Long Non-coding Sequencing-Illumina
Mga Kalamangan sa Serbisyo
●Pinagsamang pagsusuri ng mRNA at lncRNA: sa pamamagitan ng pagsasama-sama ng quantification ng mRNA transcript sa pag-aaral ng lncRNA at ang kanilang mga target, posibleng makakuha ng malalim na pangkalahatang-ideya ng mekanismo ng regulasyon na pinagbabatayan ng cellular response.
●Malawak na Dalubhasa: Ang aming koponan ay nagdadala ng maraming karanasan sa bawat proyekto, na may track record ng pagproseso ng higit sa 23,000 mga sample sa BMK na sumasaklaw sa magkakaibang uri ng sample at mga proyekto ng lncRNA.
●Mahigpit na Kontrol sa Kalidad: Nagpapatupad kami ng mga pangunahing control point sa lahat ng yugto, mula sa paghahanda ng sample at library hanggang sa sequencing at bioinformatics. Tinitiyak ng maselang pagsubaybay na ito ang paghahatid ng patuloy na mataas na kalidad na mga resulta.
●Suporta sa Post-Sales: Ang aming pangako ay umaabot nang lampas sa pagkumpleto ng proyekto na may 3-buwan na panahon ng serbisyo pagkatapos ng pagbebenta. Sa panahong ito, nag-aalok kami ng follow-up ng proyekto, tulong sa pag-troubleshoot, at mga sesyon ng Q&A upang matugunan ang anumang mga query na nauugnay sa mga resulta.
Mga Sample na Kinakailangan at Paghahatid
| Aklatan | Plataporma | Inirerekomendang data | Data QC |
| Naubos ang direksiyon na library ng rRNA | Illumina PE150 | 10-16 Gb | Q30≥85% |
Nucleotides:
| Conc.(ng/μl) | Halaga (μg) | Kadalisayan | Integridad |
| ≥ 80 | ≥ 0.8 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Limitado o walang protina o kontaminasyon ng DNA na ipinapakita sa gel. | RIN≥6.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; limitado o walang baseline elevation |
● Mga halaman:
Root, Stem o Petal: 450 mg
Dahon o Binhi: 300 mg
Prutas: 1.2 g
● Hayop:
Puso o Bituka: 450 mg
Viscera o Utak: 240 mg
Kalamnan: 600 mg
Mga buto, Buhok o Balat: 1.5g
● Mga Arthropod:
Mga Insekto: 9g
Crustacea: 450 mg
● Buong dugo:2 tubo
● Mga cell: 106 mga selula
● Serum at Plasma: 6 ML
Inirerekomendang Paghahatid ng Sample
Lalagyan: 2 ml centrifuge tube (Hindi inirerekomenda ang tin foil)
Sample na pag-label: Pangkat+kopya hal. A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Pagpapadala:
1. Dry-ice: Ang mga sample ay kailangang ilagay sa mga bag at ibaon sa dry-ice.
2. RNAstable tubes: Ang mga sample ng RNA ay maaaring patuyuin sa RNA stabilization tube(hal. RNAstable®) at ipadala sa room temperature.
Daloy ng Trabaho ng Serbisyo
Eksperimento na disenyo
Paghahatid ng sample
Pagkuha ng RNA
Paggawa ng aklatan
Pagsusunod-sunod
Pagsusuri ng datos
Mga serbisyo pagkatapos ng pagbebenta
Bioinformatics
Pagsusuri ng Differential Gene Expression (DEGs).
Dami ng expression ng lncRNA - clustering
Pagpapayaman ng lncRNA target genes
Pinagsamang pagsusuri sa posisyon ng mRNA at lncRNA - Circos plot (gitnang bilog ay mRNA at panloob na cicrlce ay lncRNA)
Galugarin ang mga pagsulong na pinadali ng mga serbisyo ng lncRNA equencing ng BMKGene sa pamamagitan ng isang na-curate na koleksyon ng mga publikasyon.
Ji, H. et al. (2020) 'Pagkilala, paghula sa pagganap, at pangunahing pag-verify ng lncRNA ng mga lncRNA na nauugnay sa malamig na stress sa atay ng mga daga', Mga Ulat sa Siyentipiko 2020 10:1, 10(1), pp. 1–14. doi: 10.1038/s41598-020-57451-7.
Jia, Z. et al. (2021) 'Integrative Transcriptomic Analysis Reveals the Immune Mechanism for a CyHV-3-Resistant Common Carp Strain', Frontiers in Immunology, 12, p. 687151. doi: 10.3389/FIMMU.2021.687151/BIBTEX.
Wang, XJ et al. (2022) 'Multi-Omics Integration-Based Prioritization of Competing Endogenous RNA Regulation Networks in Small Cell Lung Cancer: Molecular Characteristics and Drug Candidates', Frontiers in Oncology, 12, p. 904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
Xiao, L. et al. (2020) 'Genetic dissection ng gene coexpression network na pinagbabatayan ng photosynthesis sa Populus', Plant Biotechnology Journal, 18(4), pp. 1015–1026. doi: 10.1111/PBI.13270.
Zheng, H. et al. (2022) 'Isang Global Regulatory Network para sa Dysregulated Gene Expression at Abnormal Metabolic Signaling sa Immune Cells sa Microenvironment of Graves' Disease at Hashimoto's Thyroiditis', Frontiers in Immunology, 13, p. 879824. doi: 10.3389/FIMMU.2022.879824/BIBTEX.
