హీట్మ్యాప్
హీట్మ్యాప్ సాధనం మ్యాట్రిక్స్ డేటా ఫైల్ను ఇన్పుట్గా అంగీకరిస్తుంది మరియు వినియోగదారులు డేటాను ఫిల్టర్ చేయడానికి, సాధారణీకరించడానికి మరియు క్లస్టర్ చేయడానికి అనుమతిస్తుంది. హీట్మ్యాప్ల కోసం ప్రాథమిక వినియోగ సందర్భం వివిధ నమూనాల మధ్య జన్యు వ్యక్తీకరణ స్థాయి యొక్క క్లస్టర్ విశ్లేషణ.
జన్యు ఉల్లేఖనం
జీన్ యానోటేషన్ సాధనం వివిధ డేటాబేస్లకు వ్యతిరేకంగా ఇన్పుట్ FASTA ఫైల్ల శ్రేణి అమరిక ఆధారంగా జన్యు యానోటేషన్ను నిర్వహిస్తుంది.
ప్రాథమిక స్థానిక అమరిక శోధన సాధనం (BLAST)
BLAST సాధనం అనేది NCBI BLAST యొక్క BMKCloud ఇంటిగ్రేటెడ్ వెర్షన్ మరియు BMKCloud ఖాతాకు అప్లోడ్ చేయబడిన డేటాను ఉపయోగించి అదే విధులను నిర్వహించడానికి ఉపయోగించవచ్చు.
CDS_UTR అంచనా
తెలిసిన ప్రోటీన్ డేటాబేస్లు మరియు ORF అంచనా ఫలితాలకు వ్యతిరేకంగా BLAST ఫలితాల ఆధారంగా ఇచ్చిన ట్రాన్స్క్రిప్ట్ సీక్వెన్స్లలో కోడింగ్ ప్రాంతాలు (CDS) మరియు నాన్-కోడింగ్ ప్రాంతాలు (UTR) అంచనా వేయడానికి CDS_UTR ప్రిడిక్షన్ సాధనం రూపొందించబడింది.
మాన్హట్టన్ ప్లాట్
మాన్హట్టన్ ప్లాట్ సాధనం అధిక నమూనా ప్రయోగాల ప్రదర్శనను అనుమతిస్తుంది మరియు దీనిని సాధారణంగా జీనోమ్-వైడ్ అసోసియేషన్ స్టడీస్ (GWAS)లో ఉపయోగిస్తారు.
సర్కోస్ రేఖాచిత్రం
CIRCOS డయాగ్రామ్ సాధనం జన్యు లక్షణం జన్యువు అంతటా ఎలా పంపిణీ చేయబడుతుందో సమర్థవంతంగా విజువలైజేషన్ చేస్తుంది. సాధారణ లక్షణాలలో పరిమాణాత్మక స్థానాలు, SNPలు, InDels, నిర్మాణాత్మక మరియు కాపీ సంఖ్య వైవిధ్యాలు ఉన్నాయి.
జీన్ ఆంటాలజీ (GO) ఎన్రిచ్మెంట్
GO ఎన్రిచ్మెంట్ సాధనం ఫంక్షనల్ ఎన్రిచ్మెంట్ విశ్లేషణను అందిస్తుంది. ఈ సాధనంలోని ప్రాథమిక సాఫ్ట్వేర్ టాప్గో-బయోకండక్టర్ ప్యాకేజీ, ఇందులో అవకలన వ్యక్తీకరణ విశ్లేషణ, GO ఎన్రిచ్మెంట్ విశ్లేషణ మరియు ఫలితాల విజువలైజేషన్ ఉంటాయి.
వెయిటెడ్ జీన్ కో-ఎక్స్ప్రెషన్ నెట్వర్క్ విశ్లేషణ (WGCNA)
WGCNA అనేది జన్యు సహ-వ్యక్తీకరణ మాడ్యూళ్ళను కనుగొనడానికి విస్తృతంగా ఉపయోగించే డేటా మైనింగ్ పద్ధతి. ఇది మైక్రోఅరే మరియు NGS జన్యు వ్యక్తీకరణ డేటాతో సహా వివిధ వ్యక్తీకరణ డేటాసెట్లకు వర్తిస్తుంది.
ఇంటర్ప్రోస్కాన్
ఇంటర్ప్రోస్కాన్ సాధనం ఇంటర్ప్రో ప్రోటీన్ సీక్వెన్స్ విశ్లేషణ మరియు వర్గీకరణను అందిస్తుంది.
గో కెగ్ ఎన్రిచ్మెంట్
GO KEGG ఎన్రిచ్మెంట్ సాధనం అనేది అందించిన జన్యు సమితి మరియు సంబంధిత ఉల్లేఖనం ఆధారంగా GO ఎన్రిచ్మెంట్ హిస్టోగ్రాం, KEGG ఎన్రిచ్మెంట్ హిస్టోగ్రాం మరియు KEGG ఎన్రిచ్మెంట్ పాత్వేను రూపొందించడానికి రూపొందించబడింది.