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Prodotti

Re-sequenziamento del genoma intero batterico e fungino

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I progetti di re-sequenziamento di genomi di genomica microbica sono fondamentali per consentire il completamento e il confronto dei genomi microbici. Ciò facilita l'ingegneria di fermentazione, l'ottimizzazione dei processi industriali e l'esplorazione dei percorsi del metabolismo secondario. Inoltre, la resequenziamento fungino e batterico è cruciale per comprendere l'adattamento ambientale, ottimizzare i ceppi e rivelare le dinamiche di evoluzione genetica, con ampie implicazioni in medicina, agricoltura e scienze ambientali.


Dettagli del servizio

Bioinformatica

Risultati demo

Pubblicazioni in primo piano

Vantaggi del servizio

L'analisi bioinformatica include la chiamata della variante:Fornire approfondimenti funzionali sui genomi ri-sequenziati.

● Estensiva competenza: Con migliaia di progetti di re-sequenziamento microbici condotti ogni anno, portiamo oltre un decennio di esperienza, un team di analisi altamente qualificato, contenuti completi e un eccellente supporto post-vendita.

Supporto post-vendita:Il nostro impegno si estende oltre il completamento del progetto con un periodo di servizio post-vendita di 3 mesi. Durante questo periodo, offriamo un follow-up del progetto, assistenza per la risoluzione dei problemi e sessioni di domande e risposte per affrontare eventuali domande relative ai risultati.

Specifiche del servizio

Piattaforma di sequenziamento

Strategia di sequenziamento

Dati consigliati

Controllo di qualità

Illumina novaseq

PE150

Profondità di 100x

Q30≥85%

Requisiti del campione

Concentrazione (ng/µl)

Importo totale (NG)

Volume (µL)

≥1

≥60

≥20

Batteri: ≥1x107 cellule

Funghi unicellulari: ≥5x106-1x107 cellule

I funghi macro: ≥4G

Flusso di lavoro di servizio

Consegna del campione

Consegna del campione

Preparazione della biblioteca

Costruzione della biblioteca

Sequenziamento

Sequenziamento

Analisi dei dati

Analisi dei dati

Servizi dopo la vendita

Servizi post-vendita


  • Precedente:
  • Prossimo:

  • 流程图 11-01

    Include la seguente analisi:

    • Controllo della qualità dei dati di sequenziamento
    • Allineamento al genoma di riferimento
    • Variant Calling: SNP e Indel
    • Annotazione variante

     

    Chiamata variante: tipi SNP

     

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    Chiamata variante: distribuzione della lunghezza indel

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    Esplora i progressi facilitati dal genoma microbico di BMKGENE Servizi di re-sequenziamento attraverso una raccolta curata di pubblicazioni.

    Jia, Y. et al. (2023) "combinando il trascrittoma e l'intero genoma che re-sequencing per schermare i geni di resistenza alle malattie per il bunt nano di grano",International Journal of Molecular Sciences, 24 (24). doi: 10.3390/ijms242417356.

    Jiang, M. et al. (2023) "Il metabolismo del glucosio controllato dall'ampicillina manipola la transizione dalla tolleranza alla resistenza nei batteri",Progressi scientifici, 9 (10). doi: 10.1126 /ciadv.ade8582/supple_file /ciadv.ade8582_sm.pdf.

    Yang, M. et al. (2022) 'Aliidiomarina halalkaliphila sp. Nov., Un batterio aloalkalifilico isolato da un lago di soda nella regione autonoma della Mongolia interna, Cina ', int. J. Syst. Evol.Microbiol, 72, p. 5263. Doi: 10.1099/ijsem.0.005263.

    Zhu, Z., Wu, R. e Wang, G.-H. (2024) "Sequenza del genoma di Staphylococcus nepalensis Zz-2023a, isolata dalla Nasonia vitripennis",Annunci di risorse di microbiologia. doi: 10.1128/MRA.00802-23.

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