lncRNA
Дългите некодиращи РНК (lncRNA) са РНК, по-дълги от 200 нуклеотида, с нисък кодиращ потенциал, но с критични регулаторни функции. Конвейерът за lncRNA на BMKCloud е проектиран да анализира библиотеки с намален брой rRNA с висококачествен, добре анотиран референтен геном, чрез едновременно анализиране на експресията на lncRNA и mRNA. След подрязване на четенията и контрол на качеството, четенията се подравняват с референтния геном, за да се сглобят транскрипти, а последващият анализ на генната структура разкрива алтернативно сплайсинг и нови гени. Транскриптите се идентифицират като mRNA или lncRNA, а анализът на диференциалната експресия идентифицира диференциално експресирани lncRNA, техните мишени и диференциално експресирани гени (DEGS). Както DEG, така и диференциално експресираните lncRNA мишени са функционално анотирани, за да се намерят обогатени функционални категории.
Биоинформатика
