Аналіз еукаріотичної мРНК (з посиланням)
На основі відомої послідовності генома та анотаційної інформації нове покоління даних високопродуктивного секвенування (RNA-Seq) використовується як вхідні дані, а також ідентифікуються нові сайти транскрипції (новий ген) і нові змінні події сплайсингу.оцінка якості даних секвенування;секвенування даних і вирівнювання послідовностей вибраного еталонного геному, ідентифікація меж екзону / інтрона, аналіз сплайсингу варіантів генів, дослідження генних ділянок і нових транскриптів, ідентифікація SNP-сайтів транскрибованої області, межа між 3' і 5 ' генів, а також функціональну анотацію та аналіз збагачення різних зразків (груп).
Довгі некодуючі РНК
Довгі некодуючі РНК (lncRNA) — це тип транскриптів довжиною понад 200 нт, які не здатні кодувати білки.Накопичені дані свідчать про те, що більшість lncRNAs, швидше за все, є функціональними.Технології високопродуктивного секвенування та інструменти біоінформаційного аналізу дають нам змогу більш ефективно виявляти послідовності lncRNA та інформацію про позиціонування та ведуть нас до відкриття lncRNA з ключовими регуляторними функціями.BMKCloud з гордістю надає нашим клієнтам платформу аналізу секвенування lncRNA для досягнення швидкого, надійного та гнучкого аналізу lncRNA.
Секвенування ампліконів 16S/18S/ITS
Платформа аналізу мікробного різноманіття розроблена на основі багаторічного досвіду аналізу проектів мікробного різноманіття, який містить стандартизований базовий аналіз і персоналізований аналіз: базовий аналіз охоплює основний зміст аналізу поточних мікробних досліджень, вміст аналізу багатий і вичерпний, а результати аналізу представлені у вигляді проектних звітів;Зміст персоналізованого аналізу різноманітний.Зразки можна відбирати, а параметри можна гнучко встановлювати відповідно до звіту про базовий аналіз і мети дослідження, щоб реалізувати персоналізовані вимоги.Операційна система Windows, проста і швидка.
Метагеноміка дробовика (NGS)
Метагеномні дані використовуються для аналізу змішаних геномних матеріалів, витягнутих із зразків навколишнього середовища, що надає детальну інформацію про різноманіття та чисельність видів, структуру популяції, філогенетичні зв’язки, функціональні гени та мережу кореляції з факторами середовища.
NGS-WGS (Illumina/BGI)
Інтегрований конвеєр аналізу, розроблений для професіоналів-дослідників без попередніх знань з біоінформатики та працює на високопродуктивному сервері.Це сприяє швидкому виконанню таких завдань, як контроль якості даних, вирівнювання послідовностей, виявлення варіацій SNP/InDel/SV, анотація та мутація гена.
GWAS
Використовуючи спеціальні статистичні методології, аналіз GWAS має на меті виявити варіації нуклеотидів у всьому геномі, пов’язані з фенотиповими відмінностями.Він відіграє вирішальну роль у дослідженні функціональних генів, пов’язаних зі складними захворюваннями людини та складними ознаками рослин і тварин.
BSA
Інтегрована платформа аналізу забезпечує зручний інтерфейс для стандартизованого та персоналізованого аналізу різноманітності.Аналіз BSA передбачає об’єднання індивідуумів із екстремальними фенотипічними ознаками із сегрегованої популяції.Порівнюючи диференціальні локуси між об’єднаними зразками, цей підхід швидко ідентифікує тісно пов’язані молекулярні маркери, пов’язані з цільовими генами.Широко використовується в генетичному картографуванні рослин і тварин, він є цінним інструментом для селекції з використанням маркерів і позиціонування генів.
Еволюційна генетика
Це інтегрований робочий процес аналізу, розроблений для професіоналів-дослідників із обмеженим досвідом у біоінформатиці.Використовуючи великий досвід BMKGENE в проектах генетичної еволюції, ця платформа працює на високопродуктивних серверах, забезпечуючи швидке та точне виконання персоналізованих аналізів.Вони охоплюють такі завдання, як побудова філогенетичного дерева, аналіз нерівноваги зв’язків, оцінка генетичного різноманіття, вибіркова ідентифікація, аналіз спорідненості, аналіз головних компонентів і характеристика структури популяції.
