-
Fanaraha-maso ny immunoprecipitation Chromatin (ChIP-seq)
Ny ChIP-Seq dia manome ny mombamomba ny genome amin'ny lasibatra ADN ho an'ny fanovana histone, anton-javatra transcription, ary proteinina hafa mifandraika amin'ny ADN.Izy io dia manambatra ny fifantenana ny chromatin immuno-precipitation (ChIP) mba hamerenana ireo complexes proteinina-ADN manokana, miaraka amin'ny herin'ny sequencing taranaka manaraka (NGS) ho an'ny filaharana avo lenta amin'ny ADN tafaverina.Fanampin'izany, satria azo avy amin'ny sela velona ny complexes-proteinina-ADN, dia azo ampitahaina amin'ny karazana sela sy sela samihafa ny toerana mamatotra, na amin'ny toe-javatra samihafa.Ny fampiharana dia manomboka amin'ny fitsipika transcriptional mankany amin'ny lalan'ny fampandrosoana mankany amin'ny mekanika aretina sy ny sisa.
Platform: Illumina NovaSeq 6000
-
Fizarana bisulfite genome manontolo
Ny methylation ADN amin'ny toerana fahadimy ao amin'ny cytosine (5-mC) dia misy fiantraikany lehibe amin'ny fanehoana ny fototarazo sy ny asan'ny sela.Ny lamina methylation tsy ara-dalàna dia mifandray amin'ny toe-javatra sy aretina maro, toy ny homamiadana.Ny WGBS dia lasa fenitry ny volamena amin'ny fandalinana ny methylation amin'ny genome-wide amin'ny fanapahan-kevitra fototra tokana.
Sehatra: Illumina NovaSeq6000
-
Fanadihadiana ho an'ny Chromatin Transposase-Accessible miaraka amin'ny Sequencing High Throughput (ATAC-seq)
ATAC-seq dia fomba fiasa avo lenta amin'ny famakafakana ny fidirana amin'ny krômatin'ny genome, izay zava-dehibe amin'ny fanaraha-maso epigenetika manerantany amin'ny fanehoana ny fototarazo.Ampidirina amin'ny faritra kromatin misokatra amin'ny alàlan'ny transposase Tn5 hyperactive ny adaptatera sequencing.Aorian'ny fanamafisam-peo PCR dia amboarina ny tranomboky filaharana.Ny faritra chromatin misokatra rehetra dia azo alaina amin'ny toe-javatra voafaritra manokana, tsy voafetra amin'ny toerana mamatotra ny transcription factor, na faritra novaina histone.
-
Sequencing bisulfite de reduced (RRBS)
Ny fikarohana momba ny methylation ADN dia lohahevitra mafana foana amin'ny fikarohana aretina, ary mifandray akaiky amin'ny fanehoana ny fototarazo sy ny toetra mampiavaka azy.RRBS dia fomba marina, mahomby ary ara-toekarena amin'ny fikarohana methylation ADN.Ny fampitomboana ny faritra nosy mpanentana sy CpG amin'ny alàlan'ny cleavage enzymatic (Msp I), miaraka amin'ny fisehon'ny Bisulfite, dia manome fitiliana methylation ADN avo lenta.
Platform: Illumina NovaSeq 6000
