تسلسل الميتا ترانسكريبتوم
ميزات الخدمة
● استنفاد الحمض النووي الريبوزي الريبوسومي متبوعًا بتحضير مكتبة الحمض النووي الريبوزي الرسول الموجه.
● التسلسل على جهاز Illumina NovaSeq.
مزايا الخدمة
●دراسة التغيرات التي تطرأ على المجتمعات الميكروبية المعقدة:يحدث هذا على مستوى النسخ الجيني، ويستكشف جينات جديدة محتملة.
●شرح تفاعلات المجتمعات الميكروبية مع المضيف أو البيئة.
●تحليل شامل للمعلوماتية الحيويةيوفر هذا رؤى حول التركيبات التصنيفية والوظيفية للمجتمع، بالإضافة إلى تحليل التعبير الجيني التفاضلي.
●شرح موسع للجينات:استخدام قواعد بيانات وظائف الجينات الحديثة للحصول على معلومات مفيدة حول التعبير الجيني للمجتمعات الميكروبية.
●دعم ما بعد البيع:يمتد التزامنا إلى ما بعد إتمام المشروع، حيث نقدم خدمة ما بعد البيع لمدة ثلاثة أشهر. خلال هذه الفترة، نوفر متابعة للمشروع، ومساعدة في حل المشكلات، وجلسات أسئلة وأجوبة للإجابة على أي استفسارات تتعلق بالنتائج.
مواصفات الخدمة
| منصة التسلسل | استراتيجية التسلسل | البيانات الموصى بها | مراقبة جودة البيانات |
| Illumina NovaSeq | PE150 | 12 جيجابايت | Q30 ≥ 85٪ |
متطلبات العينة
| التركيز (نانوغرام/ميكرولتر) | الكمية الإجمالية (ميكروغرام) | الحجم (ميكرولتر) | OD260/280 | OD260/230 | RIN |
| ≥50 | ≥1.0 | ≥20 | 1.8-2.0 | 1.0-2.5 | ≥6.5 |
سير عمل الخدمة
تسليم العينات
بناء المكتبة
التسلسل
تحليل البيانات
خدمات ما بعد البيع
يتضمن التحليل التالي:
● مراقبة جودة بيانات التسلسل
● تجميع النصوص
● التصنيف التكسونومي والوفرة
● التوصيف الوظيفي والوفرة
● قياس التعبير والتحليل التفاضلي
التوزيع التصنيفي لكل عينة:
تحليل التنوع البيئي: UPGMA
التوصيف الوظيفي – وفرة مصطلحات علم الجينات
وفرة التصنيف التفاضلي – LEFSE
استكشف التطورات التي سهّلتها خدمات تسلسل الميتا-ترانسكريبتومية من BMKGene من خلال مجموعة منتقاة من المنشورات.
لو، ز. وآخرون (2023) "تساهم قدرة البكتيريا المستخدمة لحمض اللاكتيك من رتبة البكتيرويديات على تحمل الحموضة في الوقاية من الحماض الكرشي لدى الماعز المتكيف مع نظام غذائي عالي التركيز".تغذية الحيوانات، 14، ص 130-140. دوى: 10.1016/J.ANINU.2023.05.006.
سونغ، ز. وآخرون (2017) "كشف النقاب عن الميكروبات الوظيفية الأساسية في التخمر التقليدي في الحالة الصلبة عن طريق تضخيم عالي الإنتاجية وتسلسل الميتا-ترانسكريبتوم".مجلة فرونتيرز في علم الأحياء الدقيقة، 8 (يوليو). doi: 10.3389/FMICB.2017.01294/FULL.
وانغ، و. وآخرون (2022) "اكتشاف فيروسات فطرية جديدة من خلال مسح الميتا-ترانسكريبتوميات لفطر Alternaria الممرض للنباتات"،الفيروسات، 14(11)، ص. 2552. doi: 10.3390/V14112552/S1.
Wei, J. et al. (2022) 'تحليل الميتا-ترانسكريبتوم المتوازي يكشف عن تحلل المستقلبات الثانوية النباتية بواسطة الخنافس والكائنات المتعايشة في أمعائها'،جزيئي علم البيئة، 31(15)، ص 3999–4016. دوى: 10.1111/MEC.16557.
