ఉత్పత్తులు

*ఇక్కడ చూపిన డెమో ఫలితాలు అన్నీ బయోమార్కర్ టెక్నాలజీస్‌తో ప్రచురించబడిన జీనోమ్‌ల నుండి వచ్చినవి

1. క్రోమోజోమ్-స్థాయి జీనోమ్ అసెంబ్లీపై సర్కోస్G. రోటుండిఫోలియంనానోపోర్ సీక్వెన్సింగ్ ప్లాట్‌ఫారమ్ ద్వారా

వాంగ్ M మరియు ఇతరులు.,మాలిక్యులర్ బయాలజీ అండ్ ఎవల్యూషన్, 2021 

2.వీనింగ్ రై జీనోమ్ అసెంబ్లీ మరియు ఉల్లేఖన గణాంకాలు

లి జి మరియు ఇతరులు.,ప్రకృతి జన్యుశాస్త్రం, 2021

3. యొక్క జన్యు అంచనాసెచియం ఎడ్యూల్జన్యువు, మూడు అంచనా పద్ధతుల నుండి తీసుకోబడింది:డి నోవోప్రిడిక్షన్, హోమోలజీ ఆధారిత ప్రిడిక్షన్ మరియు RNA-Seq డేటా ఆధారిత ప్రిడిక్షన్

ఫు ఎ మరియు ఇతరులు.,హార్టికల్చర్ రీసెర్చ్, 2021

4.మూడు పత్తి జన్యువులలో చెక్కుచెదరకుండా దీర్ఘ టెర్మినల్ పునరావృతాల గుర్తింపు

వాంగ్ M మరియు ఇతరులు.,మాలిక్యులర్ బయాలజీ అండ్ ఎవల్యూషన్, 2021

5.హై-సి హీట్ మ్యాప్C. అక్యుమినాటాజీనోమ్-వైడ్ ఆల్-బై-అల్ ఇంటరాక్షన్‌లను చూపే జన్యువు.హై-సి పరస్పర చర్యల తీవ్రత కాంటిగ్‌ల మధ్య సరళ దూరానికి అనులోమానుపాతంలో ఉంటుంది.ఈ హీట్ మ్యాప్‌లోని శుభ్రమైన సరళ రేఖ క్రోమోజోమ్‌లపై కాంటిగ్‌ల యొక్క అత్యంత ఖచ్చితమైన యాంకరింగ్‌ను సూచిస్తుంది.(కాంటిగ్ యాంకరింగ్ నిష్పత్తి: 96.03%)

kang M మరియు ఇతరులు.,నేచర్ కమ్యూనికేషన్స్,2021

BMK కేసు

అధిక-నాణ్యత గల జీనోమ్ అసెంబ్లీ రై జెనోమిక్ లక్షణాలు మరియు వ్యవసాయపరంగా ముఖ్యమైన జన్యువులను హైలైట్ చేస్తుంది

ప్రచురించబడింది: ప్రకృతి జన్యుశాస్త్రం, 2021

సీక్వెన్సింగ్ వ్యూహం:

జీనోమ్ అసెంబ్లీ: 20 kb లైబ్రరీతో PacBio CLR మోడ్ (497 Gb, సుమారు 63×)
సీక్వెన్స్ కరెక్షన్: ఇల్యూమినా ప్లాట్‌ఫారమ్‌పై 270 bp DNA లైబ్రరీ (430 Gb, సుమారు 54×)తో NGS
కాంటిగ్స్ యాంకరింగ్: ఇల్యూమినా ప్లాట్‌ఫారమ్‌లో హై-సి లైబ్రరీ(560 Gb, సుమారు 71×)
ఆప్టికల్ మ్యాప్: (779.55 Gb, సుమారు 99×) బియోనానో ఐరిస్‌లో

కీలక ఫలితాలు

1.వీనింగ్ రై జీనోమ్ యొక్క అసెంబ్లీ మొత్తం జీనోమ్ పరిమాణం 7.74 Gbతో ప్రచురించబడింది (ఫ్లో సైటోమెట్రీ ద్వారా అంచనా వేయబడిన జీనోమ్ పరిమాణంలో 98.74%).ఈ అసెంబ్లీ యొక్క స్కాఫోల్డ్ N50 1.04 Gbని సాధించింది.93.67% కాంటిగ్‌లు 7 సూడో-క్రోమోజోమ్‌లపై విజయవంతంగా ఎంకరేజ్ చేయబడ్డాయి.ఈ అసెంబ్లీ లింకేజ్ మ్యాప్, LAI మరియు BUSCO ద్వారా మూల్యాంకనం చేయబడింది, దీని ఫలితంగా అన్ని మూల్యాంకనాల్లో అధిక స్కోర్లు వచ్చాయి.

2. కంపారిటివ్ జెనోమిక్స్, జెనెటిక్ లింకేజ్ మ్యాప్, ట్రాన్స్‌క్రిప్టోమిక్స్ స్టడీస్‌పై తదుపరి అధ్యయనాలు ఈ జన్యువు ఆధారంగా జరిగాయి.జీనోమ్-వైడ్ జీన్ డూప్లికేషన్స్ మరియు స్టార్చ్ బయోసింథసిస్ జన్యువులపై వాటి ప్రభావంతో సహా జన్యుపరమైన లక్షణాలకు సంబంధించిన లక్షణాల శ్రేణి వెల్లడైంది;కాంప్లెక్స్ ప్రోలమిన్ లోకీ యొక్క భౌతిక సంస్థ, జన్యు వ్యక్తీకరణ లక్షణాలు అంతర్లీనంగా ప్రారంభ శీర్షిక లక్షణం మరియు పుటేటివ్ పెంపకం-అనుబంధ క్రోమోజోమల్ ప్రాంతాలు మరియు రైలోని లోకీ.

వీనింగ్ రై జీనోమ్ యొక్క జన్యుపరమైన లక్షణాలపై సర్కోస్ రేఖాచిత్రం

రై జన్యువు యొక్క పరిణామ మరియు క్రోమోజోమ్ సంశ్లేషణ విశ్లేషణలు