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Prodotti

Illumina e BGI

La tecnologia di sequenziamento Illumina, basata sul Sequencing by Synthesis (SBS), è un'innovazione NGS adottata a livello globale, responsabile della generazione di oltre il 90% dei dati di sequenziamento a livello mondiale.Il principio dell'SBS prevede l'imaging di terminatori reversibili marcati in modo fluorescente man mano che ciascun dNTP viene aggiunto e successivamente tagliato per consentire l'incorporazione della base successiva.Con tutti e quattro i dNTP reversibili legati ai terminatori presenti in ciascun ciclo di sequenziamento, la concorrenza naturale riduce al minimo i bias di incorporazione.Questa tecnologia versatile supporta librerie sia a lettura singola che a fine coppia, soddisfacendo una vasta gamma di applicazioni genomiche.Le capacità ad alta produttività e la precisione del sequenziamento Illumina lo posizionano come una pietra angolare nella ricerca genomica, consentendo agli scienziati di svelare le complessità dei genomi con dettagli ed efficienza senza pari.

DNBSEQ, sviluppata da BGI, è un'altra tecnologia NGS innovativa che è riuscita a ridurre ulteriormente i costi di sequenziamento e ad aumentare la produttività.La preparazione delle librerie DNBSEQ prevede la frammentazione del DNA, la preparazione di ssDNA e l'amplificazione del cerchio rotante per ottenere le nanoball di DNA (DNB).Questi vengono quindi caricati su una superficie solida e successivamente sequenziati mediante sintesi combinatoria sonda-ancora (cPAS).

Il nostro servizio di sequenziamento di librerie predefinite facilita i clienti nella preparazione delle proprie librerie di sequenziamento da diverse fonti (mRNA, intero genoma, amplicone, tra gli altri).Successivamente, queste librerie possono essere spedite ai nostri centri di sequenziamento per il controllo di qualità e il sequenziamento nelle piattaforme Illumina o BGI.


Dettagli del servizio

Risultato dimostrativo

Caratteristiche

Piattaforme:Illumina NovaSeq 6000, NovaSeq, HiSeq X Ten e BGI-DNB-T7

Modalità di sequenziamento:PE50, PE100, PE150, PE250

Controllo di qualità delle librerie prima del sequenziamento

Sequenziamento della consegna dei dati e QC:consegna del report QC e dei dati grezzi in formato fastq dopo aver demultiplexato e filtrato le letture Q30.

 

Vantaggi del servizio

Versatilità dei servizi di sequenziamento:il cliente può scegliere di sequenziare per corsia, cella a flusso o quantità di dati.

Versatilità delle piattaforme:Le librerie DNB possono essere trasferite su piattaforme Illumina

Vasta esperienza sulla piattaforma di sequenziamento Illumina:con migliaia di progetti chiusi con varie specie. 

Consegna del rapporto QC del sequenziamento:con metriche di qualità, accuratezza dei dati e prestazioni complessive del progetto di sequenziamento.

Processo di sequenziamento maturo:con tempi di consegna brevi.

Controllo qualità rigoroso: implementiamo severi requisiti di controllo qualità per garantire la fornitura di risultati costantemente di alta qualità.

Requisiti del campione*

Sequenziamento parziale delle corsie

Quantità di dati (X)

Concentrazione (qPCR/nM)

Volume

X ≤ 50 GB

≥ 2 nM

≥ 20 µl

50 GB ≤ X < 100 GB

≥ 3 nM

≥ 20 µl

X ≥ 100 GB

≥ 4 nM

≥ 20 µl

Corsia singola (Illumina)

piattaforma

Concentrazione (qPCR/nM)

Volume

HiSeq X Ten

≥ 2 nM

≥ 20 µl

NovaSeq 6000SP

≥ 1 nM

≥ 25 µl

NovaSeq 6000 S4

≥ 1,5 nM

≥ 25 µl

NovaSeqX

≥ 1,5 nM

≥ 25 µl

BGI-DNBSEQ-T7

≥ 1,5 nM

≥ 25 µl

 Oltre alla concentrazione e alla quantità totale, è necessario anche un adeguato schema dei picchi.

 

Vi preghiamo di contattarci se i vostri campioni non soddisfano i requisiti del materiale di partenza.

Flusso di lavoro del servizio

preparazione del campione

Controllo di qualità della biblioteca

Sequenziamento

Sequenziamento

Analisi dei dati

Controllo della qualità dei dati

Controllo qualità del campione

Consegna del progetto


  • Precedente:
  • Prossimo:

  • Rapporto QC della libreria

    Prima del sequenziamento viene fornito un rapporto sulla qualità della libreria, valutando la quantità e la frammentazione della libreria.

     

    Rapporto di controllo qualità del sequenziamento

     

    Tabella 1. Statistiche sui dati di sequenziamento.

    ID campione

    BMKID

    Letture crude

    Dati grezzi (bp)

    Letture pulite (%)

    Q20(%)

    Q30(%)

    GA(%)

    C_01

    BMK_01

    22.870.120

    6.861.036.000

    96,48

    99.14

    94,85

    36.67

    C_02

    BMK_02

    14.717.867

    4.415.360.100

    96,00

    98,95

    93,89

    37.08

    Figura 1. Distribuzione della qualità lungo le letture in ciascun campione

    A9

    Figura 2. Distribuzione del contenuto di base

    A10

    Figura 3. Distribuzione dei contenuti letti nei dati di sequenziamento

    A11

     

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