تسلسل أمبليكون (16S/18S/ITS)

تسلسل Amplicon (16S/18S/ITS) باستخدام Illumina هو طريقة لتحليل التنوع الميكروبي من خلال تحديد الأنماط الميكروبية وفقًا لتسلسلاتها، ثم محاولة فهم ثراء وتنوع المجتمع داخل كل عينة وبين العينات. يتيح خط أنابيب BMKCloud Amplicon (NGS) تحليل الجينات 16S و18S وITS والعديد من الجينات الوظيفية. يبدأ بتشذيب القراءات، وتجميع القراءات المزدوجة، وتقييم الجودة، يليه تجميع القراءات المتشابهة لتوليد وحدات تصنيفية تشغيلية (OTUs) تُستخدم في ستة أقسام تحليل مختلفة. يوفر الشرح التصنيفي معلومات حول الوفرة النسبية وتكوين كل عينة، بينما يركز تحليل التنوع ألفا وبيتا على التنوع الميكروبي داخل العينات وفيما بينها على التوالي. يكشف التحليل التفاضلي بين المجموعات عن اختلاف وحدات التصنيف التشغيلية باستخدام الاختبارات البارامترية وغير البارامترية، بينما يربط تحليل الارتباط هذه الاختلافات بالعوامل البيئية. أخيرًا، يتم التنبؤ بوفرة الجينات الوظيفية بناءً على وفرة الجينات المميزة، مما يوفر نظرة ثاقبة حول الوظيفة والبيئة في كل عينة.