Heatmap
Fichye done matris yo itilize pou desen kat jeyografik chalè, ki ka filtre, nòmalize ak grap done matris yo.Li se sitou itilize pou analiz gwoup nan nivo ekspresyon jèn ant echantiyon diferan.
Gene Annotation
Anotasyon fonksyon jen yo fèt pa kat sekans nan dosye FASTA kont divès baz done.
Gene Annotation
Zouti debaz rechèch aliyman lokal yo
CDS_UTR_Prediksyon
Zouti sa a fèt pou predi rejyon kodaj (CDS) ak rejyon ki pa kodaj (UTR) nan sekans transkripsyon bay ki baze sou eksplozif kont baz done pwoteyin li te ye ak prediksyon ORF.
Konplo Manhattan
Konplo Manhattan pèmèt ekspozisyon done ak yon gwo kantite pwen done.Li se souvan itilize nan etid asosyasyon genomic-lajè (GWAS).
Circos
Dyagram CIRCOS pèmèt prezantasyon dirèk distribisyon SNP, InDeL, SV, CNV sou genòm.
GO_Anrichisman
TopGO se yon zouti ki fèt pou anrichisman fonksyonèl.Pake TopGO-Bioconductor konsiste analiz ekspresyon diferans, analiz anrichisman GO ak vizyalizasyon rezilta yo.Li pral jenere yon katab ak pwodiksyon ki rele "Graph", ki gen rezilta pou topGO_BP, topGO_CC ak topGO_MF.
WGCNA
WGCNA se yon metòd done min ki lajman itilize pou dekouvri modil ko-ekspresyon jèn yo.Li aplikab a divès kalite done ekspresyon ki gen ladan done mikro ak done ekspresyon jèn ki soti nan sekans pwochen jenerasyon an.
InterProScan
InterPro analiz sekans pwoteyin ak klasifikasyon
GO_KEGG_Anrichisman
Zouti sa a se konsepsyon pou jenere istogram anrichisman GO, istogram anrichisman KEGG ak chemen anrichisman KEGG ki baze sou seri jèn yo bay ak anotasyon ki koresponn lan.