Pagsunod-sunod ng Maliit na RNA-Illumina
Mga Tampok
● Paghahanda sa library para sa pagpili ng laki.
● Ang pagsusuring bioinformatic ay nakasentro sa prediksyon at mga target ng miRNA.
Mga Kalamangan sa Serbisyo
●Malawak na KadalubhasaanMahigit 300 sample na ang aming naproseso, na sumasaklaw sa iba't ibang uri ng sample. Dala namin ang kayamanan ng kadalubhasaan sa bawat proyekto.
●Mahigpit na Kontrol sa KalidadNagpapatupad kami ng mga pangunahing control point sa lahat ng yugto, mula sa paghahanda ng sample hanggang sa paghahanda ng library, sequencing, at bioinformatics. Tinitiyak ng aming masusing pagsubaybay ang paghahatid ng pare-parehong mataas na kalidad na mga resulta.
●Komprehensibong pagsusuri ng bioinformatics:Nagbibigay-daan ito sa pagtukoy ng parehong kilala at nobelang miRNA, pagtukoy ng mga target ng miRNA, at kaukulang functional annotation at pagpapayaman gamit ang maraming database (KEGG, GO).
●Suporta Pagkatapos ng PagbebentaNauunawaan namin kung gaano kahalaga ang pagiging presente, kaya naman ang aming pangako ay higit pa sa pagkumpleto ng proyekto na may 3-buwang serbisyo pagkatapos ng benta. Sa panahong ito, nag-aalok kami ng follow-up ng proyekto, tulong sa pag-troubleshoot, at mga sesyon ng Q&A upang matugunan ang anumang mga katanungan na may kaugnayan sa mga resulta.
Mga Kinakailangan sa Halimbawa at Paghahatid
| Aklatan | Plataporma | Inirerekomendang datos | QC ng Datos |
| Napiling laki | Illumina SE50 | 10M-20M na pagbasa | Q30≥85% |
Mga Kinakailangan sa Halimbawa:
Mga Nukleotida:
| Konklusyon (ng/μl) | Dami (μg) | Kadalisayan | Integridad |
| ≥ 80 | ≥ 0.8 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Limitado o walang kontaminasyon ng protina o DNA na ipinapakita sa gel. | RIN≥6.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; limitado o walang baseline elevation |
● Mga Halaman:
Ugat, Tangkay o Talulot: 450 mg
Dahon o Buto: 300 mg
Prutas: 1.2 g
● Hayop:
Puso o Bituka: 450 mg
Laman-loob o Utak: 240 mg
Kalamnan: 600 mg
Buto, Buhok o Balat: 1.5g
● Mga Arthropod:
Mga Insekto: 9g
Mga krustaseo: 450 mg
● Buong dugo: 2 tubo
● Mga Selula: 106 mga selula
● Serum at Plasma:6 mL
Inirerekomendang Paghahatid ng Sample
Lalagyan: 2 ml na tubo ng centrifuge (Hindi inirerekomenda ang tin foil)
Halimbawang paglalagay ng label: Grupo+ulitin hal. A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Padala:
1. Dry-ice: Ang mga sample ay kailangang ilagay sa mga supot at ibaon sa dry-ice.
2. Mga tubo na RNAstable: Ang mga sample ng RNA ay maaaring patuyuin sa tubo na nagpapatatag ng RNA (hal. RNAstable®) at ipadala sa temperatura ng silid.
Daloy ng Trabaho sa Serbisyo
Disenyo ng eksperimento
Paghahatid ng halimbawa
Pagkuha ng RNA
Pagtatayo ng aklatan
Pagsunod-sunod
Pagsusuri ng datos
Mga serbisyo pagkatapos ng benta
Bioinformatika
● Kontrol sa kalidad ng hilaw na datos
● Klasipikasyon ng maliliit na RNA
● pagsusuri ng ekspresyon ng miRNA at pagkakaiba-iba ng ekspresyon
● miRNA target gene at anotasyon ng miRNA target gene na may magkakaibang pagpapahayag
● Anotasyon ng target na gene at pagpapayaman ng tungkulin ng miRNA gene na may magkakaibang pagpapahayag
Pagkilala sa miRNA: istruktura at lalim
Differential expression ng miRNA – hiearchical clustering
Functional annotation ng target ng mga miRNA na naiiba ang ipinahayag
Galugarin ang mga pagsulong sa pananaliksik na pinadali ng mga serbisyo ng sRNA sequencing ng BMKGene sa pamamagitan ng isang napiling koleksyon ng mga publikasyon.
Chen, H. et al. (2023) 'Pinipigilan ng mga impeksyon sa virus ang biosynthesis at photosynthesis ng saponin sa Panax notoginseng',Pisyolohiya at Biokemistri ng Halaman, 203, p. 108038. doi: 10.1016/J.PLAPHY.2023.108038.
Li, H. et al. (2023) 'Ang protina na FREE1 na naglalaman ng FYVE domain ng halaman ay nakikipag-ugnayan sa mga bahagi ng microprocessor upang pigilan ang miRNA biogenesis',Mga ulat ng EMBO, 24(1). doi: 10.15252/EMBR.202255037/SUPPL_FILE/EMBR202255037-SUP-0004-SDATAFIG4.TIF.
Yu, J. et al. (2023) 'Kinokontrol ng MicroRNA Ame-Bantam-3p ang Pag-unlad ng Pupa ng Larval sa pamamagitan ng Pag-target sa Multiple Epidermal Growth Factor-like Domains 8 Gene (megf8) sa Pukyutan, Apis mellifera',Pandaigdigang Dyornal ng mga Agham Molekular, 24(6), p. 5726. doi: 10.3390/IJMS24065726/S1.
Zhang, M. et al. (2018) 'Pinagsamang Pagsusuri ng MiRNA at mga Gene na Kaugnay ng Kalidad ng Karne ay Nagpapakita na ang Gga-MiR-140-5p ay Nakakaapekto sa Intramuscular Fat Deposition sa mga Manok',Pisyolohiya ng Selula at Biyokimika, 46(6), pp. 2421–2433. doi: 10.1159/000489649.
