Bacterial at Fungal Whole Genome Re-Sequencing
Ang bacterial at fungal whole-genome re-sequencing projects ay mahalaga para sa pagsulong ng microbial genomics sa pamamagitan ng pagpapagana ng pagkumpleto at paghahambing ng microbial genome. Pinapadali nito ang fermentation engineering, ang pag-optimize ng mga prosesong pang-industriya, at ang paggalugad ng mga pangalawang metabolismo. Higit pa rito, mahalaga ang fungal at bacterial re-sequencing para sa pag-unawa sa adaptasyon sa kapaligiran, pag-optimize ng mga strain, at pagpapakita ng genetic evolution dynamics, na may malawak na implikasyon sa medisina, agrikultura, at environmental science.
Mga Kalamangan sa Serbisyo
●Ang Bioinformatic Analysis ay may kasamang Variant Calling:Nagbibigay ng mga functional na insight sa muling pagkakasunod-sunod na mga genome.
● Malawak na Dalubhasa: Sa libu-libong microbial re-sequencing project na isinasagawa taun-taon, nagdadala kami ng higit sa isang dekada ng karanasan, isang highly skilled analysis team, komprehensibong content, at mahusay na post-sales support.
●Suporta sa Post-Sales:Ang aming pangako ay umaabot nang higit pa sa pagkumpleto ng proyekto sa isang 3-buwan na panahon ng serbisyo pagkatapos ng pagbebenta. Sa panahong ito, nag-aalok kami ng follow-up ng proyekto, tulong sa pag-troubleshoot, at mga sesyon ng Q&A upang matugunan ang anumang mga query na nauugnay sa mga resulta.
Mga Detalye ng Serbisyo
| Sequencing platform | Diskarte sa Pagsunod-sunod | Inirerekomenda ang data | Kontrol sa kalidad |
| Illumina NovaSeq | PE150 | Lalim ng 100x | Q30≥85% |
Mga Sample na Kinakailangan
| Konsentrasyon (ng/µL) | Kabuuang halaga (ng) | Dami (µL) |
| ≥1 | ≥60 | ≥20 |
Bakterya: ≥1x107 mga selula
Unicellular Fungi: ≥5x106-1x107 mga selula
Macro Fungi: ≥4g
Daloy ng Trabaho ng Serbisyo
Paghahatid ng sample
Paggawa ng aklatan
Pagsusunod-sunod
Pagsusuri ng datos
Mga serbisyo pagkatapos ng pagbebenta
Kasama ang Sumusunod na Pagsusuri:
- Sequencing Data Quality Control
- Pag-align sa Reference Genome
- Variant Calling: SNP at InDel
- Anotasyon ng Variant
Variant na pagtawag: Mga uri ng SNP
Variant na pagtawag: Pamamahagi ng haba ng InDel
Galugarin ang mga pagsulong na pinadali ng mga serbisyo ng microbial genome re-sequencing ng BMKGene sa pamamagitan ng na-curate na koleksyon ng mga publikasyon.
Jia, Y. et al. (2023) 'Pagsasama-sama ng Transcriptome at Whole Genome Re-Sequencing to Screen Disease Resistance Genes para sa Wheat Dwarf Bunt',Internasyonal na journal ng molekular na agham, 24(24). doi: 10.3390/IJMS242417356.
Jiang, M. et al. (2023) 'Ang metabolismo ng glucose na kinokontrol ng Ampicillin ay minamanipula ang paglipat mula sa pagpapaubaya sa paglaban sa bakterya',Mga Pagsulong sa Agham, 9(10). doi: 10.1126/SCIADV.ADE8582/SUPPL_FILE/SCIADV.ADE8582_SM.PDF.
Yang, M. et al. (2022) 'Aliidiomarina halalkaliphila sp. nov., isang haloalkaliphilic bacterium na nakahiwalay sa isang soda lake sa Inner Mongolia Autonomous Region, China', Int. J. Syst. Evol.Microbiol, 72, p. 5263. doi: 10.1099/ijsem.0.005263.
Zhu, Z., Wu, R. at Wang, G.-H. (2024) 'Genome sequence ng Staphylococcus nepalensis ZZ-2023a, nakahiwalay sa Nasonia vitripennis',Mga Anunsyo ng Mapagkukunan ng Microbiology. doi: 10.1128/MRA.00802-23.
