Metagenomeg (NGS)

Mae metagenomeg dryll gydag Illumina yn offeryn poblogaidd ar gyfer astudio microbiomau trwy ddilyniannu DNA yn uniongyrchol o samplau cymhleth, gan alluogi astudio amrywiaeth tacsonomig a swyddogaethol. Mae piblinell metagenomig (NGS) BMKCloud yn dechrau gyda rheoli ansawdd a chydosod metagenom, lle mae genynnau'n cael eu rhagweld a'u clystyru i mewn i setiau data nad ydynt yn ddiangen sy'n cael eu hanodi ar gyfer swyddogaeth a thacsonomeg gan ddefnyddio cronfeydd data lluosog. Defnyddir y wybodaeth hon i ddadansoddi amrywiaeth tacsonomig o fewn sampl (amrywiaeth alffa) ac amrywiaeth rhwng samplau (amrywiaeth beta). Mae dadansoddiad gwahaniaethol rhwng grwpiau yn canfod OTUs a swyddogaethau biolegol sy'n wahanol rhwng y ddau grŵp gan ddefnyddio profion parametrig ac anbarametrig, tra bod dadansoddiad cydberthynas yn cysylltu'r gwahaniaethau hyn â ffactorau amgylcheddol.