-
تحليل الارتباط على مستوى الجينوم
تهدف دراسة الارتباط على مستوى الجينوم (GWAS) إلى تحديد المتغيرات الجينية (النمط الجيني) المرتبطة بسمات معينة (النمط الظاهري).تبحث دراسة GWAS في العلامات الجينية التي تعبر الجينوم الكامل لعدد كبير من الأفراد وتتوقع ارتباطات النمط الوراثي والنمط الظاهري من خلال التحليل الإحصائي على مستوى السكان.تم تطبيقه على نطاق واسع في البحث عن الأمراض البشرية والتعدين الوظيفي للجينات على السمات المعقدة للحيوانات أو النباتات.
-
تسلسل الحمض النووي الريبي أحادية النواة
يتيح التقدم في التقاط خلية واحدة وتقنية بناء المكتبة الفردية جنبًا إلى جنب مع التسلسل عالي الإنتاجية دراسات التعبير الجيني على أساس خلية تلو الأخرى.إنه يتيح إجراء تحليل أعمق وكامل للنظام على مجموعات الخلايا المعقدة ، حيث يتجنب إلى حد كبير إخفاء عدم تجانسها عن طريق أخذ متوسط جميع الخلايا.
ومع ذلك ، فإن بعض الخلايا ليست مناسبة لتحويلها إلى معلق أحادي الخلية ، لذلك هناك حاجة إلى طرق أخرى لتحضير العينة - استخراج النواة من الأنسجة ، أي أن النواة يتم استخلاصها مباشرة من الأنسجة أو الخلية وتحضيرها في تعليق أحادي النواة من أجل- تسلسل الخلية.
يوفر BMK خدمة تسلسل الحمض النووي الريبي أحادية الخلية القائمة على 10 × Genomics Chromium TM.تم استخدام هذه الخدمة على نطاق واسع في الدراسات المتعلقة بالدراسات المتعلقة بالأمراض ، مثل تمايز الخلايا المناعية ، وعدم تجانس الورم ، وتطور الأنسجة ، وما إلى ذلك.
شريحة النسخ المكانية: 10 × علم الجينوم
المنصة: Illumina NovaSeq 6000
-
تسلسل الجينوم الكامل للنبات / الحيوان
تتيح إعادة تسلسل الجينوم بالكامل ، والمعروفة أيضًا باسم WGS ، الكشف عن الطفرات الشائعة والنادرة في الجينوم بأكمله بما في ذلك تعدد الأشكال النوكليوتيد الفردي (SNP) ، وحذف الإدراج (InDel) ، وتباين الهيكل (SV) ، وتغير رقم النسخ (CNV) ).تشكل SVs جزءًا أكبر من قاعدة التباين من SNPs ولها تأثير أكبر على الجينوم ، والذي له تأثير كبير على الكائنات الحية.تسمح إعادة تسلسل القراءة الطويلة بتحديد أكثر دقة للأجزاء الكبيرة والاختلافات المعقدة لأن القراءات الطويلة تجعل من الأسهل بكثير عبور الكروموسومات عبر مناطق معقدة مثل التكرارات الترادفية والمناطق الغنية بالـ GC / AT والمناطق شديدة التغير.
المنصة: Illumina ، PacBio ، Nanopore
-
نسخة BMKMANU S1000 المكانية
يلعب التنظيم المكاني للخلايا دورًا حيويًا في العمليات البيولوجية المختلفة ، مثل التسلل المناعي ، وتطور الأجنة ، وما إلى ذلك ، وقد قدم تسلسل النسخ المكاني ، الذي يشير إلى تحديد ملامح التعبير الجيني مع الاحتفاظ بمعلومات الموقع المكاني ، رؤى رائعة في بنية الأنسجة على مستوى النسخ.مع تطور التكنولوجيا ، يجب دراسة مورفولوجيا الأنسجة فائقة الوضوح والاختلاف الهيكلي الحقيقي للتعبير الجزيئي المكاني بدقة أعلى.يوفر BMKGENE خدمة تسلسل نسخ مكاني شامل وقفة واحدة من العينات إلى الرؤى البيولوجية.
مكنت تقنيات النسخ المكانية وجهات النظر الجديدة في مجالات البحث المتنوعة من خلال حل ملف تعريف التعبير الجيني بالمحتوى المكاني في العينات غير المتجانسة.
شريحة النسخ المكاني: BMKMANU S1000
المنصة: Illumina NovaSeq 6000
-
10x الجينوم فيزيوم نسخة مكانية
إن Visium Spatial Gene Expression هي تقنية تسلسل نسخ مكاني سائدة لتصنيف الأنسجة بناءً على إجمالي الرنا المرسال.ارسم خريطة كاملة بالسياق الصرفي لاكتشاف رؤى جديدة في التطور الطبيعي ، وعلم أمراض الأمراض ، والبحوث المترجمة السريرية.يوفر BMKGENE خدمة تسلسل نسخ مكاني شامل وقفة واحدة من العينات إلى الرؤى البيولوجية.
دعمت تقنيات النسخ المكانية وجهات نظر جديدة في مجالات بحثية متنوعة من خلال حل ملف تعريف التعبير الجيني بالمحتوى المكاني في العينات غير المتجانسة.
شريحة النسخ المكانية: 10x Genomics Visium
منصة:إلومينا نوفاسيك 6000
-
تسلسل كامل طول الرنا المرسال- Nanopore
كان تسلسل الحمض النووي الريبي أداة لا تقدر بثمن لتحليل النسخ الشامل.مما لا شك فيه أن التسلسل التقليدي للقراءة القصيرة حقق تطورات مهمة عديدة هنا.ومع ذلك ، فإنه غالبًا ما يواجه قيودًا في تحديدات الشكل الإسوي الكامل ، والتقدير الكمي ، وتحيز PCR.
يميز تسلسل Nanopore نفسه عن منصات التسلسل الأخرى ، حيث تتم قراءة النيوكليوتيدات مباشرة بدون تخليق DNA وتولد قراءة طويلة في عشرات الكيلوبات.هذا يمكّن القراءة المباشرة من عبور النصوص الكاملة ومعالجة التحديات في دراسات المستوى الإسوي.
منصة：نانوبور بروميثيون
مكتبة:كدنا- PCR
-
تسلسل mRNA كامل الطول -PacBio
من جديدتسلسل نسخ كامل الطول ، المعروف أيضًا باسممن جديديستفيد Iso-Seq من مزايا جهاز التسلسل PacBio في طول القراءة ، والذي يتيح تسلسل جزيئات cDNA كاملة الطول دون أي فواصل.هذا يتجنب تمامًا أي أخطاء تم إنشاؤها في خطوات تجميع النص ويبني مجموعات unigene بدقة على مستوى الشكل الإسوي.توفر مجموعات unigene هذه معلومات وراثية قوية كـ "جينوم مرجعي" على مستوى الترنسكريبتوم.بالإضافة إلى ذلك ، بالدمج مع بيانات التسلسل من الجيل التالي ، تتيح هذه الخدمة تحديدًا كميًا دقيقًا للتعبير على مستوى الشكل الإسوي.
المنصة ： PacBio Sequel IIالمكتبة: مكتبة جرس SMRT -
تسلسل الحمض النووي الريبي حقيقية النواة- Illumina
يتيح تسلسل الرنا المرسال تنميط جميع الرنا المرسال المكتوبة من الخلايا في ظل ظروف محددة.إنها تقنية قوية للكشف عن ملف تعريف التعبير الجيني ، وهياكل الجينات والآليات الجزيئية لبعض العمليات البيولوجية.حتى الآن ، تم استخدام تسلسل الرنا المرسال على نطاق واسع في الأبحاث الأساسية والتشخيص السريري وتطوير الأدوية وما إلى ذلك.
المنصة: Illumina NovaSeq 6000
-
تسلسل الرنا المرسال غير القائم على المرجع - Illumina
يعتمد تسلسل mRNA على تقنية تسلسل الجيل التالي (NGS) لالتقاط الحمض النووي الريبي المرسال (mRNA) من حقيقيات النوى في فترة محددة يتم تنشيط بعض الوظائف الخاصة.كان يُطلق على أطول نسخة تم تقطيعها اسم "Unigene" واستخدمت كتسلسل مرجعي للتحليل اللاحق ، وهي وسيلة فعالة لدراسة الآلية الجزيئية والشبكة التنظيمية للأنواع دون الرجوع إليها.
بعد تجميع بيانات النسخ والتعليق التوضيحي الوظيفي
(1) سيتم إجراء تحليل SSR وتنبؤ CDS وهيكل الجينات.
(2) سيتم إجراء القياس الكمي لتعبير unigene في كل عينة.
(3) سيتم اكتشاف unigenes المعبر عنها تفاضليًا بين العينات (أو المجموعات) بناءً على تعبير unigene
(4) سيتم إجراء التجميع والشرح الوظيفي وتحليل الإثراء للجينات المعبر عنها تفاضليًا
-
التسلسل الطويل غير المشفر- Illumina
RNAs الطويلة غير المشفرة (lncRNAs) هي نوع من جزيئات الحمض النووي الريبي التي يزيد طولها عن 200 nt ، والتي تتميز بإمكانية تشفير منخفضة للغاية.يوجد LncRNA ، كعضو رئيسي في الحمض النووي الريبي غير المشفر ، بشكل أساسي في النواة والبلازما.يتيح التطور في تكنولوجيا التسلسل والمعلومات الحيوية تحديد العديد من lncRNAs الجديدة وربط تلك بالوظائف البيولوجية.تشير الأدلة التراكمية إلى أن lncRNA متورط على نطاق واسع في تنظيم الوراثة اللاجينية وتنظيم النسخ وتنظيم ما بعد النسخ.
