Теплова карта
Файл даних матриці використовується для креслення теплової карти, яка може фільтрувати, нормалізувати та кластеризувати дані матриці.Здебільшого використовується для кластерного аналізу рівня експресії генів між різними зразками.
Анотація гена
Анотація функції гена виконується шляхом зіставлення послідовностей у файлі FASTA з різними базами даних.
Анотація гена
Базовий інструмент пошуку локального вирівнювання
CDS_UTR_Prediction
Цей інструмент призначений для прогнозування кодуючих областей (CDS) і некодуючих областей (UTR) у заданих послідовностях транскриптів на основі підривної перевірки відомої бази даних білків і передбачення ORF.
Манхеттенський сюжет
Манхеттенський графік дозволяє відображати дані з великою кількістю точок даних.Він зазвичай використовується в дослідженнях загальногеномних асоціацій (GWAS).
Circos
Діаграма CIRCOS дозволяє прямо представити розподіл SNP, InDeL, SV, CNV у геномі.
GO_Збагачення
TopGO - це інструмент, призначений для функціонального збагачення.Пакет TopGO-Bioconductor включає диференціальний аналіз експресії, аналіз збагачення GO та візуалізацію результатів.Він створить папку з виводом під назвою «Графік», яка містить результати для topGO_BP, topGO_CC і topGO_MF.
WGCNA
WGCNA — це широко використовуваний метод аналізу даних для виявлення модулів спільної експресії генів.Він застосовний до різних наборів даних про експресію, включаючи дані мікроматриць і дані про експресію генів, отримані в результаті секвенування наступного покоління.
InterProScan
Аналіз та класифікація білкової послідовності InterPro
GO_KEGG_Enrichment
Цей інструмент призначений для створення гістограми збагачення GO, гістограми збагачення KEGG і шляху збагачення KEGG на основі наданого набору генів і відповідної анотації.