
mRNA-seq (NGS) مع الجينوم المرجعي
RNA-SEQ هي أداة قياسية عبر علوم الحياة وعلوم المحاصيل ، وسد الفجوة بين الجينومات والبروتينات. تكمن قوتها في اكتشاف نصوص جديدة وقياس تعبيرها في اختبار واحد. يستخدم على نطاق واسع للدراسات النسبية النسبية ، وإلقاء الضوء على الجينات المتعلقة بالسمات أو الأنماط الظاهرية المختلفة ، مثل مقارنة المسوخ بالأنواع البرية أو الكشف عن التعبير الجيني في ظل ظروف محددة. يدمج APP BMKCloud mRNA (المرجع) تقدير التعبير ، تحليل التعبير التفاضلي (DEG) ، وتحليلات بنية التسلسل في خط أنابيب المعلومات الحيوية mRNA-SEQ (NGS) واضطهاد نقاط القوة في البرامج المماثلة ، مما يضمن الراحة والراحة المستخدم. يمكن للمستخدمين تحميل بيانات RNA-seq الخاصة بهم إلى السحابة ، حيث يوفر التطبيق حلًا شاملاً لمكافحة المعلومات الحيوية. بالإضافة إلى ذلك ، يعطي الأولوية لتجربة العملاء ، حيث يقدم عمليات مخصصة مصممة لتلبية الاحتياجات المحددة للمستخدمين. يمكن للمستخدمين تعيين المعلمات وإرسال مهمة خط الأنابيب بأنفسهم ، والتحقق من التقرير التفاعلي ، وعرض البيانات/المخططات واستكمال استخراج البيانات ، مثل: اختيار الجينات الهدف ، التجميع الوظيفي ، المخطط ، إلخ.
منصة:Illumina ، MGI
الاستراتيجية:RNA-seq
تَخطِيط: paried ، data clean.
نوع المكتبة:fr-unstranded ، FR-firststrand أو fr-secondstrand
قراءة الطول:150 نقطة أساس
نوع الملف:*.fastq ، *.fq ، *.fastq.gz أو *.fq.gz. سوف النظامإقران ملفات .fastq تلقائيًا وفقًا لأسماء الملفات ،على سبيل المثال *_1.fastq مقترنة مع *._ 2.fastq.
عدد العينات:لا توجد قيود على الرقممن العينات ، ولكن وقت التحليل سيزداد مع عددتنمو العينات.
كمية البيانات الموصى بها:6g لكل عينة