-
Analiz Asosyasyon Genome-lajè
Genome-wide Association etid (GWAS) vize pou idantifye varyant jenetik (genotip) ki asosye ak karakteristik espesifik (fenotip).Etid GWAS envestige makè jenetik travèse genòm antye nan gwo kantite moun ak predi asosyasyon genotip-fenotip pa analiz estatistik nan nivo popilasyon an.Li te lajman aplike nan rechèch sou maladi imen ak min fonksyonèl jèn sou karakteristik konplèks nan bèt oswa plant yo.
-
Sekans RNA yon sèl-nwayo
Avansman nan kaptire selil sèl ak teknik konstriksyon bibliyotèk endividyèl konbine avèk sekans wo-debi pèmèt etid ekspresyon jèn sou baz selil pa selil.Li pèmèt yon analiz sistèm pi fon ak konplè sou popilasyon selil konplèks, kote li lajman evite maske eterojenite yo lè yo pran mwayèn nan tout selil yo.
Sepandan, kèk selil yo pa apwopriye pou yo fè nan sispansyon sèl-selil, kidonk lòt metòd preparasyon echantiyon - yo bezwen fè ekstraksyon nwayo soti nan tisi, se sa ki, nwayo yo ekstrè dirèkteman nan tisi oswa selil epi prepare nan sispansyon yon sèl-nwayo pou yon sèl-. sekans selilè.
BMK bay 10 × Genomics Chromium TM ki baze sou yon sèl selil RNA sèvis sekans.Sèvis sa a te lajman itilize nan etid sou etid ki gen rapò ak maladi, tankou diferansyasyon selil iminitè, eterojenite timè, devlopman tisi, elatriye.
Chip transcriptome espasyal: 10 × Genomics
Platfòm: Platfòm Illumina NovaSeq
-
Plant/Animal Whole Genome Sekans
Tout genomic re-sekans, ke yo rele tou WGS, pèmèt revele nan tou de mitasyon komen ak ra sou genòm nan antye ki gen ladan Single Nucleotide Polymorphism (SNP), Suppression Ensèsyon (InDel), Varyasyon Estrikti (SV), ak Varyasyon Nimewo Kopi (CNV). ).SV yo fòme yon pi gwo pòsyon nan baz varyasyon an pase SNP yo epi yo gen yon pi gwo enpak sou genòm nan, ki gen yon efè enpòtan sou òganis vivan yo.Resekans lekti long pèmèt pou idantifikasyon pi egzak nan fragman gwo ak varyasyon konplike paske lekti long fè li pi fasil travèse kwomozòm sou rejyon konplike tankou repete tandem, rejyon GC/AT ki rich, ak rejyon hyper-varyab.
Platfòm: Illumina, PacBio, Nanopore
-
BMKMANU S1000 Spatial Transcriptome
Òganizasyon espasyal nan selil jwe wòl enpòtan anpil nan divès pwosesis byolojik, tankou enfiltrasyon iminitè, devlopman anbriyon, elatriye. Sekans transcriptom espasyal, ki endike pwofil ekspresyon jèn pandan y ap kenbe enfòmasyon sou pozisyon espasyal, te bay gwo apèsi sou achitekti tisi transcriptome-nivo.Avèk devlopman teknoloji, mòfoloji tisi ultra-klè ak diferans reyèl estriktirèl ekspresyon molekilè espasyal yo bezwen etidye ak pi wo rezolisyon.BMKGENE bay sèvis konplè, yon sèl-stop sekans transcriptome espasyal soti nan echantiyon yo nan apèsi byolojik.
Teknoloji espasyal transcriptomics pèmèt nouvo pèspektiv nan divès domèn rechèch lè yo rezoud pwofil ekspresyon jèn ak kontni espasyal nan echantiyon etewojèn.
Chip transcriptom espasyal: BMKMANU S1000
Platfòm: Platfòm Illumina NovaSeq
-
10x Genomics Visium Spatial Transcriptome
Visium Spatial Gene Expression se yon teknoloji sekans transcriptom espasyal prensipal pou klasifye tisi ki baze sou mRNA total.Map transcriptome a antye ak kontèks mòfolojik pou dekouvri nouvo apèsi sou devlopman nòmal, patoloji maladi, ak rechèch tradiksyon klinik.BMKGENE bay sèvis konplè, yon sèl-stop sekans transcriptome espasyal soti nan echantiyon yo nan apèsi byolojik.
Teknoloji transcriptomics espasyal pèmèt nouvo pèspektiv nan divès domèn rechèch lè yo rezoud pwofil ekspresyon jèn ak kontni espasyal nan echantiyon eterojèn..
Chip transcriptom espasyal: 10x Genomics Visium
Platfòm:Platfòm Illumina NovaSeq
-
Full-Length mRNA Sekans-Nanopore
Sekans RNA se yon zouti anpil valè pou analiz transcriptom konplè.San dout, sekans tradisyonèl kout lekti reyalize anpil devlopman enpòtan isit la.Men, li souvan rankontre limit nan idantifikasyon izoform plen longè, quantification, patipri PCR.
Nanopore sekans distenge tèt li ak lòt platfòm sekans, nan ke nukleotid yo li dirèkteman san sentèz ADN epi jenere lekti long nan dè dizèn de kilobaz.Sa a pèmèt lekti dirèk travèse relve nòt plen longè ak abòde defi yo nan syans nan nivo isoform.
Platfòm：Nanopore PromethION
Bibliyotèk:cDNA-PCR
-
Tout longè mRNA sekans -PacBio
De novosekans transcriptom plen longè, ke yo rele touDe novoIso-Seq pran avantaj ki genyen nan sekansè PacBio nan longè li, ki pèmèt sekans molekil cDNA plen longè san okenn repo.Sa a konplètman evite nenpòt erè ki te pwodwi nan etap asanble transkripsyon ak konstwi seri unigene ak rezolisyon nivo isoform.Ansanm unigene sa a bay enfòmasyon jenetik pwisan kòm "referans genòm" nan nivo transcriptome.Anplis de sa, konbine avèk pwochen jenerasyon done sekans, sèvis sa a pèmèt yon quantification egzat nan ekspresyon nivo isoform.
Platfòm: PacBio Sequel IIBibliyotèk: SMRT bell library -
Eukaryotic mRNA Sekans-Illumina
Sekans mRNA pèmèt profilage tout mRNA transkripte nan selil yo nan kondisyon espesifik.Li se yon teknoloji pwisan pou revele pwofil ekspresyon jèn, estrikti jèn ak mekanis molekilè nan sèten pwosesis byolojik.Jiska dat, sekans mRNA te lajman itilize nan rechèch fondamantal, dyagnostik klinik, devlopman dwòg, elatriye.
Platfòm: Platfòm Illumina NovaSeq
-
Sekans mRNA ki pa baze sou referans-Illumina
Sekans mRNA adopte teknik sekans pwochen jenerasyon (NGS) pou pran mesaje RNA (mRNA) fòm Eukaryote nan peryòd espesifik ke kèk fonksyon espesyal yo aktive.Te transkripsyon ki pi long spliced yo rele 'Unigene' epi yo itilize kòm sekans referans pou analiz ki vin apre yo, ki se yon mwayen efikas pou etidye mekanis molekilè ak rezo regilasyon espès yo san referans.
Apre transcriptome done asanble ak anotasyon fonksyonèl unigene
(1) Analiz SSR, prediksyon CDS ak estrikti jèn yo pral prefòme.
(2) Kantifikasyon ekspresyon unigene nan chak echantiyon yo pral fèt.
(3) Yo pral dekouvri yonijèn ki eksprime diferan ant echantiyon (oswa gwoup) ki baze sou ekspresyon unijèn.
(4) Yo pral fè gwoupman, anotasyon fonksyonèl ak anrichisman analiz unigenes ki eksprime diferan.
-
Long ki pa kodaj sekans-Illumina
Long ki pa kodaj RNAs (lncRNAs) se yon kalite molekil RNA ak longè ki depase 200 nt, ki karakterize pa potansyèl kodaj ki ba anpil.LncRNA, kòm yon manm kle nan RNAs ki pa kodaj, yo jwenn sitou nan nwayo ak plasma.Devlopman nan teknoloji sekans ak bioinformtics pèmèt idantifikasyon anpil lncRNAs roman ak asosye sa yo ak fonksyon byolojik.Prèv akimilasyon sijere ke lncRNA se lajman patisipe nan règleman epigenetic, règleman transkripsyon ak règleman pòs-transkripsyon.
-
Ti RNA sekans-Illumina
Ti RNA refere a yon klas molekil RNA ki pa kode ki anjeneral mwens pase 200nt nan longè, ki gen ladan mikwo RNA (miRNA), ti entèferans RNA (siRNA), ak piwi-interacting RNA (piRNA).
MicroRNA (miRNA) se yon klas ti RNA andojèn ak yon longè apeprè 20-24nt, ki jwe yon varyete wòl regilasyon enpòtan nan selil yo.miRNA patisipe nan anpil pwosesis lavi ki revele tisi - espesifik ak etap - ekspresyon espesifik ak trè konsève nan diferan espès.
-
circRNA sekans-Illumina
CircRNAs (Sircular RNAs) se yon klas molekil RNA ki pa kode ki kout nan bouchon 5′ ak 3′ ke poli(A).CircRNAs fè estrikti sikilè pa lyezon kovalan an ki se estati kont dijesyon RNA exonukleaz.circRNA jwe yon wòl enpòtan nan kwasans ak devlopman nan òganis ak rezistans yo nan anviwònman an ekstèn.
CircRNA gen anpil fonksyon, ki ka konpetitivman mare miRNA, egzèse fonksyon regilasyon ceRNA, pou kontwole ekspresyon jèn.Nan dènye ane yo, li te jwenn tou ke li se pre relasyon ak ensidan an ak devlopman nan maladi, e li gen gwo kandida aplikasyon nan direksyon makè dyagnostik maladi ak sou sa.
