Urutan Amplicon (16S/18S/ITS)

Amplicon (16S/18S/ITS) sequencing karo Illumina minangka cara kanggo nganalisa keragaman mikroba kanthi ngenali profil mikroba miturut urutane lan banjur nyoba kanggo decipher kasugihan lan keragaman komunitas ing saben sampel lan antarane conto. Pipa BMKCloud Amplicon (NGS) ngidini analisis 16S, 18S, ITS lan macem-macem gen fungsional. Diwiwiti karo maca trimming, dipasangake-mburi maca perakitan lan kualitas Assessment, ngiring dening clustering saka maca padha kanggo generate Unit Taksonomi Operasional (OTUs) digunakake ing enem bagean analisis beda. Anotasi taksonomi nyedhiyakake informasi babagan kelimpahan relatif lan komposisi saben sampel, dene analisis keragaman alpha lan beta fokus ing keragaman mikroba ing jero lan ing antarane sampel. Analisis diferensial antarane klompok nemokake OTU sing beda nggunakake tes parametrik lan non-parametrik, dene analisis korélasi nggandhengake prabédan kasebut karo faktor lingkungan. Pungkasan, kelimpahan gen fungsional diprediksi adhedhasar kelimpahan gen penanda, menehi wawasan babagan fungsi lan ekologi ing saben sampel.