CircRNA Sekans-Illumina
Karakteristik
● rediksyon rRNA ki te swiv pa preparasyon bibliyotèk direksyon, ki pèmèt done sekans espesifik yo.
● Flux travay byoinformatik pèmèt prediksyon circRNA ak quantifikasyon ekspresyon
Avantaj sèvis yo
●Plis bibliyotèk RNA konplè:Nou itilize rediksyon rRNA olye de rediksyon RNA lineyè nan preparasyon anvan bibliyotèk nou an, asire ke done sekans yo gen ladan non sèlman circRNA, men tou mRNA ak lncRNA, sa ki pèmèt analiz ansanm nan seri done sa yo.
●Si ou vle analiz de rezo konpetitif andojèn RNA (ceRNA).: Bay pi fon Sur nan mekanis regilasyon selilè
●Ekspètiz vaste: Avèk yon dosye sou pwosesis plis pase 20,000 echantiyon nan BMKGENE, ki kouvri divès kalite echantiyon ak pwojè lncRNA, ekip nou an pote yon richès eksperyans nan chak pwojè.
●Kontwòl Kalite Rigour: Nou aplike pwen kontwòl debaz yo atravè tout etap, soti nan preparasyon echantiyon ak bibliyotèk jiska sekans ak byoenfòmatik. Siveyans metikuleu sa a asire akouchman an nan rezilta yo toujou bon jan kalite.
● Sipò apre lavant: Angajman nou pwolonje pi lwen pase fini pwojè ak yon peryòd sèvis apre-sale 3 mwa. Pandan tan sa a, nou ofri swivi pwojè, asistans depanaj, ak sesyon Q&A pou adrese nenpòt kesyon ki gen rapò ak rezilta yo.
Egzanp kondisyon ak livrezon
| Bibliyotèk | Platfòm | Done rekòmande | Done QC |
| rRNA apovri bibliyotèk direksyon | Illumina PE150 | 16-20 Gb | Q30≥85% |
Egzanp kondisyon:
Nukleotid:
| Konk. (ng/μl) | Kantite (μg) | Pite | Entegrite |
| ≥ 80 | ≥ 0.8 | OD260/280 = 1.7-2.5 OD260/230 = 0.5-2.5 Limite oswa pa gen okenn pwoteyin oswa kontaminasyon ADN yo montre sou jèl. | RIN≥6.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; limite oswa pa gen okenn elevasyon debaz |
● Plant yo:
Rasin, tij oswa petal: 450 mg
Fèy oswa Grenn: 300 mg
Fwi: 1.2 g
● Bèt:
Kè oswa entesten: 450 mg
Viscera oswa sèvo: 240 mg
Misk: 600 mg
Zo, cheve oswa po: 1.5g
● Atwopod:
Ensèk: 9g
Krustaze: 450 mg
● San antye:2 tib
● Selil: 106 selil yo
● Serom ak Plasma: 6 ml
Livrezon echantiyon rekòmande
Veso: 2 ml tib santrifujeur (Fil fèblan pa rekòmande)
Egzanp etikèt: Gwoup + replike egzanp A1, A2, A3; B1, B2, B3.
chajman:
1. Sèk-glas: Echantiyon yo bezwen chaje nan sache epi antere l nan glas sèk.
2. Tib RNAstable: echantiyon RNA yo ka seche nan tib estabilizasyon RNA (egzanp, RNAstable®) epi voye yo nan tanperati chanm.
Koule Travay Sèvis
Eksperyans konsepsyon
Livrezon echantiyon
RNA ekstraksyon
Konstriksyon bibliyotèk
Sekans
Analiz done
Sèvis apre-sale
Bioenfòmatik
circRNA prediksyon: distribisyon kwomozòm
circRNAs diferan eksprime - trase vòlkan
circRNAs diferan eksprime - clustering yerachik
Anrichisman fonksyonèl nan jèn lame circRNA a
Eksplore pwogrè rechèch yo fasilite pa sèvis sekans circRNA BMKGene yo atravè yon koleksyon piblikasyon òganize.
Wang, X. et al. (2021) 'CPSF4 kontwole fòmasyon circRNA ak microRNA medyatè silans jèn nan karsinom hepatocellular', Oncogene 2021 40:25, 40 (25), pp 4338-4351. doi: 10.1038/s41388-021-01867-6.
Xia, K. et al. (2023) 'X oo-responsive transcriptome revele wòl nan sikilè RNA133 nan rezistans maladi pa reglemante ekspresyon nan OsARAB nan diri', Phytopathology Research, 5 (1), pp 1-14. doi: 10.1186/S42483-023-00188-8/FIGURES/6.
Y, H. et al. (2023) 'CPSF3 modil balans lan nan transkripsyon sikilè ak lineyè nan karsinom epatoselilè'. doi: 10.21203/RS.3.RS-2418311/V1.
Zhang, Y. et al. (2023) 'Evalyasyon konplè nan circRNAs nan kardyopati siwotik anvan ak apre transplantasyon fwa', Immunofarmakoloji Entènasyonal, 114, p. 109495. doi: 10.1016/J.INTIMP.2022.109495.
