-
Pagsusuri ng Genome-wide Association
Ang Genome-wide association study (GWAS) ay naglalayong tukuyin ang mga genetic variant (genotype) na nauugnay sa mga partikular na katangian (phenotype).Iniimbestigahan ng pag-aaral ng GWAS ang mga genetic marker na tumatawid sa buong genome ng malaking bilang ng mga indibidwal at hinuhulaan ang mga asosasyon ng genotype-phenotype sa pamamagitan ng istatistikal na pagsusuri sa antas ng populasyon.Ito ay malawakang inilapat sa pananaliksik sa mga sakit ng tao at functional gene mining sa mga kumplikadong katangian ng mga hayop o halaman.
-
Single-nucleus RNA Sequencing
Ang advance sa single cell capturing at individual library construction technique na pinagsasama ang high-throughput sequencing ay nagbibigay-daan sa pag-aaral ng gene expression sa cell-by-cell na batayan.Nagbibigay-daan ito ng mas malalim at kumpletong pagsusuri ng system sa mga kumplikadong populasyon ng cell, kung saan higit nitong iniiwasan ang pag-mask ng kanilang heterogeneity sa pamamagitan ng pagkuha ng average ng lahat ng mga cell.
Gayunpaman, ang ilang mga cell ay hindi angkop na gawin sa single-cell suspension, kaya iba pang mga sample na paraan ng paghahanda - ang nucleus extraction mula sa mga tissue ay kailangan, iyon ay, ang nucleus ay direktang kinuha mula sa mga tissue o cell at inihanda sa single-nucleus suspension para sa single- pagkakasunud-sunod ng cell.
Nagbibigay ang BMK ng 10× Genomics ChromiumTM based na single-cell RNA sequencing service.Ang serbisyong ito ay malawakang ginagamit sa mga pag-aaral sa mga pag-aaral na may kaugnayan sa sakit, tulad ng immune cell differentiation, tumor heterogeneity, tissue development, atbp.
Spatial transcriptome chip: 10× Genomics
Platform: Illumina NovaSeq 6000
-
Plant/Animal Whole Genome Sequencing
Ang buong genome re-sequencing, na kilala rin bilang WGS, ay nagbibigay-daan sa pagbubunyag ng parehong karaniwan at bihirang mutasyon sa buong genome kabilang ang Single Nucleotide Polymorphism (SNP), Insertion Deletion (InDel), Structure variation (SV), at Copy Number Variation (CNV). ).Ang mga SV ay bumubuo ng mas malaking bahagi ng base ng pagkakaiba-iba kaysa sa mga SNP at may mas malaking epekto sa genome, na may malaking epekto sa mga buhay na organismo.Nagbibigay-daan ang long-read resequencing para sa mas tumpak na pagkakakilanlan ng malalaking fragment at kumplikadong variation dahil ang mahabang pagbabasa ay ginagawang mas madali ang chromosomal crossing sa mga kumplikadong rehiyon gaya ng tandem repeats, GC/AT-rich region, at hyper-variable regions.
Platform: Illumina, PacBio, Nanopore
-
BMKMANU S1000 Spatial Transcriptome
Ang spatial na organisasyon ng mga cell ay gumaganap ng mahalagang papel sa iba't ibang biological na proseso, tulad ng immune infiltration, embryo development, atbp. Ang spatial transcriptome sequencing, na nagpapahiwatig ng gene expression profiling habang pinapanatili ang impormasyon ng spatial na posisyon, ay nagbibigay ng mahusay na mga insight sa transcriptome-level tissue architecture.Sa pag-unlad ng teknolohiya, ang ultra-clear na morpolohiya ng tissue at ang tunay na pagkakaiba-iba ng istruktura ng spatial molecular expression ay kailangang pag-aralan nang may mas mataas na resolusyon.Nagbibigay ang BMKGENE ng komprehensibo, one-stop na spatial transcriptome sequencing na serbisyo mula sa mga sample hanggang sa mga biological na insight.
Ang mga teknolohiyang spatial transcriptomics ay nagbigay ng kapangyarihan sa mga nobelang pananaw sa magkakaibang arena ng pananaliksik sa pamamagitan ng paglutas ng profile ng expression ng gene na may spatial na nilalaman sa mga heterogenous na sample.
Spatial transcriptome chip: BMKMANU S1000
Platform: Illumina NovaSeq 6000
-
10x Genomics Visium Spatial Transcriptome
Ang Visium Spatial Gene Expression ay isang mainstream na spatial transcriptome sequencing na teknolohiya para sa pag-uuri ng tissue batay sa kabuuang mRNA.I-map ang buong transcriptome na may morphological na konteksto upang tumuklas ng mga nobelang insight sa normal na pag-unlad, patolohiya ng sakit, at klinikal na pananaliksik sa pagsasalin.Nagbibigay ang BMKGENE ng komprehensibo, one-stop na spatial transcriptome sequencing na serbisyo mula sa mga sample hanggang sa mga biological na insight.
Ang mga teknolohiya ng spatial transcriptomics ay nagbigay ng kapangyarihan sa mga nobelang pananaw sa magkakaibang arena ng pananaliksik sa pamamagitan ng paglutas ng profile ng expression ng gene na may spatial na nilalaman sa mga heterogenous na sample.
Spatial transcriptome chip: 10x Genomics Visium
Platform:Illumina NovaSeq 6000
-
Full-Length mRNA Sequencing-Nanopore
Ang RNA sequencing ay naging isang napakahalagang tool para sa komprehensibong pagsusuri ng transcriptome.Walang alinlangan, nakamit ng tradisyonal na short-read sequencing ang maraming mahalagang pag-unlad dito.Gayunpaman, madalas itong nakatagpo ng mga limitasyon sa buong haba ng mga pagkakakilanlan ng isoform, dami, bias ng PCR.
Ang pagkakasunud-sunod ng nanopore ay nakikilala ang sarili nito mula sa iba pang mga platform ng pagkakasunud-sunod, dahil ang mga nucleotide ay direktang binabasa nang walang synthesis ng DNA at bumubuo ng mahabang pagbasa sa sampu-sampung kilobases.Nagbibigay ito ng kapangyarihan sa direktang read-out na pagtawid sa mga full-length na transcript at pagharap sa mga hamon sa mga pag-aaral sa antas ng isoform.
Platform：Nanopore PromethION
Library:cDNA-PCR
-
Full-length mRNA sequencing -PacBio
De novofull-length transcriptome sequencing, na kilala rin bilangDe novoKinukuha ng Iso-Seq ang mga bentahe ng PacBio sequencer sa haba ng pagbasa, na nagbibigay-daan sa pagkakasunud-sunod ng buong-haba na mga molekula ng cDNA nang walang anumang mga break.Ito ay ganap na nag-iwas sa anumang mga error na nabuo sa mga hakbang sa pagpupulong ng transcript at bumubuo ng mga unigene set na may resolusyon sa antas ng isoform.Ang unigene set na ito ay nagbibigay ng makapangyarihang genetic na impormasyon bilang "reference genome" sa transcriptome-level.Bilang karagdagan, kasama ang susunod na henerasyong data ng sequencing, binibigyang kapangyarihan ng serbisyong ito ang isang tumpak na dami ng pagpapahayag sa antas ng isoform.
Platform: PacBio Sequel IIAklatan: SMRT bell library -
Eukaryotic mRNA Sequencing-Illumina
Ang pagkakasunud-sunod ng mRNA ay nagbibigay-daan sa pag-profile ng lahat ng mRNA na na-transcript mula sa mga cell sa ilalim ng mga partikular na kondisyon.Ito ay isang makapangyarihang teknolohiya para sa pagbubunyag ng profile ng expression ng gene, mga istruktura ng gene at mga mekanismo ng molekular ng ilang biological na proseso.Sa ngayon, ang pagkakasunud-sunod ng mRNA ay malawakang ginagamit sa pangunahing pananaliksik, klinikal na diagnostic, pag-unlad ng gamot, atbp.
Platform: Illumina NovaSeq 6000
-
Non-Reference based mRNA Sequencing-Illumina
Ang mRNA sequencing ay gumagamit ng next-generation sequencing technique (NGS) para makuha ang messenger RNA(mRNA) form na Eukaryote sa partikular na panahon kung saan ina-activate ang ilang espesyal na function.Ang pinakamahabang transcript spliced ay tinawag na 'Unigene' at ginamit bilang reference sequence para sa kasunod na pagsusuri, na isang epektibong paraan upang pag-aralan ang molekular na mekanismo at regulatory network ng mga species nang walang reference.
Pagkatapos ng transcriptome data assembly at unigene functional annotation
(1)SSR analysis, CDS prediction at gene structure ay preformed.
(2) Ang dami ng unigene expression sa bawat sample ay isasagawa.
(3) Matutuklasan ang pagkakaiba-iba na ipinahayag na mga unigene sa pagitan ng mga sample (o grupo) batay sa unigene expression
(4) Isasagawa ang clustering, functional annotation at enrichment analysis ng differentially expressed unigenes
-
Mahabang non-coding sequencing-Illumina
Ang mga long non-coding RNAs (lncRNAs) ay isang uri ng mga molekula ng RNA na may haba na higit sa 200 nt, na nailalarawan sa pamamagitan ng napakababang potensyal na pag-coding.Ang LncRNA, bilang pangunahing miyembro sa mga non-coding na RNA, ay pangunahing matatagpuan sa nucleus at plasma.Ang pag-unlad sa teknolohiya ng pagkakasunud-sunod at bioinformtics ay nagbibigay-daan sa pagkilala sa maraming mga nobelang lncRNA at iugnay ang mga may biological function.Ang mga naipon na ebidensya ay nagmumungkahi na ang lncRNA ay malawak na kasangkot sa epigenetic regulation, transcription regulation at post-transcription regulation.
