mRNA-seq (NGS) na may sangguniang genome

Ang RNA-seq ay isang karaniwang kagamitan sa agham ng buhay at pananim, na nagtutugma sa agwat sa pagitan ng mga genome at proteome. Ang kalakasan nito ay nakasalalay sa pagtuklas ng mga bagong transcript at pagbibilang ng kanilang ekspresyon sa isang assay. Malawakang ginagamit ito para sa mga comparative transcriptomic studies, na nagbibigay-liwanag sa mga gene na may kaugnayan sa iba't ibang katangian o phenotype, tulad ng paghahambing ng mga mutant sa mga wild-type o pagbubunyag ng ekspresyon ng gene sa ilalim ng mga partikular na kondisyon. Isinasama ng BMKCloud mRNA (Reference) APP ang expression quantification, differential expression analysis (DEG), at sequence structure analyses sa mRNA-seq (NGS) bioinformatics pipeline at pinagsasama ang mga kalakasan ng katulad na software, na tinitiyak ang kaginhawahan at kadalian ng paggamit. Maaaring i-upload ng mga user ang kanilang RNA-seq data sa cloud, kung saan nag-aalok ang App ng komprehensibo at one-stop bioinformatic analysis solution. Bukod pa rito, inuuna nito ang karanasan ng customer, na nag-aalok ng mga personalized na operasyon na iniayon sa mga partikular na pangangailangan ng mga user. Maaaring magtakda ang mga user ng mga parameter at magsumite ng pipeline mission nang mag-isa, suriin ang interactive na ulat, tingnan ang data/diagram at kumpletuhin ang data mining, tulad ng: pagpili ng target gene, functional clustering, diagramming, atbp.