పరిణామాత్మక జన్యుశాస్త్రం
సేవా ప్రయోజనాలు
టకాగి మరియు ఇతరులు,మొక్కల జర్నల్, 2013
●సమగ్ర బయోఇన్ఫర్మేటిక్ విశ్లేషణ:జాతుల పరిణామ సామర్థ్యాన్ని ప్రతిబింబించే జన్యు వైవిధ్యాన్ని అంచనా వేయడానికి వీలు కల్పిస్తుంది మరియు కన్వర్జెంట్ పరిణామం మరియు సమాంతర పరిణామం యొక్క తక్కువ ప్రభావంతో జాతుల మధ్య నమ్మకమైన ఫైలోజెనెటిక్ సంబంధాన్ని వెల్లడిస్తుంది.
●ఐచ్ఛిక అనుకూలీకరించిన విశ్లేషణ: న్యూక్లియోటైడ్ మరియు అమైనో ఆమ్లాల స్థాయిలో వైవిధ్యాల ఆధారంగా విభేద సమయం మరియు వేగాన్ని అంచనా వేయడం వంటివి.
●విస్తృతమైన నైపుణ్యం మరియు ప్రచురణ రికార్డులు: BMKGene 15 సంవత్సరాలకు పైగా జనాభా మరియు పరిణామ జన్యుశాస్త్ర ప్రాజెక్టులలో అపారమైన అనుభవాన్ని సేకరించింది, వేలాది జాతులు మొదలైన వాటిని కవర్ చేసింది మరియు నేచర్ కమ్యూనికేషన్స్, మాలిక్యులర్ ప్లాంట్స్, ప్లాంట్ బయోటెక్నాలజీ జర్నల్ మొదలైన వాటిలో ప్రచురించబడిన 1000 కంటే ఎక్కువ ఉన్నత స్థాయి ప్రాజెక్టులకు దోహదపడింది.
● అత్యంత నైపుణ్యం కలిగిన బయోఇన్ఫర్మేటిక్స్ బృందం మరియు చిన్న విశ్లేషణ చక్రం: అధునాతన జన్యుశాస్త్ర విశ్లేషణలో గొప్ప అనుభవంతో, BMKGene బృందం వేగవంతమైన టర్నరౌండ్ సమయంతో సమగ్ర విశ్లేషణలను అందిస్తుంది.
● అమ్మకాల తర్వాత మద్దతు:మా నిబద్ధత ప్రాజెక్ట్ పూర్తి కాకుండా 3 నెలల అమ్మకాల తర్వాత సేవా వ్యవధిని అందిస్తుంది. ఈ సమయంలో, ఫలితాలకు సంబంధించిన ఏవైనా ప్రశ్నలను పరిష్కరించడానికి మేము ప్రాజెక్ట్ ఫాలో-అప్, ట్రబుల్షూటింగ్ సహాయం మరియు ప్రశ్నోత్తరాల సెషన్లను అందిస్తున్నాము.
సేవా లక్షణాలు మరియు అవసరాలు
| క్రమం రకం | సిఫార్సు చేయబడిన జనాభా స్కేల్ | సీక్వెన్సింగ్ వ్యూహం | న్యూక్లియోటైడ్ అవసరాలు |
| మొత్తం జీనోమ్ సీక్వెన్సింగ్ | ≥ 30 మంది వ్యక్తులు, ప్రతి ఉప సమూహం నుండి ≥ 10 మంది వ్యక్తులు
| 10x (10x) समानी | ఏకాగ్రత: ≥ 1 ng/ µL మొత్తం మొత్తం≥ 30ng క్షీణత లేదా కాలుష్యం పరిమితంగా లేదా అస్సలు లేదు |
| స్పెసిఫిక్-లోకస్ యాంప్లిఫైడ్ ఫ్రాగ్మెంట్ (SLAF) | ట్యాగ్ లోతు: 10x (10x) समानी ట్యాగ్ల సంఖ్య: <400 Mb: WGS సిఫార్సు చేయబడింది <1Gb: 100K ట్యాగ్లు 1 జిబి >2Gb: 300K ట్యాగ్లు గరిష్టంగా 500k ట్యాగ్లు | ఏకాగ్రత ≥ 5 ng/µL మొత్తం పరిమాణం ≥ 80 ng నానోడ్రాప్ OD260/280=1.6-2.5 అగరోస్ జెల్: క్షీణత లేదా కాలుష్యం లేదు లేదా పరిమితంగా ఉంటుంది.
|
సర్వీస్ వర్క్ ఫ్లో
ప్రయోగ రూపకల్పన
నమూనా డెలివరీ
లైబ్రరీ నిర్మాణం
సీక్వెన్సింగ్
డేటా విశ్లేషణ
అమ్మకాల తర్వాత సేవలు
సేవలో జనాభా నిర్మాణం (ఫైలోజెనెటిక్ ట్రీ, PCA, జనాభా స్తరీకరణ చార్ట్), జనాభా వైవిధ్యం మరియు జనాభా ఎంపిక (లింకేజ్ అస్వస్థత, ప్రయోజనకరమైన ప్రదేశాల ఎంపిక స్వీప్-ఎంపిక) విశ్లేషణ ఉంటుంది. ఈ సేవలో అనుకూలీకరించిన విశ్లేషణ (ఉదా. డైవర్జెన్స్ సమయం, జన్యు ప్రవాహం) కూడా ఉంటాయి.
*ఇక్కడ చూపబడిన డెమో ఫలితాలన్నీ BMKGENE తో ప్రచురించబడిన జన్యువుల నుండి వచ్చాయి.
1. పరిణామ విశ్లేషణలో జన్యు వైవిధ్యాల ఆధారంగా ఫైలోజెనెటిక్ చెట్టు నిర్మాణం, జనాభా నిర్మాణం మరియు PCA ఉంటాయి.
ఫైలోజెనెటిక్ చెట్టు సాధారణ పూర్వీకులతో జాతుల మధ్య వర్గీకరణ మరియు పరిణామ సంబంధాలను సూచిస్తుంది.
ఉప-జనాభా మధ్య సాన్నిహిత్యాన్ని దృశ్యమానం చేయడం PCA లక్ష్యం.
జనాభా నిర్మాణం యుగ్మ వికల్ప పౌనఃపున్యాల పరంగా జన్యుపరంగా విభిన్నమైన ఉప-జనాభా ఉనికిని చూపుతుంది.
చెన్, మరియు ఇతరులు,పిఎన్ఎఎస్, 2020
2.సెలెక్టివ్ స్వీప్
సెలెక్టివ్ స్వీప్ అనేది ఒక ప్రయోజనకరమైన సైట్ను ఎంచుకుని, లింక్ చేయబడిన తటస్థ సైట్ల ఫ్రీక్వెన్సీలను పెంచి, లింక్ చేయని సైట్ల ఫ్రీక్వెన్సీలను తగ్గించే ప్రక్రియను సూచిస్తుంది, దీని ఫలితంగా ప్రాంతీయత తగ్గుతుంది.
సెలెక్టివ్ స్వీప్ ప్రాంతాలలో జీనోమ్-వైడ్ డిటెక్షన్ అనేది అన్ని SNPల జనాభా జన్యు సూచిక (π，Fst, Tajima's D) ను నిర్దిష్ట దశలో (10 Kb) స్లైడింగ్ విండో (100 Kb) లోపల లెక్కించడం ద్వారా ప్రాసెస్ చేయబడుతుంది.
న్యూక్లియోటైడ్ వైవిధ్యం (π)
తాజిమా డి
స్థిరీకరణ సూచిక (Fst)
వు, మరియు ఇతరులు,మాలిక్యులర్ ప్లాంట్, 2018
3.జన్యు ప్రవాహం
వు, మరియు ఇతరులు,మాలిక్యులర్ ప్లాంట్, 2018
4. జనాభా చరిత్ర
జాంగ్, మరియు ఇతరులు,ప్రకృతి జీవావరణ శాస్త్రం & పరిణామం, 2021
5. డైవర్జెన్స్ సమయం
జాంగ్, మరియు ఇతరులు,ప్రకృతి జీవావరణ శాస్త్రం & పరిణామం, 2021
BMKGene యొక్క పరిణామాత్మక జన్యుశాస్త్ర సేవల ద్వారా సులభతరం చేయబడిన పురోగతులను ప్రచురణల సేకరణ ద్వారా అన్వేషించండి:
హస్సాన్యార్, ఎకె మరియు ఇతరులు (2023) 'హోల్-జీనోమ్ రీసీక్వెన్సింగ్ ద్వారా అపిస్ సెరానా సెరానా లార్వాలో సాక్బ్రూడ్ వైరస్ నిరోధకతతో అనుబంధించబడిన SNP మాలిక్యులర్ మార్కర్లు మరియు అభ్యర్థి జన్యువుల ఆవిష్కరణ',ఇంటర్నేషనల్ జర్నల్ ఆఫ్ మాలిక్యులర్ సైన్సెస్, 24(7). doi: 10.3390/IJMS24076238.
చాయ్, జె. మరియు ఇతరులు (2022) 'అడవి, జన్యుపరంగా స్వచ్ఛమైన చైనీస్ దిగ్గజం సాలమండర్ ఆవిష్కరణ కొత్త పరిరక్షణ అవకాశాలను సృష్టిస్తుంది',జంతుశాస్త్ర పరిశోధన, 2022, వాల్యూమ్. 43, సంచిక 3, పేజీలు: 469-480, 43(3), పేజీలు. 469–480. doi: 10.24272/J.ISSN.2095-8137.2022.101.
హాన్, ఎం. మరియు ఇతరులు (2022) 'క్వింఘై-టిబెటన్ పీఠభూమిపై స్వదేశీ ఎలిమస్ సిబిరికస్ ఎల్. యొక్క ఫైలోజియోగ్రాఫికల్ నమూనా మరియు జనాభా పరిణామ చరిత్ర',మొక్కల శాస్త్రంలో సరిహద్దులు, 13, పేజీ 882601. doi: 10.3389/FPLS.2022.882601/BIBTEX.
వాంగ్, జె. మరియు ఇతరులు (2022) 'క్రోమోజోమ్-స్థాయి జీనోమ్ అసెంబ్లీ మరియు లాంగన్ అనుబంధాల జనాభా జన్యుశాస్త్రం నుండి లాంగన్ పరిణామంలోకి జన్యుపరమైన అంతర్దృష్టులు',ఉద్యానవన పరిశోధన, 9. డిఓఐ: 10.1093/హెచ్ఆర్/యుహెచ్ఎసి021.
