●Спільний аналіз мРНК та lncrNA: Поєднуючи кількісну оцінку транскриптів мРНК з вивченням LNCRNA та їх цілями, можна отримати поглиблений огляд регуляторного механізму, що лежить в основі клітинної реакції.
●Широка експертиза: Наша команда приносить багатий досвід у кожному проекті, маючи досвід обробки понад 23 000 зразків у BMK, що охоплює різноманітні типи вибірки та проекти LNCRNA.
●Суворий контроль якості: Ми впроваджуємо основні контрольні точки на всіх етапах, від вибірки та підготовки бібліотеки до послідовності та біоінформатики. Цей ретельний моніторинг забезпечує надання постійно якісних результатів.
●Підтримка після продажу: Наше зобов’язання виходить за рамки завершення проекту з 3-місячним післяпродажним періодом. За цей час ми пропонуємо подальше спостереження за проектами, допомогу у вирішенні несправностей та сесії запитань та запитань для вирішення будь-яких запитів, пов'язаних з результатами.
Бібліотека | Платформа | Рекомендовані дані | Дані QC |
РРНК виснажена спрямована бібліотека | Illumina pe150 | 10-16 Гб | Q30≥85% |
Конц. (Ng/мкл) | Кількість (мкг) | Чистота | Цілісність |
≥ 80 | ≥ 0,8 | OD260/280 = 1,7-2,5 OD260/230 = 0,5-2,5 Обмежене або відсутність білка або забруднення ДНК, показаного на гелі. | Rin≥6,0; 5,0≥28S/18S≥1,0; обмежена або відсутність базової висоти |
● Рослини:
Корінь, стебло або пелюстка: 450 мг
Лист або насіння: 300 мг
Плід: 1,2 г
● Тварина:
Серце чи кишечник: 450 мг
Вісцера або мозок: 240 мг
М'яз: 600 мг
Кістки, волосся або шкіра: 1,5 г
● членистоноги:
Комахи: 9г
Раковина: 450 мг
● Цільна кров:2 трубки
● Клітини: 106 клітини
● Сироватка та плазма: 6 мл
Рекомендована доставка зразків
Контейнер: 2 мл центрифугової трубки (олов'яна фольга не рекомендується)
Маркування зразків: група+повторення, наприклад, A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Відвантаження:
1. Сухий погляд: зразки потрібно упакувати в мішках і закопувати в сухий льоду.
2. РНАТУРАТИВНІ ТУБИ: Зразки РНК можна сушити в трубці стабілізації РНК (наприклад, RNASTABLE®) та відправляти в кімнатну температуру.
Біоінформатика
Аналіз диференціальної експресії генів (DEG)
Кількісне визначення експресії lncRNA - кластеризація
Збагачення генів цільової цільової
Аналіз положення спільної мРНК та LNCRNA - графік CIRCOS (середнє коло - мРНК, а внутрішня cicrlce - lncrna)
Вивчіть просування, спричинені послугами рівняння LNCRNA BMKGENE через кураторську колекцію публікацій.
JI, H. та ін. (2020) "Ідентифікація, функціональне прогнозування та ключову перевірку LNCRNA щодо холодного стресу LNCRNA у печінки щурів", Наукові звіти 2020 10: 1, 10 (1), с. 1–14. doi: 10.1038/S41598-020-57451-7.
Jia, Z. та ін. (2021) 'Інтегративний транскриптомічний аналіз виявляє імунний механізм для звичайного загального штаму коропа CyHV-3, кордони в імунології, 12, с. 687151. Doi: 10.3389/fimmu.2021.687151/bibtex.
Ван, XJ та ін. (2022) "Пріоритетність багатогранної інтеграції на основі інтеграції конкуруючих мереж регуляції ендогенних РНК при раку легенів невеликих клітин: молекулярні характеристики та кандидати на наркотики", кордони в онкології, 12, с. 904865. Doi: 10.3389/fonc.2022.904865/bibtex.
Сяо, Л. та ін. (2020) "Генетична розсічення мережі генів, що лежить в основі фотосинтезу в Populus", журнал Biotechnology Plant, 18 (4), с. 1015–1026. doi: 10.1111/pbi.13270.
Чжен, Х. та ін. (2022) "Глобальна регуляторна мережа для дисрегульованої експресії генів та аномальної метаболічної сигналізації в імунних клітинах у мікросередовищі хвороби Грейвса та тиреоїдиту Хашимото", кордони в імунології, 13, с. 879824. Doi: 10.3389/fimmu.2022.879824/bibtex.