-
Genome-jakejado Association Analysis
Iwadi ẹgbẹ-jakejado Genome (GWAS) ni ifọkansi lati ṣe idanimọ awọn iyatọ jiini (genotype) ti o ni nkan ṣe pẹlu awọn abuda kan pato (phenotype).Iwadi GWAS ṣe iwadii awọn asami jiini kọja gbogbo genome ti nọmba nla ti awọn eniyan kọọkan ati sọtẹlẹ awọn ẹgbẹ genotype-phenotype nipasẹ itupalẹ iṣiro ni ipele olugbe.O ti wa ni lilo pupọ ni iwadii lori awọn arun eniyan ati iwakusa jiini iṣẹ ṣiṣe lori awọn abuda eka ti awọn ẹranko tabi awọn irugbin.
-
Nikan- arin RNA Sequencing
Ilọsiwaju ni yiya sẹẹli ẹyọkan ati ilana iṣelọpọ ile ikawe ẹni kọọkan ni apapọ pẹlu ilana ṣiṣe-giga ngbanilaaye awọn iwadii ikosile jiini lori ipilẹ sẹẹli-nipasẹ-cell.O jẹ ki itupalẹ eto ti o jinlẹ ati pipe lori awọn olugbe sẹẹli ti o nipọn, ninu eyiti o yago fun boju-boju ti ilopọ wọn nipa gbigbe apapọ gbogbo awọn sẹẹli.
Bibẹẹkọ, diẹ ninu awọn sẹẹli ko dara lati ṣe si idaduro sẹẹli-ẹyọkan, nitorinaa awọn ọna igbaradi ayẹwo miiran - isediwon eeyan lati awọn tissu ni a nilo, iyẹn ni, a ti fa ekuro taara lati awọn tissues tabi sẹẹli ati pese sile sinu idadoro-orun kan fun ẹyọkan- sẹẹli lesese.
BMK n pese 10× Genomics ChromiumTM ti o da lori iṣẹ ṣiṣe atẹle sẹẹli-ẹyọkan RNA.Iṣẹ yii ti ni lilo pupọ ni awọn iwadii lori awọn iwadii ti o ni ibatan arun, gẹgẹbi iyatọ sẹẹli ti ajẹsara, ilopọ tumọ, idagbasoke ti ara, ati bẹbẹ lọ.
Chip transcriptome aaye: 10× Genomics
Syeed: Illumina NovaSeq 6000
-
Ohun ọgbin / Animal Gbogbo Jiome Sequencing
Gbogbo genome tun-tẹle, ti a tun mọ ni WGS, ngbanilaaye iṣafihan ti awọn iyipada ti o wọpọ ati ti o ṣọwọn lori gbogbo jiini pẹlu Nikan Nucleotide Polymorphism (SNP), Ifilọlẹ Ifibọ (InDel), Iyatọ igbekalẹ (SV), ati Iyatọ Nọmba Daakọ (CNV) ).Awọn SV ṣe ipin ti o tobi ju ti ipilẹ iyatọ ju awọn SNPs ati pe o ni ipa ti o tobi julọ lori genome, eyiti o ni ipa pataki lori awọn ohun alumọni alãye.Atunṣe kika gigun ngbanilaaye idanimọ deede diẹ sii ti awọn ajẹkù nla ati awọn iyatọ idiju nitori kika gigun jẹ ki o rọrun pupọ lati kọja chromosomal lori awọn agbegbe idiju bii awọn atunwi tandem, awọn agbegbe GC/AT-ọlọrọ, ati awọn agbegbe hyper-ayipada.
Platform: Illumina, PacBio, Nanopore
-
BMKMANU S1000 Spatial Transcriptome
Iṣeto aaye ti awọn sẹẹli ṣe ipa pataki ni ọpọlọpọ awọn ilana iṣe ti ibi, gẹgẹbi infiltration ajẹsara, idagbasoke ọmọ inu oyun, ati bẹbẹ lọ. Ilana itọka aye, eyiti o tọka si profaili ikosile pupọ lakoko idaduro alaye ti ipo aye, ti pese awọn oye nla sinu faaji ti ara ti o ni ipele transcriptome.Pẹlu idagbasoke ti imọ-ẹrọ, imọ-ara-ara-ara-pupọ ati iyatọ igbekale gidi ti ikosile molikula aye nilo lati ṣe iwadi pẹlu ipinnu giga.BMKGENE n pese okeerẹ, iṣẹ ṣiṣe itọka aye-iduro-ọkan kan lati awọn ayẹwo si awọn oye ti ibi.
Awọn imọ-ẹrọ transcriptomics aaye ni agbara awọn iwo aramada ni oriṣiriṣi aaye iwadii nipa ipinnu profaili ikosile pupọ pẹlu akoonu aye ni awọn apẹẹrẹ oniruuru.
Chip transcriptome aaye: BMKMANU S1000
Syeed: Illumina NovaSeq 6000
-
10x Genomics Visium Spatial Transcriptome
Ikosile Gene Visium Spatial jẹ imọ-ẹrọ ilana itọsẹ aye aye atijo fun tito lẹgbẹ ti o da lori lapapọ mRNA.Ṣe maapu gbogbo transcriptome pẹlu ọrọ-ọrọ nipa ẹda lati ṣawari awọn oye aramada si idagbasoke deede, ẹkọ nipa aisan, ati iwadii itumọ ile-iwosan.BMKGENE n pese okeerẹ, iṣẹ ṣiṣe itọka aye-iduro-ọkan kan lati awọn ayẹwo si awọn oye ti ibi.
Awọn imọ-ẹrọ transcriptomics aaye ni agbara awọn iwo aramada ni oriṣiriṣi aaye iwadii nipa ipinnu profaili ikosile pupọ pẹlu akoonu aye ni awọn apẹẹrẹ orisirisi..
Chip transcriptome aaye: 10x Genomics Visium
Syeed:Illumina NovaSeq 6000
-
Ipari-kikun mRNA Sequencing-Nanopore
Titele RNA ti jẹ ohun elo ti ko niye fun itupalẹ itupale transcriptome.Laisi iyemeji, ilana-kika kukuru ibile ti ṣaṣeyọri ọpọlọpọ idagbasoke pataki ni ibi.Bibẹẹkọ, o nigbagbogbo pade awọn idiwọn ni awọn idamọ isoform ni kikun-ipari, iwọn, irẹjẹ PCR.
Ilana Nanopore ṣe iyatọ si ararẹ lati awọn iru ẹrọ atẹle miiran, ni pe a ka awọn nucleotides taara laisi iṣelọpọ DNA ati pe o ṣẹda kika gigun ni mewa ti kilobases.Eyi n fun ni agbara kika-jade taara lila awọn iwe afọwọkọ gigun ni kikun ati koju awọn italaya ni awọn ikẹkọ ipele isoform.
Platform:Nanopore PromethION
Ile-ikawe:cDNA-PCR
-
Ipari mRNA ni kikun -PacBio
De novoIpari-kikun transcriptome lesese, tun mo biDe novoIso-Seq gba awọn anfani ti PacBio sequencer ni ipari kika, eyiti o jẹ ki ṣiṣe ilana ti awọn ohun elo cDNA gigun ni kikun laisi awọn isinmi eyikeyi.Eyi yago fun awọn aṣiṣe eyikeyi ti ipilẹṣẹ ni awọn igbesẹ apejọ tiransikiripiti ati kọ awọn eto unigene pẹlu ipinnu ipele-isoform.Eto unigene yii n pese alaye jiini ti o lagbara bi “genome itọkasi” ni ipele transcriptome.Ni afikun, apapọ pẹlu data atẹle iran ti nbọ, iṣẹ yii n fun ni agbara iwọn deede ti ikosile ipele isoform.
Platform: PacBio Sequel IILibrary: SMRT agogo ìkàwé -
Eukaryotic mRNA Sequencing-Ilumina
Atẹle mRNA ngbanilaaye profaili ti gbogbo awọn mRNA ti a gbasilẹ lati awọn sẹẹli labẹ awọn ipo kan pato.O jẹ imọ-ẹrọ ti o lagbara fun iṣafihan profaili ikosile pupọ, awọn ẹya pupọ ati awọn ilana molikula ti awọn ilana iṣe ti ibi kan.Titi di oni, tito lẹsẹsẹ mRNA ti ni iṣẹ lọpọlọpọ ni iwadii ipilẹ, awọn iwadii ile-iwosan, idagbasoke oogun, ati bẹbẹ lọ.
Syeed: Illumina NovaSeq 6000
-
Ti kii ṣe Itọkasi orisun mRNA Sequencing-Ilumina
mRNA sequencing gba ilana ilana atẹle-iran (NGS) lati mu ojiṣẹ RNA (mRNA) ṣe Eukaryote ni akoko kan pato ti awọn iṣẹ pataki kan n mu ṣiṣẹ.Tiransikiripiti pipọ ti o gunjulo ni a pe ni 'Unigene' ati pe a lo bi itọka itọka fun itupalẹ ti o tẹle, eyiti o jẹ ọna ti o munadoko lati ṣe iwadi ilana molikula ati nẹtiwọọki ilana ti ẹda laisi itọkasi.
Lẹhin apejọ data transcriptome ati asọye iṣẹ-ṣiṣe unigene
(1) Itupalẹ SSR, asọtẹlẹ CDS ati igbekalẹ apilẹṣẹ yoo jẹ tẹlẹ.
(2) Iṣiro ti ikosile unigene ni ayẹwo kọọkan yoo ṣee ṣe.
(3) Awọn unigenes ti a fihan ni iyatọ laarin awọn ayẹwo (tabi awọn ẹgbẹ) yoo ṣe awari da lori ikosile unigene
(4) Iṣiropọ, asọye iṣẹ-ṣiṣe ati itupalẹ imudara ti awọn unigenes ti a fihan ni iyatọ yoo ṣee ṣe
-
Gigun ti kii ṣe ifaminsi-Illumina
Awọn RNA ti kii ṣe ifaminsi gigun (lncRNAs) jẹ iru awọn ohun elo RNA kan pẹlu ipari ti o kọja 200 NT, eyiti o jẹ ijuwe nipasẹ agbara ifaminsi kekere pupọ.LncRNA, gẹgẹbi ọmọ ẹgbẹ bọtini ni awọn RNA ti kii ṣe ifaminsi, ni akọkọ ti a rii ni arin ati pilasima.Idagbasoke ni imọ-ẹrọ titele ati bioinformtics jẹ ki idanimọ ti ọpọlọpọ lncRNAs aramada ati darapọ awọn ti o ni awọn iṣẹ ti ibi.Awọn ẹri ikojọpọ daba pe lncRNA ni ipa pupọ ninu ilana epigenetic, ilana transcription ati ilana ilana transcription.
