-
Ilana Metagenomic (NGS)
Metagenome n tọka si akojọpọ awọn ohun elo jiini lapapọ ti agbegbe ti o dapọ ti awọn oganisimu, gẹgẹbi awọn metagenome ayika, metagenome eniyan, ati bẹbẹ lọ O ni awọn jinomes ti awọn microorganisms mejeeji ti o le gbin ati ti a ko le gbin ninu.Ilana ti Metagenomic jẹ ohun elo molikula ti a lo lati ṣe itupalẹ awọn ohun elo genomic ti o dapọ ti a fa jade lati inu awọn apẹẹrẹ ayika, eyiti o pese alaye alaye ni oniruuru eya ati opo, eto olugbe, ibatan phylogenetic, awọn jiini iṣẹ ati nẹtiwọọki ibamu pẹlu awọn ifosiwewe ayika.
Syeed:Illumina NovaSeq6000
-
Metagenomic Sequencing-Nanopore
Metagenomics jẹ ohun elo molikula ti a lo lati ṣe itupalẹ awọn ohun elo genomic ti o dapọ ti a fa jade lati inu awọn apẹẹrẹ ayika, eyiti o pese alaye alaye ni oniruuru eya ati opo, eto olugbe, ibatan phylogenetic, awọn jiini iṣẹ ati nẹtiwọọki ibamu pẹlu awọn ifosiwewe ayika, bbl Nanopore awọn iru ẹrọ ṣiṣe atẹle ti ṣafihan laipẹ. si awọn ẹkọ metagenomic.Iṣe to dayato si ni ipari kika ni ilọsiwaju pupọ si isalẹ ṣiṣan metagenomic, ni pataki apejọ metagenome.Gbigba awọn anfani ti kika-ipari, Nanopore-orisun metagenomic iwadi ni anfani lati se aseyori ijọ siwaju sii lemọlemọfún wé pẹlu shot-ibon metagenomics.O ti ṣe atẹjade pe awọn metagenomics ti o da lori Nanopore ni aṣeyọri ti ipilẹṣẹ pipe ati pipade awọn genomes kokoro arun lati awọn microbiomes (Moss, EL, et. al,Biotech Iseda, 2020)
Syeed:Nanopore PromethION P48
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
Subunit ti o wa lori 16S ati 18S rRNA ti o ni awọn mejeeji ni ipamọ giga ati awọn ẹkun-iyipada hyper jẹ itẹka molikula pipe fun idamọ awọn oganisimu prokaryotic ati eukaryotic.Ni anfani ti ṣiṣe atẹle, awọn amplicons wọnyi le jẹ ifọkansi ti o da lori awọn apakan ti a fipamọ ati awọn agbegbe hyper-ayipada ni a le ṣe afihan ni kikun fun idanimọ makirobia ti o ṣe idasi si awọn iwadii ti o bo itupalẹ oniruuru microbial, taxonomy, phylogeny, bbl. Ilana ti ipasẹ PacBio ngbanilaaye gbigba awọn kika gigun ti o peye gaan, eyiti o le bo awọn amplicons gigun ni kikun (isunmọ 1.5 Kb).Wiwo ti o gbooro ti aaye jiini ṣe alekun ipinnu gaan ni asọye eya ni awọn kokoro arun tabi agbegbe elu.
Syeed:PacBio Sequel II
-
16S / 18S / IT Amplicon Sequencing-NGS
16S/18S/ITS amplicon sequencing ni ifọkansi ni ṣiṣafihan phylogeny, taxonomy, ati opo eya ni agbegbe makirobia nipasẹ ṣiṣewadii awọn ọja PCR ti awọn asami jiini ti itọju ile ti o ni awọn ibaraẹnisọrọ mejeeji ati awọn ẹya hypervariable.Iṣafihan itẹka molikula pipe wọnyi nipasẹ Woeses et al, (1977) fi agbara fun profaili microbiome ti ko ni ipinya.Tito lẹsẹsẹ 16S (kokoro), 18S ( elu) ati Inu transcribed spacer(ITS, elu) ngbanilaaye idanimọ ti awọn ẹya lọpọlọpọ ati bii toje ati awọn eya ti a ko mọ.Imọ-ẹrọ yii ti di ohun elo ti o gbooro ati ohun elo pataki ni idamo akojọpọ makirobia ti o yatọ ni awọn agbegbe pupọ, gẹgẹbi ẹnu eniyan, ifun, feces, ati bẹbẹ lọ.
Syeed:Illumina NovaSeq6000
-
Kokoro ati olu Gbogbo Jiini Tun-sequencing
Bakteria ati olu gbogbo atunṣe-ara-ara jẹ ohun elo to ṣe pataki lati pari awọn genomes ti kokoro arun ti a mọ ati elu, bakannaa lati ṣe afiwe awọn genomes pupọ tabi lati ṣe maapu awọn genomes ti awọn oganisimu tuntun.O ṣe pataki pupọ lati tẹle gbogbo awọn genomes ti kokoro arun ati elu lati ṣe agbekalẹ awọn genomes itọkasi deede, lati ṣe idanimọ makirobia ati awọn iwadii jiini afiwera miiran.
Platform: Illumina NovaSeq 6000
-
Olu Genome
Awọn imọ-ẹrọ Biomarker n pese iwadii jiomejiini, jiini-daradara ati pene-pipe jiometirika ti olu da lori ibi-afẹde iwadii kan pato.Itọpa-ara-ara-ara, apejọ ati akọsilẹ iṣẹ-ṣiṣe le ṣee ṣe nipasẹ pipọpọ-iran-iran ti o tẹle + Atẹle iran kẹta lati ṣaṣeyọri apejọ genome ipele giga.Imọ-ẹrọ Hi-C tun le ṣe oojọ ti lati dẹrọ apejọ genome ni ipele chromosome.
Syeed:PacBio Sequel II
Nanopore PromethION P48
Illumina NovaSeq 6000
-
Awọn kokoro arun pipe Genome
Awọn imọ-ẹrọ Biomarker n pese iṣẹ ṣiṣe lẹsẹsẹ lori kikọ jiini pipe ti kokoro arun pẹlu aafo odo.Ṣiṣan iṣẹ akọkọ ti awọn kokoro arun pipe iṣelọpọ jiini pẹlu tito lẹsẹsẹ iran kẹta, apejọ, asọye iṣẹ-ṣiṣe ati itupalẹ bioinformatic ti ilọsiwaju ti nmu awọn ibi-afẹde iwadii kan pato ṣẹ.Ifitonileti pipe diẹ sii ti jiini kokoro arun n fun ni agbara ṣiṣafihan ti awọn ilana ipilẹ ti o wa labẹ awọn ilana ti ibi wọn, eyiti o tun le pese itọkasi ti o niyelori fun awọn iwadii jinomiki ni awọn eya eukaryotic ti o ga julọ.
Syeed:Nanopore PromethION P48 + Illumina NovaSeq 6000
PacBio Sequel II
