Urutan Amplikon (16S/18S/ITS)

Sekuensing Amplicon (16S/18S/ITS) karo Illumina minangka metode kanggo nganalisis keragaman mikroba kanthi ngenali profil mikroba miturut urutane banjur nyoba ngurai kekayaan lan keragaman komunitas ing saben sampel lan ing antarane sampel. Pipa BMKCloud Amplicon (NGS) ngidini analisis 16S, 18S, ITS lan pirang-pirang gen fungsional. Iki diwiwiti kanthi pemangkasan maca, perakitan maca sing dipasangake lan penilaian kualitas, banjur diklompokake maca sing padha kanggo ngasilake Unit Taksonomi Operasional (OTU) sing digunakake ing enem bagean analisis sing beda. Anotasi taksonomi nyedhiyakake informasi babagan kelimpahan relatif lan komposisi saben sampel, dene analisis keragaman alfa lan beta fokus ing keragaman mikroba ing njero lan ing antarane sampel. Analisis diferensial antarane klompok nemokake OTU sing beda nggunakake tes parametrik lan non-parametrik, dene analisis korelasi nggandhengake bedane kasebut karo faktor lingkungan. Pungkasan, kelimpahan gen fungsional diprediksi adhedhasar kelimpahan gen penanda, nyedhiyakake wawasan babagan fungsi lan ekologi ing saben sampel.