● rediksyon rRNA ki te swiv pa preparasyon bibliyotèk mRNA direksyon.
● Sekans sou Illumina NovaSeq.
●Etidye chanjman ki fèt nan kominote mikwòb konplèks yo:Sa rive nan nivo transkripsyon an epi eksplore nouvo jèn potansyèl yo.
●Eksplike entèraksyon kominote mikwòb ak lame a oswa anviwònman an.
●Analiz Bioenfòmatik konplè: Sa a bay enfòmasyon sou konpozisyon taksonomik ak fonksyonèl nan kominote a, ansanm ak analiz diferan ekspresyon jèn.
●Anotasyon jenetik anpil:Sèvi ak baz done fonksyon jèn ajou pou enfòmasyon enfòmatif ekspresyon jèn nan kominote mikwòb yo.
●Sipò apre lavant:Angajman nou an pwolonje pi lwen pase fini pwojè ak yon peryòd sèvis apre-sale 3 mwa. Pandan tan sa a, nou ofri swivi pwojè, asistans depanaj, ak sesyon Q&A pou adrese nenpòt kesyon ki gen rapò ak rezilta yo.
Platfòm sekans | Estrateji sekans | Done rekòmande | Kontwòl Kalite Done |
Illumina NovaSeq | PE150 | 12Gb | Q30≥85% |
Konsantrasyon (ng/µL) | Kantite total (µg) | Volim (µL) | OD260/280 | OD260/230 | RIN |
≥50 | ≥1.0 | ≥20 | 1.8-2.0 | 1.0-2.5 | ≥6.5 |
Gen ladan analiz sa a:
● Sekans Kontwòl Kalite Done
● Transkripsyon Asanble
● Anotasyon taksonomi ak Abondans
● Fonksyonèl Anotasyon ak Abondans
● Kantifikasyon ekspresyon ak analiz diferans
Distribisyon taksonomi chak echantiyon:
Beta analiz divèsite: UPGMA
Anotasyon fonksyonèl - GO abondans
Abondans taksonomi diferans - LEFSE
Eksplore pwogrè ki fasilite sèvis sekans meta transcriptomics BMKGene a atravè yon koleksyon piblikasyon òganize.
Lu, Z. et al. (2023) 'Tolerans asid nan bakteri ki sèvi ak laktat nan lòd Bacteroidales kontribye nan prevansyon nan asidoz ruminal nan kabrit adapte nan yon rejim ki gen anpil konsantre',Nitrisyon bèt, 14, pp 130–140. doi: 10.1016/J.ANINU.2023.05.006.
Song, Z. et al. (2017) 'Debouche mikrobiota debaz fonksyonèl nan fèmantasyon tradisyonèl eta solid pa anplikon gwo-debi ak sekans metatranskriptomi',Fwontyè nan mikrobyoloji, 8(JUL). doi: 10.3389/FMICB.2017.01294/FULL.
Wang, W. et al. (2022) 'Nouvo mikoviris dekouvri nan yon sondaj Metatranscriptomics nan chanpiyon fitopatojèn Alternaria',Viris, 14(11), p. 2552. fè: 10.3390/V14112552/S1.
Wei, J. et al. (2022) 'Analiz metatranscriptome paralèl revele degradasyon metabolit segondè plant pa insect ak senbyon zantray yo',Molekilè Ekoloji, 31(15), pp 3999–4016. doi: 10.1111/MEC.16557.