Метагеноміка (NGS)

Метагеноміка дробовика з Illumina – це популярний інструмент для вивчення мікробіомів шляхом безпосереднього секвенування ДНК зі складних зразків, що дозволяє вивчати як таксономічне, так і функціональне різноманіття. Конвеєр метагеноміки BMKCloud (NGS) починається з контролю якості та складання метагенома, на основі яких прогнозуються гени та кластеризуються в ненадлишкові набори даних, що анотуються за функціями та таксономією з використанням кількох баз даних. Ця інформація використовується для аналізу таксономічного різноманіття всередині вибірки (альфа-різноманіття) та між вибірками (бета-різноманіття). Диференціальний аналіз між групами виявляє OTU та біологічні функції, які відрізняються між двома групами, використовуючи як параметричні, так і непараметричні тести, тоді як кореляційний аналіз пов'язує ці відмінності з факторами навколишнього середовища.