Грибковий геном
Переваги сервісу
● Кілька стратегій секвенування доступні для різних цілей дослідження
● Має великий досвід збирання геному грибів із зібраним понад 10 000 геномів, повних пене.
● Професійна команда технічної підтримки після продажу, яка задовольняє більш конкретні дослідницькі потреби.
Специфікації послуги
| Сервіс | Стратегія секвенування | Якість гарантована | Орієнтовний час виконання |
| Грибна тонка карта | Illumina 50X+Nanopore 100X | Contig N50≥2 Mb | 35 робочих днів |
| PacBio HiFi 30X | |||
| Грибкова пена – повна карта | Illumina 50X+Nanopore 100X(Pacbio HiFi 30X)+Hi-C 100X | Коефіцієнт закріплення хромосом >90% | 45 робочих днів |
Біоінформаційні аналізи
● Контроль якості необроблених даних
● Збірка геному
● Аналіз компонентів геному
● Анотація функції гена
● Порівняльний геномний аналіз
Вимоги до зразків і доставка
Вимоги до зразків:
дляекстракти ДНК:
| Тип зразка | Сума | Концентрація | Чистота |
| екстракти ДНК | > 1,2 мкг | > 20 нг/мкл | OD260/280= 1,6-2,5 |
Для зразків тканин:
| Тип зразка | Рекомендована обробка зразка | Зберігання та транспортування зразків |
| Одноклітинний гриб | Розгляньте дріжджі під мікроскопом і зберіть їх у експоненціальній фазі Перенесіть культуру (містить приблизно 3-4,5e9 клітини) в епендорф об’ємом 1,5 або 2 мл.(Тримати на льоду) Центрифугуйте пробірку протягом 1 хв при 14000 g, щоб зібрати бактерії та обережно видаліть супернатант. Закрийте пробірку та заморозьте бактерії в рідкому азоті щонайменше на 1-3 години.Зберігайте пробірку в холодильнику -80 ℃. | Заморожуйте зразки в рідкому азоті протягом 3-4 годин і зберігайте в рідкому азоті або -80 градусів для тривалого зберігання.Потрібна доставка зразків із сухим льодом. |
| Макро Грибок | Рекомендується тканина в фазі активного росту. Промийте тканину водою, що не містить ендотоксинів, потім 70% етоналом. Зберігайте зразок у кріопробірках. |
Потік роботи служби
Доставка зразків
Будівництво бібліотеки
Секвенування
Аналіз даних
Післяпродажне обслуговування
1. Діаграма Circos на геномних компонентах грибів
2. Порівняльний геномний аналіз: Філогенетичне дерево
