Mga produkto

Pagsusuri ng Genome-wide Association

Tinatampok na Larawan ng Pagsusuri ng Asosasyon sa buong Genome

Ang Genome-wide association study (GWAS) ay naglalayong tukuyin ang mga genetic variant (genotype) na nauugnay sa mga partikular na katangian (phenotype).Iniimbestigahan ng pag-aaral ng GWAS ang mga genetic marker na tumatawid sa buong genome ng malaking bilang ng mga indibidwal at hinuhulaan ang mga asosasyon ng genotype-phenotype sa pamamagitan ng istatistikal na pagsusuri sa antas ng populasyon.Ito ay malawakang inilapat sa pananaliksik sa mga sakit ng tao at functional gene mining sa mga kumplikadong katangian ng mga hayop o halaman.

Makipag-ugnayan sa amin

Mga Detalye ng Serbisyo

Resulta ng Demo

Itinatampok na Publication

1.Mga Kalamangan sa Serbisyo

● Masaganang Kaso ng Proyekto: mula nang itatag ito noong 2009, natapos na ng BMKGENE ang daan-daang proyekto ng mga species sa pagsasaliksik ng populasyon ng GWAS, tinulungan ang mga mananaliksik na mag-publish ng higit sa 100 artikulo, at ang pinagsama-samang impact factor ay umabot sa 500.
● Mga propesyonal na analyst.
● Maikling ikot ng pagsusuri.
● Tumpak na data mining.

2. Mga Detalye ng Serbisyo

Uri	Skala ng Populasyon	Diskarte sa pagkakasunud-sunod at lalim
SLAF-GWAS	Halimbawang numero ≥200	Laki ng genome < 400M, na may ref-genome, inirerekomenda ang WGS
		Laki ng genome ≤ 1G, 100K Tag at 10X
		1G ≤ Laki ng genome ≤ 2G, 200K Tag at 10X
		Laki ng genome > 2G, 300K Tag at 10X
WGS-GWAS	Halimbawang numero ≥200	10X para sa bawat sample

3. Pagpili ng Materyal

Iba't ibang uri, subspecies, landrace/genebanks/mixed family/wild resources

Iba't ibang uri, subspecies, landraces

Half-sib family/full-sib family/wild resources

4. Pagsusuri ng Bioinformation

● Pagsusuri ng asosasyon sa buong genome
● Pagsusuri at pag-screen ng makabuluhang SNP
● Functional na anotasyon ng gene ng kandidato

5. Daloy ng Trabaho sa Serbisyo

Eksperimento na disenyo

Paghahatid ng sample

Pagkuha ng RNA

Paggawa ng aklatan

Pagsusunod-sunod

Pagsusuri sa datos

Mga serbisyo pagkatapos ng pagbebenta

Nakaraan: Single-nucleus RNA Sequencing

Susunod:

a.Phenotype QC

Histogram ng pamamahagi ng dalas

Mga istatistika ng phenotype

b.Pagsusuri ng asosasyon (Modelo: GEMMA, FaST-LMM, EMMAX)

Plot ng QQ

Plot ng Manhattan

taon	Talaarawan	IF	Pamagat
2022	NC	17.69	Genomic na batayan ng giga-chromosome at giga-genome ng tree peony Paeonia ostii
2015	NP	7.43	Domestication footprints anchor genomic rehiyon ng agronomic kahalagahan sa soybeans
2018	MP	9.32	Ang whole-genome resequencing ng isang pandaigdigang koleksyon ng mga rapeseed accession ay nagpapakita ng genetic na batayan ng kanilang ecotype divergence
2022	HR	7.29	Ang pagsusuri ng asosasyon sa buong genome ay nagbibigay ng mga molecular insight sa natural na pagkakaiba-iba ng laki ng buto ng pakwan