Mga produkto

Single-nucleus RNA Sequencing

Itinatampok na Larawan ng Pag-aayos ng Single-nucleus RNA

Ang advance sa single cell capturing at individual library construction technique na pinagsama sa high-throughput sequencing ay nagbibigay-daan sa pag-aaral ng gene expression sa cell-by-cell na batayan.Nagbibigay-daan ito ng mas malalim at kumpletong pagsusuri ng system sa mga kumplikadong populasyon ng cell, kung saan higit nitong iniiwasan ang pag-mask ng kanilang heterogeneity sa pamamagitan ng pagkuha ng average ng lahat ng mga cell.

Gayunpaman, ang ilang mga cell ay hindi angkop na gawin sa single-cell suspension, kaya iba pang mga sample na paraan ng paghahanda - ang nucleus extraction mula sa mga tissue ay kailangan, iyon ay, ang nucleus ay direktang kinuha mula sa mga tissue o cell at inihanda sa single-nucleus suspension para sa single- pagkakasunud-sunod ng cell.

Nagbibigay ang BMK ng 10× Genomics ChromiumTM based na single-cell RNA sequencing service.Ang serbisyong ito ay malawakang ginagamit sa mga pag-aaral sa mga pag-aaral na may kaugnayan sa sakit, tulad ng immune cell differentiation, tumor heterogeneity, tissue development, atbp.

Spatial transcriptome chip: 10× Genomics

Platform: Plataporma ng Illumina NovaSeq

Makipag-ugnayan sa amin

Mga Detalye ng Serbisyo

Bioinformatics

Mga Resulta ng Demo

Teknikal na prinsipyo

Ang paghihiwalay ng nuclei ay nakakamit ng 10× Genomics ChromiumTM, na binubuo ng eight-channel microfluidics system na may double crossings.Sa sistemang ito, ang isang gel bead na may mga barcode at primer, mga enzyme at isang solong nucleus ay naka-encapsulated sa nanoliter-sized na patak ng langis, na bumubuo ng Gel Bead-in-Emulsion (GEM).Kapag nabuo ang GEM, ang cell lysis at paglabas ng mga barcode ay isinasagawa sa bawat GEM.Ang mRNA ay na-reverse na na-transcribe sa mga molekula ng cDNA na may 10x na mga barcode at UMI, na higit pang napapailalim sa karaniwang pagkakasunud-sunod na pagtatayo ng library.

Hindi angkop ang tissue para sa paghahanda ng single cell suspension

Cell / Tissue	Dahilan
Alisin ang sariwang frozen na tissue	Hindi makakuha ng bago o matagal nang na-save na mga organisasyon
Muscle cell, Megakaryocyte, Fat…	Ang diameter ng cell ay masyadong malaki upang makapasok sa instrumento
Atay…	Masyadong marupok upang masira, hindi matukoy ang mga solong selula
Neuron cell, Utak...	Ang mas sensitibo, madaling ma-stress, ay magbabago sa mga resulta ng pagkakasunud-sunod
Pancreas, Thyroid…	Mayaman sa endogenous enzymes, na nakakaapekto sa produksyon ng solong cell suspension

Single-nucleus kumpara sa Single-cell

Single-nucleus	Isang cell
Walang limitasyong diameter ng cell	Diametro ng cell: 10-40 μm
Ang materyal ay maaaring frozen na tissue	Ang materyal ay dapat na sariwang tissue
Mababang stress ng frozen na mga cell	Ang paggamot sa enzyme ay maaaring maging sanhi ng reaksyon ng stress ng cell
Walang mga pulang selula ng dugo na kailangang alisin	Kailangang alisin ang mga pulang selula ng dugo
Ang nuklear ay nagpapahayag ng bioinformation	Ang buong cell ay nagpapahayag ng bioinformation

Mga Detalye ng Serbisyo

Aklatan

Diskarte sa pagkakasunud-sunod

Dami ng Data

Mga Sample na Kinakailangan

Tissue

10× Genomics single-nuclei library

10x Genomics -Illumina PE150

100,000 reads/cell approx.100-200 Gb

Numero ng cell: >2× 10⁵

Cell conc.sa 700-1,200 cell/μL

≥ 200 mg

Para sa higit pang mga detalye sa gabay sa paghahanda ng sample at daloy ng trabaho sa serbisyo, mangyaring huwag mag-atubiling makipag-usap sa aDalubhasa sa BMKGENE