Rêzkirina Amplîkonê (16S/18S/ITS)

Rêzkirina Amplicon (16S/18S/ITS) bi Illumina re rêbazek analîzkirina cihêrengiya mîkrobî ye bi destnîşankirina profîlên mîkrobî li gorî rêzikên wan û dûv re hewl dide ku dewlemendiya civakê û cihêrengiya di nav her nimûneyê de û di navbera nimûneyan de şîrove bike. Xeta BMKCloud Amplicon (NGS) dihêle ku analîza genên 16S, 18S, ITS û gelek fonksiyonel were kirin. Ew bi qutkirina xwendinê, komkirina xwendina dawiya cotkirî û nirxandina kalîteyê dest pê dike, dûv re jî komkirina xwendinên wekhev ji bo çêkirina Yekîneyên Taksonomîk ên Operasyonel (OTU) ku di şeş beşên analîzê yên cûda de têne bikar anîn. Anotasyona taksonomîk agahdarî li ser pirbûna nisbî û pêkhateya her nimûneyê peyda dike, dema ku analîzên cihêrengiya alfa û beta li ser pirbûna mîkrobî di nav nimûneyan de û di navbera wan de, bi rêzê ve, disekinin. Analîza cûda di navbera koman de OTU-yên ku bi karanîna hem testên parametrîk û hem jî ne-parametrîk cûda dibin dibîne, dema ku analîza koralasyonê van cûdahiyan bi faktorên hawîrdorê ve girêdide. Di dawiyê de, pirbûna genên fonksiyonel li gorî pirbûna genên nîşanker tê pêşbînîkirin, ku têgihîştinê li ser fonksiyon û ekolojiyê di her nimûneyê de peyda dike.