-
تحليل الارتباط على نطاق الجينوم
تهدف دراسة الارتباط على مستوى الجينوم (GWAS) إلى تحديد المتغيرات الجينية (النمط الجيني) المرتبطة بسمات محددة (النمط الظاهري).تدرس دراسة GWAS العلامات الجينية عبر الجينوم الكامل لعدد كبير من الأفراد وتتنبأ بارتباطات النمط الوراثي بالنمط الظاهري من خلال التحليل الإحصائي على مستوى السكان.وقد تم تطبيقه على نطاق واسع في الأبحاث المتعلقة بالأمراض البشرية وتعدين الجينات الوظيفية على السمات المعقدة للحيوانات أو النباتات.
-
تسلسل الحمض النووي الريبي (RNA) أحادي النواة
التقدم في التقاط خلية واحدة وتقنية بناء المكتبة الفردية مع الجمع بين التسلسل عالي الإنتاجية يسمح بإجراء دراسات التعبير الجيني على أساس كل خلية على حدة.فهو يتيح إجراء تحليل أعمق وكامل للنظام على مجموعات الخلايا المعقدة، حيث يتجنب إلى حد كبير إخفاء عدم تجانسها عن طريق أخذ متوسط جميع الخلايا.
ومع ذلك، فإن بعض الخلايا ليست مناسبة لتحويلها إلى معلق أحادي الخلية، لذلك هناك حاجة إلى طرق أخرى لتحضير العينات - استخراج النواة من الأنسجة، أي يتم استخراج النواة مباشرة من الأنسجة أو الخلية وإعدادها في معلق أحادي النواة للتعليق المفرد. تسلسل الخلايا.
توفر BMK خدمة تسلسل الحمض النووي الريبي (RNA) أحادية الخلية المستندة إلى Genomics ChromiumTM 10×.تم استخدام هذه الخدمة على نطاق واسع في الدراسات المتعلقة بالأمراض، مثل تمايز الخلايا المناعية، وعدم تجانس الورم، وتطوير الأنسجة، وما إلى ذلك.
شريحة النسخ المكاني: 10 × الجينوم
المنصة: منصة Illumina NovaSeq
-
تسلسل الجينوم الكامل للنبات/الحيوان
تتيح عملية إعادة تسلسل الجينوم بالكامل، والمعروفة أيضًا باسم WGS، الكشف عن كل من الطفرات الشائعة والنادرة في الجينوم بأكمله بما في ذلك تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة (SNP)، وحذف الإدراج (InDel)، وتنوع البنية (SV)، وتباين أرقام النسخ (CNV). ).تشكل SVs جزءًا أكبر من قاعدة التباين مقارنة بـ SNPs ولها تأثير أكبر على الجينوم، والذي له تأثير كبير على الكائنات الحية.تسمح إعادة التسلسل للقراءة الطويلة بتحديد أكثر دقة للأجزاء الكبيرة والاختلافات المعقدة لأن القراءات الطويلة تجعل من الأسهل بكثير عبور الكروموسومات عبر المناطق المعقدة مثل التكرارات الترادفية والمناطق الغنية بـ GC/AT والمناطق شديدة التغير.
المنصة: إلومينا، باكبيو، نانوبور
-
BMKMANU S1000 النسخ المكاني
يلعب التنظيم المكاني للخلايا دورًا حيويًا في العمليات البيولوجية المختلفة، مثل التسلل المناعي، وتطور الأجنة، وما إلى ذلك. وقد وفر تسلسل النسخ المكاني، الذي يشير إلى تحديد ملامح التعبير الجيني مع الاحتفاظ بمعلومات الموضع المكاني، رؤى رائعة حول بنية الأنسجة على مستوى النسخ.مع تطور التكنولوجيا، يجب دراسة مورفولوجيا الأنسجة فائقة الوضوح والفرق الهيكلي الحقيقي للتعبير الجزيئي المكاني بدقة أعلى.توفر BMKGENE خدمة تسلسل النسخ المكاني الشاملة والشاملة من العينات إلى الرؤى البيولوجية.
مكّنت تقنيات النسخ المكانية وجهات نظر جديدة في مجالات بحثية متنوعة من خلال حل ملف تعريف التعبير الجيني مع المحتوى المكاني في العينات غير المتجانسة.
شريحة النسخ المكاني: BMKMANU S1000
المنصة: منصة Illumina NovaSeq
-
10x الجينوم فيزيوم النسخ المكاني
Visium Spatial Gene Expression هي تقنية تسلسل النسخ المكاني السائدة لتصنيف الأنسجة على أساس إجمالي الرنا المرسال.قم بتخطيط النص بأكمله مع السياق المورفولوجي لاكتشاف رؤى جديدة حول التطور الطبيعي، وعلم أمراض الأمراض، والأبحاث الانتقالية السريرية.توفر BMKGENE خدمة تسلسل النسخ المكاني الشاملة والشاملة من العينات إلى الرؤى البيولوجية.
مكّنت تقنيات النسخ المكانية وجهات نظر جديدة في مجالات بحثية متنوعة من خلال حل ملف تعريف التعبير الجيني مع المحتوى المكاني في العينات غير المتجانسة.
شريحة النسخ المكاني: 10x Genomics Visium
منصة:منصة إلومينا نوفا سيك
-
كامل طول تسلسل مرنا-نانوبوري
لقد كان تسلسل الحمض النووي الريبي (RNA) أداة لا تقدر بثمن لتحليل النسخ الشامل.مما لا شك فيه أن التسلسل التقليدي للقراءة القصيرة حقق العديد من التطورات المهمة هنا.ومع ذلك، فإنه غالبًا ما يواجه قيودًا في تحديدات الشكل الإسوي كامل الطول، والتقدير الكمي، وتحيز PCR.
يميز تسلسل Nanopore نفسه عن منصات التسلسل الأخرى، حيث تتم قراءة النيوكليوتيدات مباشرة دون تخليق الحمض النووي ويولد قراءة طويلة عند عشرات الكيلوبايات.وهذا يتيح القراءة المباشرة عبر النصوص الكاملة ومعالجة التحديات في الدراسات على مستوى الشكل الإسوي.
منصة:نانوبور بروميثيون
مكتبة:[كدنا-PCR].
-
كامل طول تسلسل مرنا -PacBio
من جديدتسلسل النسخ الكامل الطول، المعروف أيضًا باسممن جديديستفيد Iso-Seq من مزايا جهاز تسلسل PacBio في طول القراءة، والذي يتيح تسلسل جزيئات [كدنا] كاملة الطول دون أي انقطاع.يؤدي هذا إلى تجنب أي أخطاء تنشأ في خطوات تجميع النص بشكل كامل وإنشاء مجموعات unigene بدقة على مستوى الشكل المتساوي.توفر مجموعات unigene هذه معلومات وراثية قوية باعتبارها "جينومًا مرجعيًا" على مستوى النسخ.بالإضافة إلى ذلك، من خلال الجمع بين بيانات التسلسل من الجيل التالي، تتيح هذه الخدمة إجراء تقدير كمي دقيق للتعبير على مستوى الشكل الإسوي.
المنصة: PacBio Sequel IIالمكتبة: مكتبة الجرس SMRT -
حقيقيات النواة mRNA تسلسل-إلومينا
يتيح تسلسل mRNA تحديد ملامح جميع جزيئات mRNA المنقولة من الخلايا في ظل ظروف محددة.إنها تقنية قوية للكشف عن ملف تعريف التعبير الجيني والهياكل الجينية والآليات الجزيئية لبعض العمليات البيولوجية.حتى الآن، تم استخدام تسلسل mRNA على نطاق واسع في الأبحاث الأساسية، والتشخيص السريري، وتطوير الأدوية، وما إلى ذلك.
المنصة: منصة Illumina NovaSeq
-
تسلسل mRNA غير المرجعي - Illumina
يعتمد تسلسل mRNA تقنية تسلسل الجيل التالي (NGS) لالتقاط شكل حقيقيات النوى للرسول RNA (mRNA) في فترة محددة يتم فيها تنشيط بعض الوظائف الخاصة.أطول نسخة مقسمة كانت تسمى "Unigene" وتم استخدامها كتسلسل مرجعي للتحليل اللاحق، وهي وسيلة فعالة لدراسة الآلية الجزيئية والشبكة التنظيمية للأنواع دون مرجع.
بعد تجميع البيانات النصية والشرح الوظيفي unigene
(1) سيتم إجراء تحليل SSR وتنبؤ CDS وبنية الجينات مسبقًا.
(2) سيتم إجراء القياس الكمي للتعبير unigene في كل عينة.
(3) سيتم اكتشاف الجينات الأحادية المعبر عنها تفاضليًا بين العينات (أو المجموعات) بناءً على تعبير الجينات الأحادية
(4) سيتم إجراء التجميع والشرح الوظيفي وتحليل الإثراء للوحدات غير المعبر عنها تفاضليًا
-
تسلسل طويل غير مشفر - Illumina
إن RNAs الطويلة غير المشفرة (lncRNAs) هي نوع من جزيئات RNA التي يتجاوز طولها 200 nt، والتي تتميز بإمكانية تشفير منخفضة للغاية.LncRNA، كعضو رئيسي في RNAs غير المشفرة، يوجد بشكل رئيسي في النواة والبلازما.يتيح التطور في تكنولوجيا التسلسل والمعلوماتية الحيوية تحديد العديد من lncRNAs الجديدة وربطها بالوظائف البيولوجية.تشير الأدلة التراكمية إلى أن lncRNA يشارك على نطاق واسع في التنظيم اللاجيني، وتنظيم النسخ، وتنظيم ما بعد النسخ.
-
تسلسل الحمض النووي الريبي الصغير-إلومينا
يشير الحمض النووي الريبي الصغير (RNA) الصغير إلى فئة من جزيئات الحمض النووي الريبي (RNA) غير المشفرة التي عادة ما يكون طولها أقل من 200 nt، بما في ذلك الحمض النووي الريبي الصغير (miRNA)، والحمض النووي الريبي (RNA) ذو التداخل الصغير (siRNA)، والحمض النووي الريبي المتفاعل مع piwi (piRNA).
MicroRNA (miRNA) عبارة عن فئة من الحمض النووي الريبي الصغير الداخلي يبلغ طوله حوالي 20-24nt، والذي يلعب مجموعة متنوعة من الأدوار التنظيمية المهمة في الخلايا.يشارك miRNA في العديد من العمليات الحياتية التي تكشف عن تعبيرات محددة للأنسجة ومرحلة معينة ويتم حفظها بشكل كبير في الأنواع المختلفة.
-
تسلسل circRNA-Illumina
CircRNAs (RNAs الدائرية) هي فئة واحدة من جزيئات الحمض النووي الريبي (RNA) غير المشفرة التي يقل طولها عن 5 ′ نهاية وذيل 3 ′ نهاية بولي (A).تؤدي CircRNAs بنية دائرية بواسطة الرابطة التساهمية التي تكون ضد هضم نوكلياز الحمض النووي الريبي (RNA).يلعب circRNA دورًا مهمًا في نمو وتطور الكائنات الحية ومقاومتها للبيئة الخارجية.
يحتوي CircRNA على العديد من الوظائف، والتي يمكنها ربط miRNA بشكل تنافسي، وممارسة الوظيفة التنظيمية لـ ceRNA، لتنظيم التعبير الجيني.في السنوات الأخيرة، وجد أيضًا أنه يرتبط ارتباطًا وثيقًا بحدوث الأمراض وتطورها، وله آفاق تطبيق كبيرة في اتجاه علامات تشخيص الأمراض وما إلى ذلك.
