Sekansman Bisulfit Reprezantasyon Redwi (RRBS)
Sekansaj bisulfit reprezantasyon redwi (RRBS) depann sou anrichisman rejyon rich an zile CpG pa klivaj MspI ki te swiv pa seleksyon gwosè fragman 200-500/600 bps. Kidonk, se sèlman rejyon ki pi pre zile CpG yo ki sekansye, alòske sa yo ki gen zile CpG ki lwen yo eskli nan analiz la. Pwosesis sa a, konbine avèk sekansaj bisulfit, pèmèt deteksyon metilasyon ADN nan gwo rezolisyon, epi apwòch sekansaj la, PE150, konsantre espesyalman sou bout insert yo olye de mitan an, sa ki ogmante efikasite pwofilaj metilasyon an.
Teknik sa a vin tounen yon altènatif efikas e ki pa koute chè pou Sekansaj Bisulfit Jenòm Konplè (WGBS) nan rechèch metilasyon ADN. Pandan ke WGBS bay enfòmasyon konplè lè li egzamine tout jenòm lan nan yon rezolisyon yon sèl baz, pri ki wo li ka yon faktè limitatif, ke RRBS estratejikman diminye defi sa a lè li analize yon pòsyon reprezantatif nan jenòm lan yon fason selektif. Metodoloji sa a se yon zouti ki gen anpil valè ki pèmèt rechèch metilasyon ADN ki pa koute chè epi ki fè pwogrè nan konesans sou mekanis epigenetik yo.
Karakteristik Sèvis yo
● Sekansaj sou Illumina NovaSeq.
● Mande yon jenòm referans.
● Yo itilize ADN Lambda pou kontwole efikasite konvèsyon bisulfit.
● Yo kontwole efikasite dijesyon MspI a tou.
● Dijesyon doub anzim pou echantiyon plant yo.
Avantaj Sèvis yo
●Altènatif pri-efikas ak efikas pou WGBSLi pèmèt analiz la dwe fèt a yon pri ki pi ba epi avèk mwens bezwen echantiyon.
●Platfòm konplè:Nou bay yon sèvis ekselan konplè, depi pwosesis echantiyon, konstriksyon bibliyotèk, ak sekans pou rive nan analiz byoenformatik.
●Ekspètiz vasteNou reyisi nan yon pakèt espès divès. BMKGENE pote plis pase yon deseni eksperyans, yon ekip analiz ki trè kalifye, kontni konplè, ak yon ekselan sipò apre-lavant.
Espesifikasyon Sèvis yo
| Bibliyotèk | Estrateji Sekans | Done rekòmande pou sòti | Kontwòl kalite |
| Bibliyotèk dijere ak MspI epi trete ak Bisulfit | Illumina PE150 | 8 Gb | Q30 ≥ 85% Konvèsyon bisulfit > 99% Efikasite koupe MspI > 95% |
Egzijans Egzanp
| Konsantrasyon (ng/µL) | Kantite total (µg) |
| |
| ADN jenomik | ≥ 30 | ≥ 1 | Degradasyon oswa kontaminasyon limite |
Koule Travay Sèvis la
Livrezon echantiyon
Konstriksyon bibliyotèk
Sekansaj
Analiz done
Sèvis apre-lavant
Analiz BI a gen ladan l:
● Kontwòl kalite sekansaj kri;
● Map ak jenòm referans lan;
● Deteksyon baz metile 5mC ak idantifikasyon motif;
● Analiz distribisyon metilasyon ak konparezon echantiyon;
● Analiz Rejyon Metile Diferansyèlman (DMR);
● Anotasyon fonksyonèl jèn ki asosye ak DMR yo.
Kontwòl kalite: efikasite dijesyon (nan map jenòm)
Kontwòl kalite: konvèsyon bisulfit (nan ekstraksyon enfòmasyon metilasyon)
Kat metilasyon: distribisyon 5mC metilasyon nan tout jenòm lan
Konparezon echantiyon: Analiz Konpozan Prensipal
Analiz Rejyon Metile Diferansyèlman (DMR): kat chalè
Eksplore avansman rechèch yo fasilite pa sèvis sekansaj bisulfit jenòm konplè BMKGene yo atravè yon koleksyon piblikasyon byen òganize.
Li, Z. et al. (2022) 'Repwogramasyon wo-fidelite nan selil ki sanble ak Leydig pa aktivasyon CRISPR ak faktè parakrin',PNAS Nexus, 1(4). doi: 10.1093/PNASNEXUS/PGAC179.
Tian, H. et al. (2023) 'Analiz metilasyon ADN sou tout jenòm nan konpozisyon kò nan marasa monozigotik Chinwa',Jounal Ewopeyen pou Envestigasyon Klinik, 53(11), p. e14055. doi: 10.1111/ECI.14055.
Wu, Y. et al. (2022) 'Metilasyon ADN ak rapò ren-anch: yon etid asosyasyon sou tout epijenòm nan marasa monozigotik Chinwa',Jounal Envestigasyon Andokrinolojik, 45(12), pp 2365–2376. doi: 10.1007/S40618-022-01878-4.
