довга нелінійна РНК
Довгі некодувальні РНК (днРНК) – це РНК довжиною понад 200 нуклеотидів з низьким кодуючим потенціалом, але з критично важливими регуляторними функціями. Конвеєр днРНК BMKCloud розроблений для аналізу бібліотек, виснажених рРНК, з високоякісним, добре анотованим референсним геномом, шляхом спільного аналізу експресії днРНК та мРНК. Після обрізання зчитувань та контролю якості, зчитування вирівнюються з референсним геномом для складання транскриптів, а подальший аналіз структури генів виявляє альтернативний сплайсинг та нові гени. Транскрипти ідентифікуються як мРНК або днРНК, а аналіз диференціальної експресії ідентифікує диференціально експресовані днРНК, їх мішені та диференціально експресовані гени (DEGS). Як DEG, так і диференціально експресовані мішені днРНК функціонально анотуються для пошуку збагачених функціональних категорій.
Біоінформатика
