تسلسل ميتاتترانسكريبتوم
مميزات الخدمة
● استنفاد الرنا الريباسي (rRNA) متبوعًا بإعداد مكتبة mRNA الاتجاهية.
● التسلسل على Illumina NovaSeq.
مزايا الخدمة
●دراسة التغيرات في المجتمعات الميكروبية المعقدة:يحدث هذا على المستوى النسخي واستكشاف الجينات الجديدة المحتملة.
●شرح تفاعلات المجتمع الميكروبي مع المضيف أو البيئة.
●التحليل الشامل للمعلومات الحيوية: يوفر هذا رؤى حول التركيبات التصنيفية والوظيفية للمجتمع، بالإضافة إلى تحليل التعبير الجيني التفاضلي.
●شرح جيني واسع النطاق:استخدام قواعد بيانات وظائف الجينات الحديثة للحصول على معلومات مفيدة عن التعبير الجيني للمجتمعات الميكروبية.
●دعم ما بعد البيع:ويمتد التزامنا إلى ما هو أبعد من استكمال المشروع بفترة خدمة ما بعد البيع مدتها 3 أشهر. خلال هذا الوقت، نقدم متابعة المشروع، والمساعدة في استكشاف الأخطاء وإصلاحها، وجلسات أسئلة وأجوبة لمعالجة أي استفسارات تتعلق بالنتائج.
مواصفات الخدمة
| منصة التسلسل | استراتيجية التسلسل | البيانات الموصى بها | مراقبة جودة البيانات |
| إلومينا نوفا سيك | بي اي 150 | 12 جيجابايت | Q30≥85% |
متطلبات العينة
| التركيز (نانوغرام/ميليلتر) | المبلغ الإجمالي (ميكروغرام) | الحجم (ميليلتر) | أود260/280 | أود260/230 | رين |
| ≥50 | ≥1.0 | ≥20 | 1.8-2.0 | 1.0-2.5 | ≥6.5 |
تدفق عمل الخدمة
تسليم العينة
بناء المكتبة
التسلسل
تحليل البيانات
خدمات ما بعد البيع
يتضمن التحليل التالي:
● تسلسل مراقبة جودة البيانات
● نسخة الجمعية
● الشرح التصنيفي والوفرة
● الشرح الوظيفي والوفرة
● التعبير الكمي والتحليل التفاضلي
التوزيع التصنيفي لكل عينة:
تحليل تنوع بيتا: UPGMA
شرح وظيفي - وفرة GO
وفرة التصنيف التفاضلي – LEFSE
استكشف التطورات التي ساهمت في تسهيلها خدمات التسلسل التعريفي لـ BMKGene من خلال مجموعة منسقة من المنشورات.
لو، Z. وآخرون. (2023) "يساهم تحمل حمض البكتيريا التي تستخدم اللاكتات من رتبة Bacteroidales في الوقاية من الحماض الكرش في الماعز المتكيفة مع نظام غذائي عالي التركيز"،تغذية الحيوان، 14، ص 130-140. دوى: 10.1016/J.ANINU.2023.05.006.
سونغ، Z. وآخرون. (2017) "كشف الكائنات الحية الدقيقة الوظيفية الأساسية في تخمير الحالة الصلبة التقليدية عن طريق الأمبليكونات عالية الإنتاجية وتسلسل الميتاترانسكريبتوميكس"،الحدود في علم الأحياء الدقيقة, 8(يوليو). دوى: 10.3389/FMICB.2017.01294/FULL.
وانغ، دبليو وآخرون. (2022) "اكتشاف فيروسات فطرية جديدة من مسح Metatranscriptomics لفطر Alternaria المسبب للنبات"،الفيروسات، 14(11)، ص. 2552. دوى: 10.3390/V14112552/S1.
وي، J. وآخرون. (2022) "يكشف تحليل الميتاترنسريبتوم المتوازي عن تدهور المستقلبات الثانوية النباتية بواسطة الخنافس وتعايشها في الأمعاء"،جزيئي علم البيئة، 31(15)، ص 3999-4016. دوى: 10.1111/MEC.16557.
