హీట్మ్యాప్
హీట్మ్యాప్ సాధనం ఒక మ్యాట్రిక్స్ డేటా ఫైల్ను ఇన్పుట్గా స్వీకరించి, డేటాను ఫిల్టర్ చేయడానికి, నార్మలైజ్ చేయడానికి మరియు క్లస్టర్ చేయడానికి వినియోగదారులను అనుమతిస్తుంది. వివిధ నమూనాల మధ్య జన్యు వ్యక్తీకరణ స్థాయి యొక్క క్లస్టర్ విశ్లేషణ చేయడమే హీట్మ్యాప్ల యొక్క ప్రాథమిక ఉపయోగం.
జన్యు వ్యాఖ్యానం
జీన్ అనొటేషన్ టూల్, ఇన్పుట్ ఫాస్టా ఫైల్లను వివిధ డేటాబేస్లతో సీక్వెన్స్ అలైన్మెంట్ చేయడం ఆధారంగా జీన్ అనొటేషన్ను నిర్వహిస్తుంది.
బేసిక్ లోకల్ అలైన్మెంట్ సెర్చ్ టూల్ (BLAST)
BLAST టూల్ అనేది NCBI BLAST యొక్క BMKCloud ఇంటిగ్రేటెడ్ వెర్షన్ మరియు BMKCloud ఖాతాకు అప్లోడ్ చేసిన డేటాను ఉపయోగించి అవే విధులను నిర్వహించడానికి దీనిని ఉపయోగించవచ్చు.
CDS_UTR అంచనా
CDS_UTR ప్రిడిక్షన్ టూల్ అనేది, తెలిసిన ప్రోటీన్ డేటాబేస్లకు వ్యతిరేకంగా చేసే BLAST ఫలితాలు మరియు ORF ప్రిడిక్షన్ ఫలితాల ఆధారంగా, ఇచ్చిన ట్రాన్స్క్రిప్ట్ సీక్వెన్స్లలోని కోడింగ్ రీజియన్లను (CDS) మరియు నాన్-కోడింగ్ రీజియన్లను (UTR) అంచనా వేయడానికి రూపొందించబడింది.
మాన్హాటన్ ప్లాట్
మాన్హట్టన్ ప్లాట్ సాధనం అధిక నమూనా ప్రయోగాలను ప్రదర్శించడానికి వీలు కల్పిస్తుంది మరియు సాధారణంగా జీనోమ్-వైడ్ అసోసియేషన్ స్టడీస్ (GWAS)లో ఉపయోగించబడుతుంది.
సర్కోస్ రేఖాచిత్రం
CIRCOS డయాగ్రామ్ సాధనం, జీనోమిక్ ఫీచర్లు జీనోమ్ అంతటా ఎలా పంపిణీ చేయబడ్డాయో సమర్థవంతంగా దృశ్యమానం చేస్తుంది. సాధారణ ఫీచర్లలో క్వాంటిటేటివ్ లోసై, SNPs, InDels, స్ట్రక్చరల్ మరియు కాపీ నంబర్ వేరియంట్లు ఉంటాయి.
జీన్ ఆంటాలజీ (GO) సుసంపన్నత
GO ఎన్రిచ్మెంట్ టూల్ ఫంక్షనల్ ఎన్రిచ్మెంట్ విశ్లేషణను అందిస్తుంది. ఈ టూల్లోని ప్రాథమిక సాఫ్ట్వేర్ TopGO-Bioconductor ప్యాకేజీ, ఇందులో డిఫరెన్షియల్ ఎక్స్ప్రెషన్ విశ్లేషణ, GO ఎన్రిచ్మెంట్ విశ్లేషణ మరియు ఫలితాల విజువలైజేషన్ ఉంటాయి.
వెయిటెడ్ జీన్ కో-ఎక్స్ప్రెషన్ నెట్వర్క్ అనాలిసిస్ (WGCNA)
WGCNA అనేది జన్యు సహ-వ్యక్తీకరణ మాడ్యూళ్లను కనుగొనడానికి విస్తృతంగా ఉపయోగించే ఒక డేటా మైనింగ్ పద్ధతి. ఇది మైక్రోఅరే మరియు NGS జన్యు వ్యక్తీకరణ డేటాతో సహా వివిధ వ్యక్తీకరణ డేటాసెట్లకు వర్తిస్తుంది.
ఇంటర్ప్రోస్కాన్
ఇంటర్ప్రోస్కాన్ సాధనం ఇంటర్ప్రో ప్రోటీన్ శ్రేణి విశ్లేషణ మరియు వర్గీకరణను అందిస్తుంది.
గో కెగ్ ఎన్రిచ్మెంట్
GO KEGG ఎన్రిచ్మెంట్ టూల్ అనేది, అందించిన జన్యు సమితి మరియు దానికి సంబంధించిన అనోటేషన్ ఆధారంగా GO ఎన్రిచ్మెంట్ హిస్టోగ్రామ్, KEGG ఎన్రిచ్మెంట్ హిస్టోగ్రామ్ మరియు KEGG ఎన్రిచ్మెంట్ పాత్వేను రూపొందించడానికి ఉద్దేశించబడింది.
