мРНК-секвенування (NGS) з референсним геномом
RNA-seq – це стандартний інструмент у біологічних та сільськогосподарських науках, що долає розрив між геномами та протеомами. Його перевага полягає у виявленні нових транскриптів та кількісному визначенні їхньої експресії в одному аналізі. Він широко використовується для порівняльних транскриптомних досліджень, проливаючи світло на гени, пов'язані з різними ознаками або фенотипами, наприклад, порівняння мутантів з дикими типами або виявлення експресії генів за певних умов. Додаток BMKCloud mRNA(Reference) інтегрує кількісну оцінку експресії, диференціальний аналіз експресії (DEG) та аналіз структури послідовностей у біоінформатичний конвеєр mRNA-seq (NGS) та об'єднує сильні сторони аналогічного програмного забезпечення, забезпечуючи зручність та зручність використання. Користувачі можуть завантажувати свої дані RNA-seq у хмару, де додаток пропонує комплексне рішення для біоінформатичного аналізу в одному місці. Крім того, він надає пріоритет взаємодії з клієнтами, пропонуючи персоналізовані операції, адаптовані до конкретних потреб користувачів. Користувачі можуть самостійно встановлювати параметри та надсилати завдання конвеєра, перевіряти інтерактивний звіт, переглядати дані/діаграми та виконувати аналіз даних, такий як: вибір цільових генів, функціональна кластеризація, побудова діаграм тощо.
Платформа:Іллюміна, МГІ
Стратегія:РНК-секвенування
Макет: Спарені, чисті дані.
Тип бібліотеки:fr-неланцюговий, fr-перший ланцюг або fr-другий ланцюг
Довжина читання:150 п.п.
Тип файлу:*.fastq, *.fq, *.fastq.gz або *.fq.gz. Система будеавтоматично об'єднувати файли .fastq відповідно до їхніх імен,наприклад, *_1.fastq у парі з *._2.fastq.
Кількість зразків:Немає обмежень щодо кількостізразків, але час аналізу збільшуватиметься зі збільшенням кількостізразки зростають.
Рекомендований обсяг даних:6 Г на зразок
