mRNA-seq (NGS) ak jenòm referans
RNA-seq se yon zouti estanda nan tout syans lavi ak syans rekòt, ki konekte jenòm ak pwoteyòm. Fòs li se dekouvri nouvo transkripsyon epi quantifye ekspresyon yo nan yon sèl tès. Li lajman itilize pou etid transkriptomik konparatif, ki mete limyè sou jèn ki gen rapò ak divès karakteristik oswa fenotip, tankou konpare mutan ak tip sovaj oswa revele ekspresyon jèn anba kondisyon espesifik. BMKCloud mRNA (Referans) APP entegre quantifikasyon ekspresyon, analiz ekspresyon diferansyèl (DEG), ak analiz estrikti sekans nan tiyo byoenformatik mRNA-seq (NGS) la epi li konbine fòs lojisyèl menm jan an, pou asire konvenyans ak fasilite pou itilize. Itilizatè yo ka telechaje done RNA-seq yo nan nwaj la, kote Aplikasyon an ofri yon solisyon analiz byoenformatik konplè, yon sèl kote. Anplis de sa, li bay priyorite a eksperyans kliyan, li ofri operasyon pèsonalize adapte a bezwen espesifik itilizatè yo. Itilizatè yo ka fikse paramèt epi soumèt misyon tiyo a poukont yo, tcheke rapò entèaktif la, wè done/dyagram epi konplete eksplorasyon done, tankou: seleksyon jèn sib, gwoupman fonksyonèl, dyagram, elatriye.
Platfòm:Illumina, MGI
Estrateji:ARN-Seq
Layout: Parye, done pwòp.
Kalite bibliyotèk:fr-san fil, fr-premye fil oswa fr-dezyèm fil
Longè lekti:150 baz baz
Kalite fichye:*.fastq, *.fq, *.fastq.gz oubyen *.fq.gz. Sistèm nan apotomatikman pè fichye .fastq yo dapre non fichye yo,Pa egzanp *_1.fastq asosye avèk *._2.fastq.
Kantite echantiyon:Pa gen okenn restriksyon sou kantite aechantiyon yo, men tan analiz la ap ogmante pandan kantite echantiyon yo ap ogmante.echantiyon yo ap grandi.
Kantite Done Rekòmande:6G pou chak echantiyon