Sekans anplikon (16S/18S/ITS)

Amplicon (16S/18S/ITS) sekans ak Illumina se yon metòd pou analize divèsite mikwòb lè w idantifye pwofil mikwòb yo dapre sekans yo epi eseye dechifre richès ak divèsite kominote a nan chak echantiyon ak ant echantiyon yo. Tiyo BMKCloud Amplicon (NGS) pèmèt analiz 16S, 18S, ITS ak plizyè jèn fonksyonèl. Li kòmanse ak koupe lekti, asanblaj lekti ak evalyasyon kalite, ki te swiv pa gwoupman lekti menm jan an pou jenere Inite Taksonomi Operasyon (OTU) yo itilize nan sis seksyon analiz diferan. Anòt taksomik bay enfòmasyon sou abondans relatif ak konpozisyon chak echantiyon, pandan y ap analiz divèsite alfa ak beta konsantre sou divèsite mikwòb nan ak ant echantiyon yo, respektivman. Analiz diferans ant gwoup yo jwenn OTU ki diferan lè l sèvi avèk tès parametrik ak tès ki pa parametrik, pandan y ap analiz korelasyon gen rapò diferans sa yo ak faktè anviwònman an. Finalman, yo prevwa abondans jèn fonksyonèl ki baze sou abondans jèn makè, bay yon insight sou fonksyon ak ekoloji nan chak echantiyon.