-
జీనోమ్-వైడ్ అసోసియేషన్ విశ్లేషణ
జీనోమ్-వైడ్ అసోసియేషన్ స్టడీ (GWAS) నిర్దిష్ట లక్షణాలతో (ఫినోటైప్) అనుబంధించబడిన జన్యు వైవిధ్యాలను (జెనోటైప్) గుర్తించడం లక్ష్యంగా పెట్టుకుంది.GWAS అధ్యయనం పెద్ద సంఖ్యలో వ్యక్తుల యొక్క జన్యు గుర్తులను క్రాస్ మొత్తం జన్యువును పరిశోధిస్తుంది మరియు జనాభా స్థాయిలో గణాంక విశ్లేషణ ద్వారా జన్యురూపం-సమలక్షణ అనుబంధాలను అంచనా వేస్తుంది.మానవ వ్యాధులు మరియు జంతువులు లేదా మొక్కల సంక్లిష్ట లక్షణాలపై క్రియాత్మక జన్యు మైనింగ్ పరిశోధనలో ఇది విస్తృతంగా వర్తించబడింది.
-
సింగిల్-న్యూక్లియస్ RNA సీక్వెన్సింగ్
సింగిల్ సెల్ క్యాప్చర్‌లో పురోగతి మరియు వ్యక్తిగత లైబ్రరీ నిర్మాణ సాంకేతికత హై-త్రూపుట్ సీక్వెన్సింగ్‌తో కలిపి సెల్-బై-సెల్ ప్రాతిపదికన జన్యు వ్యక్తీకరణ అధ్యయనాలను అనుమతిస్తుంది.ఇది సంక్లిష్ట కణ జనాభాపై లోతైన మరియు పూర్తి సిస్టమ్ విశ్లేషణను ప్రారంభిస్తుంది, దీనిలో అన్ని కణాల సగటును తీసుకోవడం ద్వారా వారి వైవిధ్యత యొక్క ముసుగును ఇది చాలా వరకు నివారిస్తుంది.
అయినప్పటికీ, కొన్ని కణాలు సింగిల్-సెల్ సస్పెన్షన్‌గా చేయడానికి తగినవి కావు, కాబట్టి ఇతర నమూనా తయారీ పద్ధతులు - కణజాలాల నుండి న్యూక్లియస్ వెలికితీత అవసరం, అనగా, న్యూక్లియస్ నేరుగా కణజాలం లేదా కణం నుండి సంగ్రహించబడుతుంది మరియు సింగిల్-న్యూక్లియస్ సస్పెన్షన్‌గా తయారు చేయబడుతుంది. సెల్ సీక్వెన్సింగ్.
BMK 10× జెనోమిక్స్ Chromium TM ఆధారిత సింగిల్-సెల్ RNA సీక్వెన్సింగ్ సేవను అందిస్తుంది.రోగనిరోధక కణాల భేదం, కణితి వైవిధ్యత, కణజాల అభివృద్ధి మొదలైన వ్యాధి సంబంధిత అధ్యయనాలపై ఈ సేవ విస్తృతంగా ఉపయోగించబడింది.
స్పేషియల్ ట్రాన్స్‌క్రిప్టోమ్ చిప్: 10× జెనోమిక్స్
ప్లాట్‌ఫారమ్: ఇల్యూమినా నోవాసెక్ ప్లాట్‌ఫారమ్
-
ప్లాంట్/యానిమల్ హోల్ జీనోమ్ సీక్వెన్సింగ్
WGS అని కూడా పిలువబడే హోల్ జీనోమ్ రీ-సీక్వెన్సింగ్, సింగిల్ న్యూక్లియోటైడ్ పాలిమార్ఫిజం (SNP), ఇన్సర్షన్ డిలీషన్ (InDel), స్ట్రక్చర్ వేరియేషన్ (SV) మరియు కాపీ నంబర్ వేరియేషన్ (CNV)తో సహా మొత్తం జన్యువుపై సాధారణ మరియు అరుదైన ఉత్పరివర్తనాలను బహిర్గతం చేస్తుంది. )SVలు SNPల కంటే వైవిధ్య బేస్‌లో ఎక్కువ భాగాన్ని కలిగి ఉంటాయి మరియు జీవులపై గణనీయమైన ప్రభావాన్ని చూపే జన్యువుపై ఎక్కువ ప్రభావాన్ని చూపుతాయి.లాంగ్-రీడ్ రీసీక్వెన్సింగ్ పెద్ద శకలాలు మరియు సంక్లిష్టమైన వైవిధ్యాలను మరింత ఖచ్చితంగా గుర్తించడానికి అనుమతిస్తుంది, ఎందుకంటే టెన్డం రిపీట్స్, GC/AT-రిచ్ రీజియన్‌లు మరియు హైపర్-వేరియబుల్ రీజియన్‌ల వంటి సంక్లిష్టమైన ప్రాంతాలపై క్రోమోజోమల్ క్రాసింగ్‌ను సుదీర్ఘ రీడ్‌లు చాలా సులభతరం చేస్తాయి.
వేదిక: ఇల్యూమినా, ప్యాక్‌బయో, నానోపోర్
-
BMKMANU S1000 స్పేషియల్ ట్రాన్స్‌క్రిప్టోమ్
రోగనిరోధక చొరబాటు, పిండం అభివృద్ధి మొదలైన వివిధ జీవ ప్రక్రియలలో కణాల ప్రాదేశిక సంస్థ కీలక పాత్ర పోషిస్తుంది. ప్రాదేశిక స్థానం యొక్క సమాచారాన్ని నిలుపుకుంటూ జన్యు వ్యక్తీకరణ ప్రొఫైలింగ్‌ని సూచించే స్పేషియల్ ట్రాన్స్‌క్రిప్టోమ్ సీక్వెన్సింగ్, ట్రాన్స్‌క్రిప్టోమ్-స్థాయి కణజాల నిర్మాణంలో గొప్ప అంతర్దృష్టులను అందిస్తుంది.సాంకేతికత అభివృద్ధితో, అల్ట్రా-క్లియర్ టిష్యూ పదనిర్మాణం మరియు ప్రాదేశిక పరమాణు వ్యక్తీకరణ యొక్క నిజమైన నిర్మాణ వ్యత్యాసాన్ని అధిక రిజల్యూషన్‌తో అధ్యయనం చేయాలి.BMKGENE నమూనాల నుండి జీవసంబంధమైన అంతర్దృష్టుల వరకు సమగ్రమైన, వన్-స్టాప్ స్పేషియల్ ట్రాన్స్‌క్రిప్టోమ్ సీక్వెన్సింగ్ సేవను అందిస్తుంది.
స్పేషియల్ ట్రాన్స్‌క్రిప్టోమిక్స్ టెక్నాలజీలు వైవిధ్యమైన నమూనాలలోని ప్రాదేశిక కంటెంట్‌తో జన్యు వ్యక్తీకరణ ప్రొఫైల్‌ను పరిష్కరించడం ద్వారా విభిన్న పరిశోధనా రంగంలో నవల దృక్కోణాలను బలపరిచాయి.
స్పేషియల్ ట్రాన్స్‌క్రిప్టోమ్ చిప్: BMKMANU S1000
ప్లాట్‌ఫారమ్: ఇల్యూమినా నోవాసెక్ ప్లాట్‌ఫారమ్
-
10x జెనోమిక్స్ విసియం స్పేషియల్ ట్రాన్స్‌క్రిప్టోమ్
విసియం స్పేషియల్ జీన్ ఎక్స్‌ప్రెషన్ అనేది మొత్తం mRNA ఆధారంగా కణజాలాన్ని వర్గీకరించడానికి ప్రధాన స్రవంతి స్పేషియల్ ట్రాన్స్‌క్రిప్టోమ్ సీక్వెన్సింగ్ టెక్నాలజీ.సాధారణ అభివృద్ధి, వ్యాధి పాథాలజీ మరియు క్లినికల్ ట్రాన్సేషనల్ రీసెర్చ్‌లో నవల అంతర్దృష్టులను కనుగొనడానికి మొత్తం ట్రాన్స్‌క్రిప్టోమ్‌ను పదనిర్మాణ సందర్భంతో మ్యాప్ చేయండి.BMKGENE నమూనాల నుండి జీవసంబంధమైన అంతర్దృష్టుల వరకు సమగ్రమైన, వన్-స్టాప్ స్పేషియల్ ట్రాన్స్‌క్రిప్టోమ్ సీక్వెన్సింగ్ సేవను అందిస్తుంది.
స్పేషియల్ ట్రాన్స్‌క్రిప్టోమిక్స్ టెక్నాలజీలు భిన్నమైన నమూనాలలోని ప్రాదేశిక కంటెంట్‌తో జన్యు వ్యక్తీకరణ ప్రొఫైల్‌ను పరిష్కరించడం ద్వారా విభిన్న పరిశోధనా రంగంలో నవల దృక్కోణాలను బలపరిచాయి.
స్పేషియల్ ట్రాన్స్‌క్రిప్టోమ్ చిప్: 10x జెనోమిక్స్ విసియం
వేదిక:ఇల్యూమినా నోవాసెక్ ప్లాట్‌ఫారమ్
-
పూర్తి-నిడివి mRNA సీక్వెన్సింగ్-నానోపోర్
RNA సీక్వెన్సింగ్ సమగ్ర ట్రాన్స్క్రిప్ట్ విశ్లేషణ కోసం ఒక అమూల్యమైన సాధనం.నిస్సందేహంగా, సాంప్రదాయ షార్ట్-రీడ్ సీక్వెన్సింగ్ ఇక్కడ అనేక ముఖ్యమైన అభివృద్ధిని సాధించింది.అయినప్పటికీ, ఇది తరచుగా పూర్తి-నిడివి ఐసోఫార్మ్ గుర్తింపులు, పరిమాణీకరణ, PCR బయాస్‌లో పరిమితులను ఎదుర్కొంటుంది.
నానోపోర్ సీక్వెన్సింగ్ ఇతర సీక్వెన్సింగ్ ప్లాట్‌ఫారమ్‌ల నుండి వేరుగా ఉంటుంది, దీనిలో న్యూక్లియోటైడ్‌లు DNA సంశ్లేషణ లేకుండా నేరుగా చదవబడతాయి మరియు పదుల కిలోబేస్‌ల వద్ద ఎక్కువసేపు చదవబడతాయి.ఇది పూర్తి-నిడివి గల ట్రాన్‌స్క్రిప్ట్‌లను నేరుగా చదవడానికి మరియు ఐసోఫార్మ్-స్థాయి అధ్యయనాలలో సవాళ్లను అధిగమించడానికి శక్తినిస్తుంది.
వేదిక:నానోపోర్ ప్రోమెథియాన్
గ్రంధాలయం:cDNA-PCR
-
పూర్తి-నిడివి mRNA సీక్వెన్సింగ్ -PacBio
డి నోవోపూర్తి-నిడివి ట్రాన్స్క్రిప్ట్ సీక్వెన్సింగ్, అని కూడా పిలుస్తారుడి నోవోIso-Seq PacBio సీక్వెన్సర్ యొక్క ప్రయోజనాలను రీడ్ లెంగ్త్‌లో తీసుకుంటుంది, ఇది ఎటువంటి విరామాలు లేకుండా పూర్తి-నిడివి గల cDNA అణువుల క్రమాన్ని అనుమతిస్తుంది.ఇది ట్రాన్స్క్రిప్ట్ అసెంబ్లీ దశల్లో ఉత్పన్నమయ్యే ఏవైనా లోపాలను పూర్తిగా నివారిస్తుంది మరియు ఐసోఫార్మ్-స్థాయి రిజల్యూషన్‌తో యూనిజీన్ సెట్‌లను నిర్మిస్తుంది.ఈ యూనిజీన్ సెట్‌లు ట్రాన్స్‌క్రిప్టోమ్ స్థాయిలో శక్తివంతమైన జన్యు సమాచారాన్ని "రిఫరెన్స్ జీనోమ్"గా అందిస్తాయి.అదనంగా, తదుపరి తరం సీక్వెన్సింగ్ డేటాతో కలిపి, ఈ సేవ ఐసోఫార్మ్-స్థాయి వ్యక్తీకరణ యొక్క ఖచ్చితమైన పరిమాణాన్ని బలపరుస్తుంది.
వేదిక: PacBio సీక్వెల్ IIలైబ్రరీ: SMRT బెల్ లైబ్రరీ -
యూకారియోటిక్ mRNA సీక్వెన్సింగ్-ఇల్యూమినా
mRNA సీక్వెన్సింగ్ నిర్దిష్ట పరిస్థితులలో కణాల నుండి లిప్యంతరీకరించబడిన అన్ని mRNAల ప్రొఫైలింగ్‌ను అనుమతిస్తుంది.జన్యు వ్యక్తీకరణ ప్రొఫైల్, జన్యు నిర్మాణాలు మరియు కొన్ని జీవ ప్రక్రియల పరమాణు విధానాలను బహిర్గతం చేయడానికి ఇది శక్తివంతమైన సాంకేతికత.ఈ రోజు వరకు, mRNA సీక్వెన్సింగ్ ప్రాథమిక పరిశోధన, క్లినికల్ డయాగ్నస్టిక్స్, డ్రగ్ డెవలప్‌మెంట్ మొదలైన వాటిలో విస్తృతంగా ఉపయోగించబడింది.
ప్లాట్‌ఫారమ్: ఇల్యూమినా నోవాసెక్ ప్లాట్‌ఫారమ్
-
నాన్-రిఫరెన్స్ ఆధారిత mRNA సీక్వెన్సింగ్-ఇల్యూమినా
కొన్ని ప్రత్యేక విధులు సక్రియం అవుతున్న నిర్దిష్ట వ్యవధిలో మెసెంజర్ RNA(mRNA) ఫారమ్ యూకారియోట్‌ను సంగ్రహించడానికి mRNA సీక్వెన్సింగ్ తదుపరి తరం సీక్వెన్సింగ్ టెక్నిక్ (NGS)ని అవలంబిస్తుంది.పొడవైన ట్రాన్స్క్రిప్ట్ స్ప్లైస్డ్ 'యునిజీన్' అని పిలువబడింది మరియు తదుపరి విశ్లేషణ కోసం రిఫరెన్స్ సీక్వెన్స్‌గా ఉపయోగించబడింది, ఇది రిఫరెన్స్ లేకుండా జాతుల పరమాణు యంత్రాంగాన్ని మరియు నియంత్రణ నెట్‌వర్క్‌ను అధ్యయనం చేయడానికి సమర్థవంతమైన సాధనం.
ట్రాన్స్‌క్రిప్టోమ్ డేటా అసెంబ్లీ మరియు యూనిజీన్ ఫంక్షనల్ ఉల్లేఖన తర్వాత
(1) SSR విశ్లేషణ, CDS అంచనా మరియు జన్యు నిర్మాణం ముందుగా రూపొందించబడతాయి.
(2) ప్రతి నమూనాలో యూనిజీన్ వ్యక్తీకరణ యొక్క పరిమాణీకరణ నిర్వహించబడుతుంది.
(3) నమూనాల (లేదా సమూహాలు) మధ్య భేదాత్మకంగా వ్యక్తీకరించబడిన యూనిజెన్‌లు యూనిజీన్ వ్యక్తీకరణ ఆధారంగా కనుగొనబడతాయి
(4) విభిన్నంగా వ్యక్తీకరించబడిన యూనిజెన్‌ల క్లస్టరింగ్, ఫంక్షనల్ ఉల్లేఖన మరియు సుసంపన్నత విశ్లేషణ నిర్వహించబడుతుంది
-
లాంగ్ నాన్-కోడింగ్ సీక్వెన్సింగ్-ఇల్యూమినా
లాంగ్ నాన్-కోడింగ్ RNAలు (lncRNAs) 200 nt కంటే ఎక్కువ పొడవు కలిగిన RNA అణువుల రకం, ఇవి చాలా తక్కువ కోడింగ్ సంభావ్యతతో ఉంటాయి.LncRNA, నాన్-కోడింగ్ RNAలలో కీలక సభ్యుడిగా, ప్రధానంగా న్యూక్లియస్ మరియు ప్లాస్మాలో కనుగొనబడుతుంది.సీక్వెన్సింగ్ టెక్నాలజీ మరియు బయోఇన్ఫర్టిక్స్‌లో అభివృద్ధి అనేక నవల lncRNAలను గుర్తించడానికి మరియు జీవసంబంధమైన విధులతో అనుబంధించడాన్ని అనుమతిస్తుంది.ఎపిజెనెటిక్ రెగ్యులేషన్, ట్రాన్స్క్రిప్షన్ రెగ్యులేషన్ మరియు పోస్ట్-ట్రాన్స్క్రిప్షన్ రెగ్యులేషన్‌లో lncRNA విస్తృతంగా పాల్గొంటుందని సంచిత ఆధారాలు సూచిస్తున్నాయి.
-
చిన్న RNA సీక్వెన్సింగ్-ఇల్యూమినా
చిన్న RNA అనేది మైక్రో RNA (miRNA), చిన్న జోక్యం RNA (siRNA) మరియు piwi-ఇంటరాక్టింగ్ RNA (piRNA)తో సహా సాధారణంగా 200nt కంటే తక్కువ పొడవు ఉండే నాన్-కోడింగ్ RNA అణువుల తరగతిని సూచిస్తుంది.
మైక్రోఆర్‌ఎన్‌ఏ (మిఆర్‌ఎన్‌ఎ) అనేది 20-24ఎన్టీల పొడవు కలిగిన ఎండోజెనస్ స్మాల్ ఆర్‌ఎన్‌ఏ తరగతి, ఇది కణాలలో వివిధ రకాల ముఖ్యమైన నియంత్రణ పాత్రలను పోషిస్తుంది.miRNA అనేక జీవిత ప్రక్రియలలో పాల్గొంటుంది, ఇది కణజాలం - నిర్దిష్ట మరియు దశ - నిర్దిష్ట వ్యక్తీకరణను బహిర్గతం చేస్తుంది మరియు వివిధ జాతులలో అత్యంత సంరక్షించబడుతుంది.
-
సర్క్ఆర్ఎన్ఎ సీక్వెన్సింగ్-ఇల్యూమినా
సర్క్‌ఆర్‌ఎన్‌ఏలు (సర్క్యులర్ ఆర్‌ఎన్‌ఏలు) అనేది 5′ ఎండ్ క్యాప్ మరియు 3′ ఎండ్ పాలీ(ఎ) టెయిల్ కంటే తక్కువగా ఉండే నాన్-కోడింగ్ ఆర్‌ఎన్‌ఏ అణువుల యొక్క ఒక తరగతి.CircRNAలు సమయోజనీయ బంధం ద్వారా వృత్తాకార నిర్మాణాన్ని నిర్వహిస్తాయి, ఇది RNA ఎక్సోన్యూకలీస్ జీర్ణక్రియకు వ్యతిరేకంగా స్థితి.జీవుల పెరుగుదల మరియు అభివృద్ధి మరియు బాహ్య వాతావరణానికి వాటి నిరోధకతలో circRNA ముఖ్యమైన పాత్ర పోషిస్తుంది.
CircRNA అనేక విధులను కలిగి ఉంది, ఇది పోటీగా miRNAని బంధిస్తుంది, జన్యు వ్యక్తీకరణను నియంత్రించడానికి ceRNA యొక్క నియంత్రణ పనితీరును అమలు చేస్తుంది.ఇటీవలి సంవత్సరాలలో, ఇది వ్యాధుల సంభవం మరియు అభివృద్ధికి దగ్గరి సంబంధం కలిగి ఉందని కూడా కనుగొనబడింది మరియు వ్యాధి నిర్ధారణ మార్కర్ల దిశలో గొప్ప అప్లికేషన్ అవకాశాలు ఉన్నాయి.
