abajade itupalẹ ni a gbekalẹ ni irisi awọn ijabọ akanṣe;Awọn akoonu ti ara ẹni onínọmbà jẹ orisirisi.Awọn ayẹwo ni a le yan ati pe a le ṣeto awọn paramita ni irọrun ni ibamu si ijabọ itupalẹ ipilẹ ati idi iwadi, lati mọ awọn ibeere ti ara ẹni.Windows ọna eto, o rọrun ati ki o yara.
-
Tiransikiripiti Gigun PacBio-kikun (kii ṣe itọkasi)
Gbigbe Awọn Imọ-ẹrọ Pacific Biosciences (PacBio) Isoform data titele bi titẹ sii, Ohun elo yii ni anfani lati ṣe idanimọ awọn ilana iwe-kikọ ipari ipari (laisi apejọ).Nipa tito aworan agbaye ni kikun lodi si jiini itọkasi, awọn iwe afọwọkọ le jẹ iṣapeye nipasẹ awọn Jiini ti a mọ, awọn iwe afọwọkọ, awọn agbegbe ifaminsi, bbl Ni idi eyi, idanimọ deede diẹ sii ti awọn ẹya mRNA, gẹgẹbi pipin yiyan, ati bẹbẹ lọ, le ṣaṣeyọri.Onínọmbà apapọ pẹlu data itọsẹ transcriptome NGS ngbanilaaye alaye asọye diẹ sii ati iwọn deede diẹ sii ni ikosile ni ipele kikowe, eyiti o ni anfani pupọ ni ikosile iyatọ isale ati itupalẹ iṣẹ.
-
Awọn irinṣẹ irinṣẹ
BMKCloud jẹ ipilẹ bioinformatic asiwaju ti n pese ojutu iduro-ọkan fun awọn eto genomic, eyiti o jẹ igbẹkẹle pupọ nipasẹ awọn oniwadi ni ọpọlọpọ awọn aaye pẹlu iṣoogun, iṣẹ-ogbin, ayika, bbl BMKCloud ti pinnu lati pese iṣọpọ, igbẹkẹle ati awọn iṣẹ to munadoko pẹlu awọn iru ẹrọ itupalẹ bioinformatic ati awọn irinṣẹ. BMKCloud ni ọpọlọpọ awọn irinṣẹ bioinformatic nigbagbogbo ti a lo nigbagbogbo pẹlu alaye jiini, awọn irinṣẹ jiini ti itiranya, ncRNA, iṣakoso didara data, apejọ, titete, isediwon data, awọn iyipada, awọn iṣiro, olupilẹṣẹ olupilẹṣẹ, lẹsẹsẹ onínọmbà, ati be be lo.
-
RNA kekere
Awọn RNA kekere jẹ iru kukuru ti kii ṣe ifaminsi RNA pẹlu aropin ipari ti 18-30 nt, pẹlu miRNA, siRNA ati piRNA.Awọn RNA kekere wọnyi ni a ti royin lọpọlọpọ lati ni ipa ninu ọpọlọpọ awọn ilana ti ibi gẹgẹbi ibajẹ mRNA, idinamọ itumọ, dida heterochromatin, bbl Syeed onínọmbà lesese oriširiši boṣewa onínọmbà ati to ti ni ilọsiwaju data iwakusa.Lori ipilẹ ti data RNA-seq, itupalẹ boṣewa le ṣaṣeyọri idanimọ miRNA ati asọtẹlẹ, asọtẹlẹ jiini ibi-afẹde miRNA, asọye ati itupalẹ ikosile.Itupalẹ ilọsiwaju jẹ ki wiwa miRNA ti adani ati isediwon, iran aworan atọka Venn, miRNA ati ile nẹtiwọọki jiini ibi-afẹde.
-
NGS-WGS (Imọlẹ/BGI)
NGS-WGS jẹ gbogbo ipilẹ-itupalẹ atunbere genome, eyiti o dagbasoke lori ipilẹ ti iriri ọlọrọ ni Awọn Imọ-ẹrọ Biomarker.Irọrun-si-lilo Syeed yii ngbanilaaye ifakalẹ iyara ti iṣan-iṣẹ itupalẹ iṣọpọ nipa fifirọrọrun ṣeto paramita ipilẹ diẹ, eyiti o baamu fun data itọsẹ DNA ti ipilẹṣẹ lati ori pẹpẹ Illumina mejeeji ati pẹpẹ itẹlera BGI.Syeed yii ti wa ni ransogun lori olupin iširo iṣẹ ṣiṣe giga, eyiti o fun ni agbara itupalẹ data to munadoko ni akoko to lopin pupọ.Iwakusa data ti ara ẹni wa lori ipilẹ ti itupalẹ boṣewa, pẹlu ibeere jiini ti o yipada, apẹrẹ alakoko PCR, ati bẹbẹ lọ.
-
mRNA(Itọkasi)
Transcriptome jẹ ọna asopọ laarin alaye jiini jiini ati proteome ti iṣẹ ti ibi.Ilana ipele transcriptional jẹ pataki julọ ati ipo ilana iwadi ti o gbajumo julọ ti awọn ohun alumọni.Tiransikiripipim lesese le tẹle awọn transcriptome ni eyikeyi aaye ni akoko tabi labẹ eyikeyi majemu, pẹlu kan ipinnu deede si kan nikan nucleotide.O le ṣe afihan ipele ti jiini transcription, ni akoko kanna ṣe idanimọ ati ṣe iwọn awọn iwe afọwọkọ toje ati deede, ati pese alaye igbekale ti ayẹwo kan pato kiko sile.
Ni lọwọlọwọ, imọ-ẹrọ itẹlera transscriptome ti ni lilo pupọ ni agronomy, oogun ati awọn aaye iwadii miiran, pẹlu ẹranko ati ilana idagbasoke ọgbin, aṣamubadọgba ayika, ibaraenisepo ajẹsara, isọdi jiini, itankalẹ ẹda ẹda ati tumo ati wiwa arun jiini.
-
Metagenomics (NGS)
Syeed itupalẹ yii jẹ apẹrẹ fun itupalẹ data metagenomic ibọn kekere lori ipilẹ ti awọn ọdun ti iriri.O ni iṣan-iṣẹ iṣọpọ ti o ni ọpọlọpọ awọn itupalẹ awọn itupalẹ metagenomics ti o wọpọ pẹlu sisẹ data, awọn ẹkọ ipele-ẹya, awọn ijinlẹ ipele iṣẹ-jiini, binning metagenome, bbl Ni afikun, awọn irinṣẹ iwakusa data ti adani wa lori ṣiṣan ṣiṣayẹwo boṣewa, pẹlu jiini ati ibeere eya. , Eto paramita, ti o npese eeya ti ara ẹni, ati bẹbẹ lọ.
-
LncRNA
Awọn RNA ti kii ṣe ifaminsi gigun (lncRNA) jẹ iru awọn iwe afọwọkọ pẹlu ipari to gun ju 200 nt, eyiti ko lagbara lati koodu awọn ọlọjẹ.Ẹri ikojọpọ daba pe pupọ julọ awọn lncRNA ni o ṣeeṣe pupọ lati ṣiṣẹ.Awọn imọ-ẹrọ atẹle-giga ati awọn irinṣẹ itupalẹ bioinformatic fun wa ni agbara lati ṣafihan awọn ilana lncRNA ati alaye ipo daradara siwaju sii ati mu wa lati ṣawari awọn lncRNA pẹlu awọn iṣẹ ilana pataki.BMKCloud ni igberaga lati pese ipilẹ ẹrọ itupalẹ lncRNA ti awọn alabara wa lati ṣaṣeyọri iyara, igbẹkẹle ati itupalẹ lncRNA rọ.
-
GWAS
Iwadi ẹgbẹ-jakejado Genome (GWAS) ni ifọkansi lati ṣe idanimọ awọn iyatọ jiini (genotype) ti o ni nkan ṣe pẹlu awọn ami-ara kan pato (phenotype).Awọn ijinlẹ GWA ṣe iwadii awọn asami jiini kọja gbogbo jiini ti nọmba nla ti awọn ẹni-kọọkan ati asọtẹlẹ awọn ẹgbẹ genotype-phenotype nipasẹ itupalẹ iṣiro ni ipele olugbe.Gbogbo-jinomii ti o tẹle le ṣe iwari gbogbo awọn iyatọ jiini.Ni idapọ pẹlu data phenotypic, GWAS le ṣe ilana lati ṣe idanimọ awọn SNPs ti o ni ibatan phenotype, awọn QTL ati awọn jiini oludije, eyiti o ṣe atilẹyin fun ibisi ẹranko / ọgbin ode oni.SLAF jẹ ilana imudara jiini irọrun ti ara ẹni ti o ni idagbasoke, eyiti o ṣe awari awọn asami pinpin kaakiri-genome, SNP.Awọn SNP wọnyi, gẹgẹbi awọn ami-ami jiini molikula, le ṣe ilana fun awọn ikẹkọ ẹgbẹ pẹlu awọn ami ifọkansi.O jẹ ilana imunadoko iye owo ni idamo awọn abuda ti o nipọn ti o somọ awọn iyatọ jiini.
-
Nanopore Kikun-ipari transcriptomics
Eka ati awọn isoforms yiyan oniyipada ninu awọn ohun alumọni jẹ awọn ilana jiini pataki fun ṣiṣakoso ikosile jiini ati oniruuru amuaradagba.Idanimọ pipe ti awọn ẹya iwe afọwọkọ jẹ ipilẹ fun ikẹkọ jinlẹ ti awọn ilana ilana ikosile pupọ.Syeed itẹlera Nanopore ti mu ikẹkọ transcriptomic ni aṣeyọri si ipele isoform.Syeed itupalẹ yii jẹ apẹrẹ lati ṣe itupalẹ data RNA-Seq ti ipilẹṣẹ lori pẹpẹ Nanopore lori ipilẹ ti jiini itọkasi, eyiti o ṣaṣeyọri agbara ati awọn itupalẹ iwọn ni ipele jiini mejeeji ati ipele awọn iwe afọwọkọ.
