Mpangilio wa Amplicon (16S/18S/ITS)

Mfuatano wa Amplicon (16S/18S/ITS) na Illumina ni njia ya kuchambua utofauti wa vijidudu kwa kutambua wasifu wa vijidudu kulingana na mfuatano wao na kisha kujaribu kufafanua utajiri na utofauti wa jamii ndani ya kila sampuli na kati ya sampuli. Bomba la BMKCloud Amplicon (NGS) huruhusu uchanganuzi wa jeni za 16S, 18S, ITS na jeni nyingi za utendaji kazi. Huanza na upunguzaji wa usomaji, mkusanyiko wa usomaji wa pande mbili na tathmini ya ubora, ikifuatiwa na kukusanywa kwa usomaji sawa ili kutoa Vitengo vya Utaksonomia vya Utendaji (OTUs) vinavyotumika katika sehemu sita tofauti za uchanganuzi. Maelezo ya taksonomia hutoa taarifa kuhusu wingi na muundo wa kila sampuli, huku uchanganuzi wa utofauti wa alpha na beta ukizingatia utofauti wa vijidudu ndani na kati ya sampuli, mtawalia. Uchanganuzi tofauti kati ya vikundi hupata OTU ambazo hutofautiana kwa kutumia vipimo vya parametric na visivyo vya parametric, huku uchanganuzi wa uwiano ukihusisha tofauti hizi na vipengele vya mazingira. Hatimaye, wingi wa jeni za utendaji kazi unatabiriwa kulingana na wingi wa jeni za alama, kutoa ufahamu kuhusu utendaji kazi na ikolojia katika kila sampuli.