-
Transkriptome Panjang Penuh PacBio (Non-Referensi)
Platform Amplicon (16S/18S/ITS) dikembangkan dengan pengalaman bertahun-tahun dalam analisis proyek keanekaragaman mikroba, yang berisi analisis dasar standar dan analisis yang dipersonalisasi: analisis dasar mencakup konten analisis arus utama penelitian mikroba saat ini, konten analisis kaya dan komprehensif, dan hasil analisis disajikan dalam bentuk laporan proyek;Isi dari analisis yang dipersonalisasi beragam.Sampel dapat dipilih dan parameter dapat diatur secara fleksibel sesuai dengan laporan analisis dasar dan tujuan penelitian, untuk mewujudkan persyaratan yang dipersonalisasi.Sistem operasi Windows, sederhana dan cepat.
-
Transkriptome Panjang Penuh PacBio (Non-Referensi)
Mengambil data sekuensing Isoform Pacific Biosciences (PacBio) sebagai input, Aplikasi ini mampu mengidentifikasi sekuens transkrip panjang penuh (tanpa perakitan).Dengan memetakan urutan panjang penuh terhadap genom referensi, transkrip dapat dioptimalkan oleh gen yang diketahui, transkrip, daerah pengkodean, dll. Dalam hal ini, identifikasi struktur mRNA yang lebih akurat, seperti splicing alternatif, dll, dapat dicapai.Analisis gabungan dengan data pengurutan transkriptom NGS memungkinkan anotasi yang lebih komprehensif dan kuantifikasi yang lebih akurat dalam ekspresi pada tingkat transkrip, yang sebagian besar menguntungkan ekspresi diferensial hilir dan analisis fungsional.
-
Toolkit
BMKCloud adalah platform bioinformatika terkemuka yang menyediakan solusi satu atap untuk program genomik, yang dipercaya secara luas oleh para peneliti di berbagai bidang termasuk medis, pertanian, lingkungan, dll. BMKCloud berkomitmen untuk menyediakan layanan yang terintegrasi, andal, dan efisien termasuk platform dan alat analisis bioinformatika , sumber daya komputasi, database publik, kursus online bioinformatika, dll. BMKCloud memiliki berbagai alat bioinformatika yang sering digunakan termasuk anotasi gen, alat genetik evolusi, ncRNA, kontrol kualitas data, perakitan, penyelarasan, ekstraksi data, mutasi, statistik, generator gambar, urutan analisis, dll.
-
RNA kecil
Small RNA adalah jenis short non-coding RNA dengan panjang rata-rata 18-30 nt, termasuk miRNA, siRNA dan piRNA.RNA kecil ini telah dilaporkan secara besar-besaran terlibat dalam berbagai proses biologis seperti degradasi mRNA, penghambatan translasi, pembentukan heterokromatin, dll. Analisis sekuensing RNA kecil telah diterapkan secara luas dalam studi tentang perkembangan hewan/tanaman, penyakit, virus, dll. RNA kecil platform analisis pengurutan terdiri dari analisis standar dan penambangan data tingkat lanjut.Berdasarkan data RNA-seq, analisis standar dapat mencapai identifikasi dan prediksi miRNA, prediksi gen target miRNA, anotasi dan analisis ekspresi.Analisis lanjutan memungkinkan pencarian dan ekstraksi miRNA yang disesuaikan, pembuatan diagram Venn, miRNA, dan pembangunan jaringan gen target.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
NGS-WGS adalah platform analisis pengurutan ulang seluruh genom, yang dikembangkan berdasarkan pengalaman yang kaya dalam Teknologi Biomarker.Platform yang mudah digunakan ini memungkinkan pengiriman cepat dari alur kerja analisis terintegrasi hanya dengan mengatur beberapa parameter dasar, yang sesuai untuk data sekuensing DNA yang dihasilkan dari platform Illumina dan platform pengurutan BGI.Platform ini digunakan pada server komputasi kinerja tinggi, yang memberdayakan analisis data yang sangat efisien dalam waktu yang sangat terbatas.Penambangan data yang dipersonalisasi tersedia berdasarkan analisis standar, termasuk kueri gen yang bermutasi, desain primer PCR, dll.
-
mRNA (Referensi)
Transkriptom adalah penghubung antara informasi genetik genom dan proteom fungsi biologis.Regulasi tingkat transkripsi adalah mode regulasi organisme yang paling penting dan paling banyak dipelajari.Pengurutan transkriptom dapat mengurutkan transkriptom kapan saja atau dalam kondisi apa pun, dengan resolusi yang akurat untuk satu nukleotida. Ini dapat secara dinamis mencerminkan tingkat transkripsi gen, secara bersamaan mengidentifikasi dan mengukur transkrip langka dan normal, dan memberikan informasi struktural dari contoh transkrip tertentu.
Saat ini, teknologi sekuensing transkriptom telah banyak digunakan di bidang agronomi, kedokteran, dan bidang penelitian lainnya, termasuk regulasi perkembangan hewan dan tumbuhan, adaptasi lingkungan, interaksi imun, lokalisasi gen, evolusi genetik spesies, serta deteksi tumor dan penyakit genetik.
-
Metagenomics (NGS)
Platform analisis ini dirancang untuk analisis data metagenomik senapan berdasarkan pengalaman bertahun-tahun.Ini terdiri dari alur kerja terintegrasi yang berisi berbagai analisis metagenomik yang umum dibutuhkan termasuk pemrosesan data, studi tingkat spesies, studi tingkat fungsi gen, binning metagenom, dll. Selain itu, alat penambangan data yang disesuaikan tersedia berdasarkan alur kerja analisis standar, termasuk permintaan gen dan spesies , pengaturan parameter, pembuatan angka yang dipersonalisasi, dll.
-
LncRNA
Long non-coding RNAs (lncRNA) adalah jenis transkrip dengan panjang lebih dari 200 nt, yang tidak dapat mengkode protein.Bukti akumulatif menunjukkan bahwa sebagian besar lncRNA sangat mungkin berfungsi.Teknologi sekuensing throughput tinggi dan alat analisis bioinformatika memberdayakan kami untuk mengungkapkan sekuens lncRNA dan informasi pemosisian secara lebih efisien dan mengarahkan kami untuk menemukan lncRNA dengan fungsi pengaturan penting.BMKCloud dengan bangga menyediakan platform analisis pengurutan lncRNA kepada pelanggan kami untuk mencapai analisis lncRNA yang cepat, andal, dan fleksibel.
-
GWAS
Studi asosiasi genome (GWAS) bertujuan untuk mengidentifikasi varian genetik (genotipe) yang terkait dengan sifat-sifat tertentu (fenotipe).Studi GWA menyelidiki penanda genetik melintasi seluruh genom dari sejumlah besar individu dan memprediksi asosiasi genotipe-fenotipe dengan analisis statistik pada tingkat populasi.Pengurutan ulang seluruh genom berpotensi menemukan semua varian genetik.Digabungkan dengan data fenotipik, GWAS dapat diproses untuk mengidentifikasi SNP, QTL, dan kandidat gen terkait fenotipe, yang sangat mendukung pemuliaan hewan/tanaman modern.SLAF adalah strategi pengurutan genom sederhana yang dikembangkan sendiri, yang menemukan penanda terdistribusi luas genom, SNP.SNP ini, sebagai penanda genetik molekuler, dapat diproses untuk studi asosiasi dengan sifat yang ditargetkan.Ini adalah strategi hemat biaya dalam mengidentifikasi sifat kompleks yang terkait dengan variasi genetik.
-
Transkriptomik panjang penuh Nanopore
Isoform alternatif yang kompleks dan bervariasi dalam organisme merupakan mekanisme genetik penting untuk mengatur ekspresi gen dan keragaman protein.Identifikasi akurat dari struktur transkrip adalah dasar untuk studi mendalam tentang pola regulasi ekspresi gen.Platform sekuensing nanopore telah berhasil membawa studi transkriptomik ke tingkat isoform.Platform analisis ini dirancang untuk menganalisis data RNA-Seq yang dihasilkan pada platform Nanopore berdasarkan genom referensi, yang mencapai analisis kualitatif dan kuantitatif di tingkat gen dan tingkat transkrip.
