రిఫరెన్స్ జీనోమ్తో mRNA-seq (NGS)
RNA-seq అనేది జీవ మరియు పంట శాస్త్రాలలో ఒక ప్రామాణిక సాధనం, ఇది జన్యువులు మరియు ప్రోటీమ్ల మధ్య అంతరాన్ని తగ్గిస్తుంది. కొత్త ట్రాన్స్క్రిప్ట్లను కనుగొనడం మరియు ఒకే పరీక్షలో వాటి వ్యక్తీకరణను లెక్కించడంలో దీని బలం ఉంది. ఇది తులనాత్మక ట్రాన్స్క్రిప్టోమిక్ అధ్యయనాలకు, వివిధ లక్షణాలు లేదా సమలక్షణాలకు సంబంధించిన జన్యువులపై వెలుగునిచ్చేందుకు, మ్యూటెంట్లను వైల్డ్-టైప్లతో పోల్చడం లేదా నిర్దిష్ట పరిస్థితులలో జన్యు వ్యక్తీకరణను బహిర్గతం చేయడం వంటి వాటి కోసం విస్తృతంగా ఉపయోగించబడుతుంది. BMKCloud mRNA(రిఫరెన్స్) APP ఎక్స్ప్రెషన్ క్వాంటిఫికేషన్, డిఫరెన్షియల్ ఎక్స్ప్రెషన్ అనాలిసిస్(DEG) మరియు సీక్వెన్స్ స్ట్రక్చర్ విశ్లేషణలను mRNA-seq(NGS) బయోఇన్ఫర్మేటిక్స్ పైప్లైన్లో అనుసంధానిస్తుంది మరియు సారూప్య సాఫ్ట్వేర్ యొక్క బలాలను మిళితం చేస్తుంది, సౌలభ్యం మరియు వినియోగదారు-స్నేహపూర్వకతను నిర్ధారిస్తుంది. వినియోగదారులు వారి RNA-seq డేటాను క్లౌడ్కి అప్లోడ్ చేయవచ్చు, ఇక్కడ యాప్ సమగ్రమైన, వన్-స్టాప్ బయోఇన్ఫర్మేటిక్ విశ్లేషణ పరిష్కారాన్ని అందిస్తుంది. అదనంగా, ఇది కస్టమర్ అనుభవానికి ప్రాధాన్యతనిస్తుంది, వినియోగదారుల నిర్దిష్ట అవసరాలకు అనుగుణంగా వ్యక్తిగతీకరించిన కార్యకలాపాలను అందిస్తుంది. వినియోగదారులు పారామితులను సెట్ చేసుకోవచ్చు మరియు పైప్లైన్ మిషన్ను స్వయంగా సమర్పించవచ్చు, ఇంటరాక్టివ్ నివేదికను తనిఖీ చేయవచ్చు, డేటా/రేఖాచిత్రాలను వీక్షించవచ్చు మరియు డేటా మైనింగ్ను పూర్తి చేయవచ్చు, అవి: లక్ష్య జన్యు ఎంపిక, ఫంక్షనల్ క్లస్టరింగ్, రేఖాచిత్రం మొదలైనవి.
వేదిక:ఇల్యూమినా, MGI
వ్యూహం:RNA-సీక్
లేఅవుట్: పారిడ్, క్లీన్-డేటా.
లైబ్రరీ రకం:fr-అన్స్ట్రాండెడ్, fr-ఫస్ట్స్ట్రాండ్ లేదా fr-సెకండ్స్ట్రాండ్
చదివిన నిడివి:150 బిపి
ఫైల్ రకం:*.fastq, *.fq, *.fastq.gz లేదా *.fq.gz. సిస్టమ్.fastq ఫైల్లను వాటి ఫైల్ పేర్ల ప్రకారం స్వయంచాలకంగా జత చేయండి,ఉదా. *_1.fastq *._2.fastq తో జత చేయబడింది.
నమూనాల సంఖ్య:సంఖ్యపై ఎటువంటి పరిమితులు లేవునమూనాల సంఖ్య పెరిగే కొద్దీ విశ్లేషణ సమయం పెరుగుతుంది, కానీనమూనాలు పెరుగుతాయి.
సిఫార్సు చేయబడిన డేటా మొత్తం:నమూనాకు 6G