एम्पलिकन सिक्वेन्सिङ (१६S/१८S/ITS)

इलुमिनासँग एम्पलिकन (१६एस/१८एस/आईटीएस) अनुक्रमण भनेको माइक्रोबियल प्रोफाइलहरूलाई तिनीहरूको अनुक्रम अनुसार पहिचान गरेर र त्यसपछि प्रत्येक नमूना भित्र र नमूनाहरू बीचको समुदाय समृद्धि र विविधता बुझ्ने प्रयास गरेर माइक्रोबियल विविधताको विश्लेषण गर्ने विधि हो। BMKCloud एम्पलिकन (NGS) पाइपलाइनले १६एस, १८एस, आईटीएस र बहु ​​कार्यात्मक जीनहरूको विश्लेषणलाई अनुमति दिन्छ। यो पढ्ने ट्रिमिङ, जोडी-अन्त पढ्ने असेंबली र गुणस्तर मूल्याङ्कनबाट सुरु हुन्छ, त्यसपछि छ फरक विश्लेषण खण्डहरूमा प्रयोग हुने अपरेशनल ट्याक्सोनोमिक एकाइहरू (OTUs) उत्पन्न गर्न समान रीडहरूको क्लस्टरिङ हुन्छ। ट्याक्सोनोमिक एनोटेसनले प्रत्येक नमूनाको सापेक्षिक प्रशस्तता र संरचनाको बारेमा जानकारी प्रदान गर्दछ, जबकि अल्फा र बीटा विविधता विश्लेषणले नमूनाहरू भित्र र बीचको माइक्रोबियल विविधतामा ध्यान केन्द्रित गर्दछ। समूहहरू बीचको भिन्न विश्लेषणले प्यारामेट्रिक र गैर-प्यारामेट्रिक परीक्षणहरू प्रयोग गरेर फरक पर्ने OTU हरू फेला पार्छ, जबकि सहसम्बन्ध विश्लेषणले यी भिन्नताहरूलाई वातावरणीय कारकहरूसँग सम्बन्धित गर्दछ। अन्तमा, कार्यात्मक जीन प्रशस्तता मार्कर जीन प्रशस्तताको आधारमा भविष्यवाणी गरिन्छ, प्रत्येक नमूनामा कार्य र पारिस्थितिकीमा अन्तर्दृष्टि प्रदान गर्दछ।