-
PacBio-Поўнафарматны транскрыптам (недаведкавы)
Платформа Amplicon (16S/18S/ITS) распрацавана з шматгадовым вопытам у галіне аналізу праектаў мікрабнай разнастайнасці, які змяшчае стандартызаваны базавы аналіз і персаналізаваны аналіз: базавы аналіз ахоплівае асноўнае змест аналізу бягучых даследаванняў мікробаў, змест аналізу багаты і поўны, а вынікі аналізу прадстаўляюцца ў выглядзе справаздач па праектах;Змест персанальнага аналізу разнастайны.Узоры могуць быць выбраны і параметры могуць быць устаноўлены ў адпаведнасці з асноўным справаздачы аналізу і мэтаў даследавання, каб рэалізаваць персаналізаваныя патрабаванні.Аперацыйная сістэма Windows, простая і хуткая.
-
PacBio-Поўнафарматны транскрыптам (недаведкавы)
Прымаючы ў якасці ўваходных дадзеных дадзеныя секвенавання ізаформ Pacific Biosciences (PacBio), гэта дадатак здольна ідэнтыфікаваць поўнаметражныя паслядоўнасці транскрыптаў (без зборкі).Шляхам адлюстравання поўнаметражных паслядоўнасцяў з эталонным геномам транскрыпты могуць быць аптымізаваны з дапамогай вядомых генаў, транскрыптаў, кадавальных абласцей і г. д. У гэтым выпадку можна дасягнуць больш дакладнай ідэнтыфікацыі структур мРНК, напрыклад, альтэрнатыўнага сплайсинга і г.д.Сумесны аналіз з дадзенымі секвенавання транскрыптам NGS дазваляе атрымаць больш поўную анатацыю і больш дакладную колькасную ацэнку выказвання на ўзроўні транскрыптаў, што ў значнай ступені прыносіць карысць ніжэй па плыні дыферэнцыяльнай экспрэсіі і функцыянальнага аналізу.
-
Наборы інструментаў
BMKCloud з'яўляецца вядучай біяінфарматычнай платформай, якая забяспечвае комплекснае рашэнне для геномных праграм, якому шырока давяраюць даследчыкі ў розных сферах, уключаючы медыцынскія, сельскагаспадарчыя, экалагічныя і г.д. BMKCloud імкнецца прадастаўляць інтэграваныя, надзейныя і эфектыўныя паслугі, уключаючы платформы і інструменты біяінфарматычнага аналізу , вылічальныя рэсурсы, агульнадаступная база дадзеных, біяінфарматычныя онлайн-курсы і г.д. BMKCloud мае розныя часта выкарыстоўваюцца біяінфарматычныя інструменты, уключаючы анатацыю генаў, эвалюцыйныя генетычныя інструменты, ncRNA, кантроль якасці дадзеных, зборку, выраўноўванне, выманне дадзеных, мутацыі, статыстыку, генератар фігур, паслядоўнасць аналіз і г.д.
-
малая РНК
Малыя РНК - гэта тып кароткіх некадуючых РНК з сярэдняй даўжынёй 18-30 нт, уключаючы микроРНК, миРНК і пиРНК.Паведамляецца, што гэтыя малыя РНК ўдзельнічаюць у розных біялагічных працэсах, такіх як дэградацыя мРНК, інгібіравання трансляцыі, адукацыя гетерохроматина і г.д. Аналіз секвеніравання малой РНК шырока ўжываўся ў даследаваннях развіцця жывёл/раслін, хвароб, вірусаў і г.д. Платформа аналізу паслядоўнасці складаецца з стандартнага аналізу і пашыранага аналізу дадзеных.На аснове дадзеных RNA-seq стандартны аналіз можа дасягнуць ідэнтыфікацыі і прагназавання мікраРНК, прагназавання мэтавага гена мікраРНК, аналізу анатацый і экспрэсіі.Пашыраны аналіз дазваляе наладзіць пошук і здабыванне мікраРНК, стварэнне дыяграм Вена, стварэнне сеткі мікраРНК і мэтавых генаў.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
NGS-WGS - гэта цэлая платформа для аналізу паўторнага секвенавання геному, распрацаваная на аснове багатага вопыту ў Biomarker Technologies.Гэта простая ў выкарыстанні платформа дазваляе хутка адправіць інтэграваны працоўны працэс аналізу, проста задаўшы некалькі асноўных параметраў, якія падыходзяць для дадзеных секвенавання ДНК, атрыманых як з платформы Illumina, так і з платформы секвенавання BGI.Гэтая платформа разгорнута на высокапрадукцыйным серверы вылічэнняў, што забяспечвае высокаэфектыўны аналіз даных за вельмі абмежаваны час.Персаналізаваны аналіз дадзеных даступны на аснове стандартнага аналізу, уключаючы запыт мутаваных генаў, дызайн праймераў для ПЦР і г.д.
-
мРНК (даведка)
Транскрыптом з'яўляецца сувязным звяном паміж геномнай генетычнай інфармацыяй і пратэомам біялагічнай функцыі.Рэгуляцыя ўзроўню транскрыпцыі з'яўляецца найбольш важным і найбольш шырока вывучаным спосабам рэгуляцыі арганізмаў.Секвенаванне транскрыптам можа паслядоўнасці транскрыпту ў любы момант часу або пры любых умовах з раздзяленнем, дакладным да аднаго нуклеатыду. Ён можа дынамічна адлюстроўваць узровень транскрыпцыі гена, адначасова ідэнтыфікаваць і колькасна вызначаць рэдкія і нармальныя транскрыпты, а таксама даць структурную інфармацыю аб узор канкрэтных транскрыптаў.
У цяперашні час тэхналогія секвеніравання транскрыптам шырока выкарыстоўваецца ў аграноміі, медыцыне і іншых галінах даследаванняў, уключаючы рэгуляванне развіцця жывёл і раслін, адаптацыю да навакольнага асяроддзя, імуннае ўзаемадзеянне, лакалізацыю генаў, генетычную эвалюцыю відаў і выяўленне пухлін і генетычных захворванняў.
-
Метагеноміка (NGS)
Гэтая аналітычная платформа прызначана для аналізу метагеномных дадзеных драбавік на аснове шматгадовага вопыту.Ён складаецца з інтэграванага працоўнага працэсу, які змяшчае розныя звычайна неабходныя метаданомічныя аналізы, уключаючы апрацоўку даных, даследаванні на ўзроўні відаў, даследаванні на ўзроўні функцый гена, бінінг метагеномаў і г.д. Акрамя таго, пры стандартным працоўным працэсе аналізу даступныя індывідуальныя інструменты інтэлектуальнага аналізу дадзеных, уключаючы запыт генаў і відаў , налада параметраў, генерацыя персаналізаванай фігуры і г.д.
-
LncRNA
Доўгія некадуючыя РНК (lncRNA) - гэта тып транскрыптаў даўжынёй больш за 200 нт, якія не здольныя кадаваць вавёркі.Назапашаныя дадзеныя сведчаць аб тым, што большасць lncRNAs, вельмі верагодна, будуць функцыянальнымі.Тэхналогіі секвенавання высокай прапускной здольнасці і інструменты біяінфарматычнага аналізу даюць нам магчымасць больш эфектыўна раскрываць паслядоўнасці lncRNA і інфармацыю аб пазіцыянаванні і прыводзяць нас да выяўлення lncRNA з важнымі рэгулятарнымі функцыямі.BMKCloud з гонарам прадстаўляе нашым кліентам платформу для аналізу паслядоўнасці lncRNA для дасягнення хуткага, надзейнага і гнуткага аналізу lncRNA.
-
GWAS
Даследаванне агульнагеномных асацыяцый (GWAS) накіравана на выяўленне генетычных варыянтаў (генатып), якія звязаны са спецыфічнымі прыкметамі (фенатып).Даследаванні GWA даследуюць генетычныя маркеры, перасякаючы ўвесь геном вялікай колькасці асобін, і прагназуюць сувязі генатып-фенатып шляхам статыстычнага аналізу на ўзроўні насельніцтва.Паўторнае секвенаванне геному патэнцыйна можа выявіць усе генетычныя варыянты.У спалучэнні з фенатыпічнымі дадзенымі, GWAS можа быць апрацаваны для ідэнтыфікацыі звязаных з фенатыпам SNP, QTL і генаў-кандыдатаў, што моцна падтрымлівае сучасную селекцыю жывёл і раслін.SLAF - гэта самастойна распрацаваная спрошчаная стратэгія секвенавання геному, якая выяўляе размеркаваныя па ўсім геному маркеры, SNP.Гэтыя SNP, як малекулярна-генетычныя маркеры, могуць быць апрацаваны для даследаванняў асацыяцыі з мэтавымі прыкметамі.Гэта эканамічна эфектыўная стратэгія ў выяўленні складаных прыкмет, звязаных з генетычнымі варыяцыямі.
-
Nanopore Поўнафарматная транскрыптаміка
Складаныя і зменлівыя альтэрнатыўныя ізаформы ў арганізмах з'яўляюцца важнымі генетычнымі механізмамі для рэгулявання экспрэсіі генаў і разнастайнасці бялкоў.Дакладная ідэнтыфікацыя структур транскрыптаў з'яўляецца асновай для паглыбленага вывучэння патэрнаў рэгуляцыі экспрэсіі генаў.Платформа секвенавання Nanopore паспяхова вывела транскрыптамічнае даследаванне на ўзровень ізаформ.Гэтая аналітычная платформа прызначана для аналізу дадзеных RNA-Seq, атрыманых на платформе Nanopore на аснове эталоннага геному, які дазваляе праводзіць якасны і колькасны аналіз як на ўзроўні генаў, так і на ўзроўні транскрыптаў.
